MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020062	GCC	2	6	340135	340140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223262
7002	NC_020062	CTC	2	6	340149	340154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223262
7003	NC_020062	CGA	2	6	340163	340168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223262
7004	NC_020062	CAG	2	6	340182	340187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223262
7005	NC_020062	AGC	2	6	340264	340269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223262
7006	NC_020062	GCC	2	6	340308	340313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223262
7007	NC_020062	CAG	2	6	340332	340337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223262
7008	NC_020062	GCC	2	6	340352	340357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223262
7009	NC_020062	CGGC	2	8	340409	340416	0 %	0 %	50 %	50 %	440223262
7010	NC_020062	CGA	2	6	340514	340519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223262
7011	NC_020062	TCC	2	6	340555	340560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223262
7012	NC_020062	GAA	2	6	340605	340610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223262
7013	NC_020062	GGCC	2	8	340649	340656	0 %	0 %	50 %	50 %	440223262
7014	NC_020062	CTC	2	6	340708	340713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223263
7015	NC_020062	TTC	2	6	340714	340719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223263
7016	NC_020062	GC	3	6	340722	340727	0 %	0 %	50 %	50 %	440223263
7017	NC_020062	GAC	2	6	340763	340768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7018	NC_020062	AGCACG	2	12	340773	340784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7019	NC_020062	ATG	2	6	340836	340841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223263
7020	NC_020062	GCC	3	9	340874	340882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223263
7021	NC_020062	CGA	2	6	340891	340896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7022	NC_020062	AGC	2	6	340929	340934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7023	NC_020062	GAT	2	6	340973	340978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223263
7024	NC_020062	GCT	2	6	341019	341024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7025	NC_020062	CTC	2	6	341033	341038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223263
7026	NC_020062	ACC	2	6	341109	341114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223263
7027	NC_020062	AAAG	2	8	341263	341270	75 %	0 %	25 %	0 %	440223263
7028	NC_020062	GCCA	2	8	341391	341398	25 %	0 %	25 %	50 %	440223263
7029	NC_020062	GAC	2	6	341448	341453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7030	NC_020062	GACCA	2	10	341490	341499	40 %	0 %	20 %	40 %	440223263
7031	NC_020062	GCA	2	6	341556	341561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223263
7032	NC_020062	GCTTG	2	10	341575	341584	0 %	40 %	40 %	20 %	440223263
7033	NC_020062	GAA	2	6	341673	341678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223264
7034	NC_020062	CGGA	2	8	341705	341712	25 %	0 %	50 %	25 %	440223264
7035	NC_020062	TCG	2	6	341725	341730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223264
7036	NC_020062	CTG	2	6	341754	341759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223264
7037	NC_020062	TCA	2	6	341804	341809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223264
7038	NC_020062	GC	3	6	341825	341830	0 %	0 %	50 %	50 %	440223264
7039	NC_020062	CTT	2	6	341880	341885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223264
7040	NC_020062	GAAGGA	2	12	341976	341987	50 %	0 %	50 %	0 %	440223264
7041	NC_020062	TGA	2	6	342119	342124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223264
7042	NC_020062	CGT	2	6	342137	342142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223264
7043	NC_020062	CGC	2	6	342156	342161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223264
7044	NC_020062	TCT	2	6	342206	342211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223264
7045	NC_020062	CAG	2	6	342288	342293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223264
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7049	NC_020062	GC	3	6	342470	342475	0 %	0 %	50 %	50 %	440223264
7050	NC_020062	GA	3	6	342482	342487	50 %	0 %	50 %	0 %	440223264
7051	NC_020062	CAT	2	6	342566	342571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223264
7052	NC_020062	CTGA	2	8	342591	342598	25 %	25 %	25 %	25 %	440223264
7053	NC_020062	CGG	2	6	342642	342647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223264
7054	NC_020062	GCT	2	6	342685	342690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223264
7055	NC_020062	GAC	2	6	342750	342755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223264
7056	NC_020062	AGG	2	6	342788	342793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223264
7057	NC_020062	TCA	2	6	342794	342799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223264
7058	NC_020062	AGT	2	6	343071	343076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223265
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7060	NC_020062	TCG	2	6	343152	343157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223265
7061	NC_020062	CGG	2	6	343168	343173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223265
7062	NC_020062	GAT	2	6	343205	343210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223265
7063	NC_020062	CGA	2	6	343231	343236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223265
7064	NC_020062	GAT	2	6	343262	343267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223265
7065	NC_020062	CAG	2	6	343310	343315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223265
7066	NC_020062	CAG	2	6	343319	343324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223265
7067	NC_020062	CG	3	6	343333	343338	0 %	0 %	50 %	50 %	440223265
7068	NC_020062	GAGC	2	8	343372	343379	25 %	0 %	50 %	25 %	440223265
7069	NC_020062	GGC	2	6	343400	343405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223265
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7072	NC_020062	GAT	2	6	343562	343567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223265
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7078	NC_020062	GAT	2	6	343811	343816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223265
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7080	NC_020062	AAT	2	6	343960	343965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_020062	TAG	2	6	344016	344021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_020062	T	7	7	344030	344036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7086	NC_020062	AGC	2	6	344284	344289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223266
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7088	NC_020062	GCTC	2	8	344365	344372	0 %	25 %	25 %	50 %	440223266
7089	NC_020062	TGA	2	6	344449	344454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223266
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7093	NC_020062	CGGT	2	8	344564	344571	0 %	25 %	50 %	25 %	440223266
7094	NC_020062	CGG	2	6	344819	344824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223266
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7102	NC_020062	AAGC	2	8	345149	345156	50 %	0 %	25 %	25 %	440223266
7103	NC_020062	CAT	2	6	345252	345257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_020062	CAGG	2	8	345393	345400	25 %	0 %	50 %	25 %	440223267
7105	NC_020062	CGGA	2	8	345406	345413	25 %	0 %	50 %	25 %	440223267
7106	NC_020062	CAT	2	6	345435	345440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223267
7107	NC_020062	GCCGC	2	10	345464	345473	0 %	0 %	40 %	60 %	440223267
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7114	NC_020062	TTC	2	6	345950	345955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_020062	AAT	2	6	345989	345994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_020062	GAT	2	6	346050	346055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_020062	GC	3	6	346185	346190	0 %	0 %	50 %	50 %	440223269
7118	NC_020062	GA	3	6	346207	346212	50 %	0 %	50 %	0 %	440223269
7119	NC_020062	CGA	2	6	346226	346231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223269
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7121	NC_020062	GCG	2	6	346423	346428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223269
7122	NC_020062	CGA	2	6	346433	346438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223269
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7143	NC_020062	GTTG	2	8	347106	347113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7162	NC_020062	CAGC	2	8	348349	348356	25 %	0 %	25 %	50 %	440223271
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7239	NC_020062	GTC	2	6	351614	351619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223274
7240	NC_020062	AGC	2	6	351818	351823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7241	NC_020062	ATG	2	6	351852	351857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_020062	CTT	2	6	352075	352080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223275
7243	NC_020062	CCA	2	6	352128	352133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223275
7244	NC_020062	GAAC	2	8	352153	352160	50 %	0 %	25 %	25 %	440223275
7245	NC_020062	TCTG	2	8	352170	352177	0 %	50 %	25 %	25 %	440223275
7246	NC_020062	TCG	2	6	352188	352193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223275
7247	NC_020062	CCAT	2	8	352210	352217	25 %	25 %	0 %	50 %	440223275
7248	NC_020062	TCA	2	6	352245	352250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223275
7249	NC_020062	TTC	2	6	352283	352288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223275
7250	NC_020062	TGA	2	6	352299	352304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223275
7251	NC_020062	CGC	2	6	352378	352383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223275
7252	NC_020062	GGA	2	6	352420	352425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223275
7253	NC_020062	GGTG	2	8	352468	352475	0 %	25 %	75 %	0 %	440223275
7254	NC_020062	AATTG	2	10	352477	352486	40 %	40 %	20 %	0 %	440223275
7255	NC_020062	GAAA	2	8	352560	352567	75 %	0 %	25 %	0 %	440223275
7256	NC_020062	GAA	2	6	352594	352599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223275
7257	NC_020062	CG	3	6	352615	352620	0 %	0 %	50 %	50 %	440223275
7258	NC_020062	GC	3	6	352659	352664	0 %	0 %	50 %	50 %	440223275
7259	NC_020062	CTT	2	6	352696	352701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7260	NC_020062	ATC	2	6	352703	352708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7261	NC_020062	ATA	2	6	352759	352764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223276
7262	NC_020062	GTA	2	6	352804	352809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223276
7263	NC_020062	CTG	2	6	352828	352833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223276
7264	NC_020062	CGG	2	6	352834	352839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223276
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7267	NC_020062	CCCGT	2	10	352909	352918	0 %	20 %	20 %	60 %	440223276
7268	NC_020062	TG	3	6	353002	353007	0 %	50 %	50 %	0 %	440223276
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7270	NC_020062	GAC	2	6	353053	353058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223276
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7272	NC_020062	GAC	2	6	353086	353091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223276
7273	NC_020062	ATC	2	6	353189	353194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223276
7274	NC_020062	CAGA	2	8	353263	353270	50 %	0 %	25 %	25 %	440223276
7275	NC_020062	GCA	2	6	353280	353285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223276
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7300	NC_020062	CTG	2	6	354259	354264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223276
7301	NC_020062	ATGG	2	8	354347	354354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7302	NC_020062	AGC	2	6	354436	354441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7303	NC_020062	TCAT	2	8	354464	354471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7304	NC_020062	CAT	2	6	354489	354494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7305	NC_020062	AAT	2	6	354516	354521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7306	NC_020062	CAA	2	6	354561	354566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7307	NC_020062	ATGT	2	8	354624	354631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7308	NC_020062	T	7	7	354807	354813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7309	NC_020062	GCT	2	6	354816	354821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7310	NC_020062	CTG	2	6	354933	354938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223277
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7317	NC_020062	TGA	2	6	355408	355413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223278
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7325	NC_020062	GCTG	2	8	355982	355989	0 %	25 %	50 %	25 %	440223278
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7343	NC_020062	ATCG	2	8	356769	356776	25 %	25 %	25 %	25 %	440223279
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7350	NC_020062	GCTCG	2	10	356967	356976	0 %	20 %	40 %	40 %	440223279
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7355	NC_020062	ATG	2	6	357252	357257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223279
7356	NC_020062	GCAGA	2	10	357354	357363	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7357	NC_020062	TTG	2	6	357392	357397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7358	NC_020062	CGCA	2	8	357412	357419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7359	NC_020062	CA	3	6	357418	357423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7360	NC_020062	GCC	2	6	357595	357600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7361	NC_020062	ACGTC	2	10	357611	357620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7362	NC_020062	ACT	2	6	357667	357672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223280
7363	NC_020062	GCC	2	6	357729	357734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223280
7364	NC_020062	CAT	2	6	357820	357825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223280
7365	NC_020062	CAT	2	6	357844	357849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223280
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7367	NC_020062	GCG	2	6	357899	357904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223280
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7425	NC_020062	TGAT	2	8	360352	360359	25 %	50 %	25 %	0 %	440223281
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7444	NC_020062	CGT	2	6	361145	361150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223281
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7457	NC_020062	GTAT	2	8	361579	361586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7459	NC_020062	ATGT	2	8	361627	361634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7460	NC_020062	TAA	2	6	361635	361640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7461	NC_020062	AGTA	2	8	361660	361667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7462	NC_020062	CTG	2	6	361791	361796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7463	NC_020062	CAG	2	6	361876	361881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7467	NC_020062	CGTTC	2	10	362118	362127	0 %	40 %	20 %	40 %	440223282
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7482	NC_020062	GC	3	6	362633	362638	0 %	0 %	50 %	50 %	440223282
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7484	NC_020062	CCG	2	6	362680	362685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223282
7485	NC_020062	ATG	2	6	362706	362711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223282
7486	NC_020062	GAT	2	6	362726	362731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223282
7487	NC_020062	CGC	2	6	362732	362737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223282
7488	NC_020062	TCA	2	6	362797	362802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223282
7489	NC_020062	GAT	3	9	362849	362857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223282
7490	NC_020062	TGG	2	6	362884	362889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223282
7491	NC_020062	GCG	3	9	362931	362939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223282
7492	NC_020062	GCC	2	6	362984	362989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223282
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