MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020062	CCG	2	6	363270	363275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223282
7502	NC_020062	GAT	2	6	363338	363343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223282
7503	NC_020062	CGA	2	6	363355	363360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223282
7504	NC_020062	GCC	2	6	363362	363367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223282
7505	NC_020062	CTG	2	6	363460	363465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223282
7506	NC_020062	TCC	2	6	363483	363488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223282
7507	NC_020062	TCC	2	6	363509	363514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7508	NC_020062	GT	4	8	363536	363543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_020062	TTCGA	2	10	363767	363776	20 %	40 %	20 %	20 %	440223283
7510	NC_020062	AGA	2	6	363786	363791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223283
7511	NC_020062	GGC	2	6	363932	363937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223284
7512	NC_020062	GAA	2	6	363979	363984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223284
7513	NC_020062	CG	3	6	363990	363995	0 %	0 %	50 %	50 %	440223284
7514	NC_020062	CAGG	2	8	364067	364074	25 %	0 %	50 %	25 %	440223284
7515	NC_020062	GAT	2	6	364088	364093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223284
7516	NC_020062	GAG	2	6	364115	364120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_020062	CAT	2	6	364121	364126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_020062	TTCC	2	8	364150	364157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_020062	CGC	2	6	364272	364277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_020062	ATC	2	6	364278	364283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_020062	TAT	2	6	364574	364579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223285
7522	NC_020062	GCG	2	6	364600	364605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7523	NC_020062	GCAG	2	8	364671	364678	25 %	0 %	50 %	25 %	440223285
7524	NC_020062	GGCG	2	8	364775	364782	0 %	0 %	75 %	25 %	440223285
7525	NC_020062	GTC	2	6	364791	364796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223285
7526	NC_020062	GTC	2	6	364833	364838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223285
7527	NC_020062	GCG	2	6	364928	364933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7528	NC_020062	GCCG	2	8	364952	364959	0 %	0 %	50 %	50 %	440223285
7529	NC_020062	GC	3	6	365115	365120	0 %	0 %	50 %	50 %	440223285
7530	NC_020062	CGA	2	6	365164	365169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223285
7531	NC_020062	CGG	2	6	365192	365197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7532	NC_020062	ACCG	2	8	365310	365317	25 %	0 %	25 %	50 %	440223285
7533	NC_020062	GC	4	8	365364	365371	0 %	0 %	50 %	50 %	440223285
7534	NC_020062	CCG	2	6	365466	365471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223285
7535	NC_020062	CACG	2	8	365480	365487	25 %	0 %	25 %	50 %	440223285
7536	NC_020062	CAC	2	6	365507	365512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223285
7537	NC_020062	GAG	2	6	365574	365579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223285
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7539	NC_020062	CGG	2	6	365621	365626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7540	NC_020062	GAG	2	6	365672	365677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223285
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7542	NC_020062	TGC	2	6	365744	365749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223285
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7544	NC_020062	ATG	2	6	365793	365798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223285
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7546	NC_020062	CGG	2	6	365821	365826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7547	NC_020062	ATCGTC	2	12	365847	365858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440223285
7548	NC_020062	CGG	2	6	365969	365974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223285
7549	NC_020062	CGA	2	6	365999	366004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223285
7550	NC_020062	AATCGC	2	12	366033	366044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223285
7551	NC_020062	GTC	2	6	366177	366182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_020062	TTC	2	6	366201	366206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_020062	TGCT	2	8	366217	366224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7554	NC_020062	TCT	2	6	366248	366253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223286
7555	NC_020062	CGG	2	6	366300	366305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223286
7556	NC_020062	GC	3	6	366324	366329	0 %	0 %	50 %	50 %	440223286
7557	NC_020062	CGAG	2	8	366365	366372	25 %	0 %	50 %	25 %	440223286
7558	NC_020062	CTCCG	2	10	366394	366403	0 %	20 %	20 %	60 %	440223286
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7562	NC_020062	ACT	2	6	366599	366604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223287
7563	NC_020062	TCGCG	2	10	366616	366625	0 %	20 %	40 %	40 %	440223287
7564	NC_020062	TCG	2	6	366627	366632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223287
7565	NC_020062	ATT	2	6	366772	366777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223287
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7567	NC_020062	TGG	2	6	366852	366857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223287
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7569	NC_020062	CTG	2	6	366966	366971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223287
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7573	NC_020062	TGT	2	6	367088	367093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_020062	GCC	2	6	367123	367128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7576	NC_020062	CGG	2	6	367170	367175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223288
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7589	NC_020062	CCG	2	6	367677	367682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223288
7590	NC_020062	CGA	2	6	367698	367703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223288
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7594	NC_020062	GGCC	2	8	368062	368069	0 %	0 %	50 %	50 %	440223288
7595	NC_020062	CGC	2	6	368080	368085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223288
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7600	NC_020062	CGA	2	6	368160	368165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223288
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7602	NC_020062	GAC	2	6	368185	368190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223288
7603	NC_020062	GCCA	2	8	368228	368235	25 %	0 %	25 %	50 %	440223288
7604	NC_020062	AAGG	2	8	368305	368312	50 %	0 %	50 %	0 %	440223288
7605	NC_020062	TC	3	6	368352	368357	0 %	50 %	0 %	50 %	440223288
7606	NC_020062	GCT	2	6	368551	368556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223289
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7613	NC_020062	ATCTC	2	10	368735	368744	20 %	40 %	0 %	40 %	440223289
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7620	NC_020062	GAC	2	6	369031	369036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223289
7621	NC_020062	ACG	2	6	369125	369130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_020062	GTC	2	6	369152	369157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_020062	TCT	2	6	369206	369211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223290
7624	NC_020062	CAT	2	6	369264	369269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223290
7625	NC_020062	CTC	2	6	369369	369374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223290
7626	NC_020062	ACG	2	6	369379	369384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223290
7627	NC_020062	CGA	2	6	369408	369413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223290
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7642	NC_020062	TCC	2	6	370208	370213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7643	NC_020062	TCA	2	6	370275	370280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223291
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7655	NC_020062	GCC	2	6	370762	370767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223291
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7678	NC_020062	CGG	2	6	371853	371858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7679	NC_020062	CGCTC	2	10	371923	371932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7680	NC_020062	CTG	2	6	371938	371943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7681	NC_020062	CG	3	6	372019	372024	0 %	0 %	50 %	50 %	440223293
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7730	NC_020062	GGCTCG	2	12	373897	373908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223295
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7732	NC_020062	TCG	2	6	373953	373958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7733	NC_020062	GAT	2	6	373977	373982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7734	NC_020062	ATGCG	2	10	374018	374027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7735	NC_020062	C	6	6	374064	374069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7736	NC_020062	TCG	2	6	374107	374112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223296
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