MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020062	AG	3	6	318243	318248	50 %	0 %	50 %	0 %	440223244
6502	NC_020062	GCCG	2	8	318271	318278	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
6503	NC_020062	GAA	2	6	318325	318330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223244
6504	NC_020062	GAA	2	6	318349	318354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223244
6505	NC_020062	CAC	2	6	318357	318362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223244
6506	NC_020062	CATT	2	8	318371	318378	25 %	50 %	0 %	25 %	440223244
6507	NC_020062	CGC	2	6	318414	318419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
6508	NC_020062	GCCGAA	2	12	318427	318438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223244
6509	NC_020062	ATG	2	6	318449	318454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223244
6510	NC_020062	GCA	2	6	318501	318506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223244
6511	NC_020062	CTT	2	6	318652	318657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223244
6512	NC_020062	AGA	2	6	318693	318698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223244
6513	NC_020062	GCC	2	6	318731	318736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
6514	NC_020062	CGC	2	6	318744	318749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
6515	NC_020062	TGC	2	6	318765	318770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223244
6516	NC_020062	CG	3	6	318822	318827	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
6517	NC_020062	GC	3	6	318870	318875	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
6518	NC_020062	CGC	3	9	318873	318881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
6519	NC_020062	AAGCA	2	10	318899	318908	60 %	0 %	20 %	20 %	440223244
6520	NC_020062	GC	3	6	319023	319028	0 %	0 %	50 %	50 %	440223244
6521	NC_020062	AGCG	2	8	319033	319040	25 %	0 %	50 %	25 %	440223244
6522	NC_020062	CGT	2	6	319060	319065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223244
6523	NC_020062	GGA	2	6	319066	319071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223244
6524	NC_020062	CCATG	2	10	319086	319095	20 %	20 %	20 %	40 %	440223244
6525	NC_020062	TCA	2	6	319113	319118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223244
6526	NC_020062	CCG	2	6	319148	319153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223244
6527	NC_020062	AG	3	6	319179	319184	50 %	0 %	50 %	0 %	440223244
6528	NC_020062	CGA	2	6	319209	319214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223244
6529	NC_020062	TTC	2	6	319245	319250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223244
6530	NC_020062	CCG	2	6	319301	319306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6531	NC_020062	AAT	2	6	319356	319361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_020062	GGC	2	6	319449	319454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_020062	TGA	2	6	319465	319470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_020062	AGA	2	6	319512	319517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223245
6535	NC_020062	GTC	2	6	319568	319573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6536	NC_020062	TC	3	6	319630	319635	0 %	50 %	0 %	50 %	440223245
6537	NC_020062	GGT	2	6	319655	319660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223245
6538	NC_020062	TCC	2	6	319686	319691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223245
6539	NC_020062	CCGT	2	8	319704	319711	0 %	25 %	25 %	50 %	440223245
6540	NC_020062	CGG	2	6	319714	319719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223245
6541	NC_020062	AGG	2	6	319767	319772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223245
6542	NC_020062	TGCCCT	2	12	319795	319806	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440223245
6543	NC_020062	CAGA	2	8	319831	319838	50 %	0 %	25 %	25 %	440223245
6544	NC_020062	CGC	2	6	319892	319897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223245
6545	NC_020062	GAC	2	6	319903	319908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6546	NC_020062	GCA	3	9	319983	319991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6547	NC_020062	GCC	2	6	320004	320009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223245
6548	NC_020062	GCGA	2	8	320033	320040	25 %	0 %	50 %	25 %	440223245
6549	NC_020062	GGC	2	6	320061	320066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223245
6550	NC_020062	GTC	2	6	320154	320159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6551	NC_020062	TCG	2	6	320160	320165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6552	NC_020062	ACG	2	6	320220	320225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6553	NC_020062	GAC	2	6	320231	320236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6554	NC_020062	GCC	2	6	320256	320261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223245
6555	NC_020062	GCC	2	6	320263	320268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223245
6556	NC_020062	GCAA	2	8	320331	320338	50 %	0 %	25 %	25 %	440223245
6557	NC_020062	GCCG	2	8	320378	320385	0 %	0 %	50 %	50 %	440223245
6558	NC_020062	CAA	2	6	320393	320398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223245
6559	NC_020062	GCC	3	9	320405	320413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223245
6560	NC_020062	CGA	2	6	320425	320430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223245
6561	NC_020062	GA	3	6	320445	320450	50 %	0 %	50 %	0 %	440223245
6562	NC_020062	CACGG	2	10	320541	320550	20 %	0 %	40 %	40 %	440223245
6563	NC_020062	CAA	2	6	320569	320574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223245
6564	NC_020062	CAC	2	6	320648	320653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223245
6565	NC_020062	GCG	2	6	320685	320690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223245
6566	NC_020062	TC	3	6	320778	320783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_020062	GGC	2	6	320864	320869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223246
6568	NC_020062	CGA	2	6	321139	321144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6569	NC_020062	CGC	2	6	321178	321183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223246
6570	NC_020062	CGA	2	6	321190	321195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6571	NC_020062	GCTC	2	8	321234	321241	0 %	25 %	25 %	50 %	440223246
6572	NC_020062	GCT	2	6	321245	321250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6573	NC_020062	CCG	2	6	321258	321263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223246
6574	NC_020062	CGC	2	6	321301	321306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223246
6575	NC_020062	CCTT	2	8	321349	321356	0 %	50 %	0 %	50 %	440223246
6576	NC_020062	GCA	2	6	321478	321483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6577	NC_020062	GAT	2	6	321488	321493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223246
6578	NC_020062	CGA	2	6	321529	321534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6579	NC_020062	AGC	2	6	321552	321557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6580	NC_020062	GCG	2	6	321565	321570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223246
6581	NC_020062	GAC	2	6	321590	321595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223246
6582	NC_020062	ATG	2	6	321639	321644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223246
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6586	NC_020062	CGC	2	6	321748	321753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223247
6587	NC_020062	GTG	2	6	321758	321763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223247
6588	NC_020062	CGT	2	6	321792	321797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223247
6589	NC_020062	CTT	2	6	321910	321915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223247
6590	NC_020062	GCT	2	6	321945	321950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223247
6591	NC_020062	GAT	2	6	321951	321956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223247
6592	NC_020062	TGAA	2	8	321968	321975	50 %	25 %	25 %	0 %	440223247
6593	NC_020062	GAT	2	6	322000	322005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223247
6594	NC_020062	CAG	2	6	322072	322077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223247
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6599	NC_020062	CGG	2	6	322241	322246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223247
6600	NC_020062	TCG	2	6	322250	322255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223247
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6604	NC_020062	GC	3	6	322355	322360	0 %	0 %	50 %	50 %	440223247
6605	NC_020062	CTTC	2	8	322365	322372	0 %	50 %	0 %	50 %	440223247
6606	NC_020062	GGC	2	6	322420	322425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223247
6607	NC_020062	CAG	2	6	322513	322518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
6608	NC_020062	CGA	2	6	322572	322577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
6609	NC_020062	GAAT	2	8	322623	322630	50 %	25 %	25 %	0 %	440223248
6610	NC_020062	GAC	2	6	322636	322641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
6611	NC_020062	TTCG	2	8	322696	322703	0 %	50 %	25 %	25 %	440223248
6612	NC_020062	GC	3	6	322911	322916	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
6613	NC_020062	CTC	2	6	322927	322932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223248
6614	NC_020062	CGG	2	6	322989	322994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223248
6615	NC_020062	GC	3	6	323088	323093	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
6616	NC_020062	GCA	2	6	323211	323216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223248
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6618	NC_020062	TCG	2	6	323552	323557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223248
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6620	NC_020062	TGA	2	6	323646	323651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223248
6621	NC_020062	CCGC	2	8	323657	323664	0 %	0 %	25 %	75 %	440223248
6622	NC_020062	CGAG	2	8	323748	323755	25 %	0 %	50 %	25 %	440223248
6623	NC_020062	GC	3	6	323972	323977	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
6624	NC_020062	GGATCG	2	12	324000	324011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223248
6625	NC_020062	GGCCGA	2	12	324016	324027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223248
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6627	NC_020062	CG	3	6	324171	324176	0 %	0 %	50 %	50 %	440223248
6628	NC_020062	CCTT	2	8	324239	324246	0 %	50 %	0 %	50 %	440223248
6629	NC_020062	TCC	2	6	324298	324303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6630	NC_020062	AGTG	2	8	324333	324340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_020062	CAT	2	6	324365	324370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6632	NC_020062	CAA	2	6	324388	324393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6633	NC_020062	CGAAG	2	10	324406	324415	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6634	NC_020062	GGCCG	2	10	324517	324526	0 %	0 %	60 %	40 %	440223249
6635	NC_020062	GCCG	2	8	324530	324537	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
6636	NC_020062	GCT	2	6	324584	324589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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6639	NC_020062	GCT	2	6	324671	324676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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6641	NC_020062	TGG	2	6	324700	324705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223249
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6644	NC_020062	AGC	2	6	324814	324819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223249
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6652	NC_020062	TGA	2	6	325115	325120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223249
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6654	NC_020062	TGA	2	6	325163	325168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223249
6655	NC_020062	GCCG	2	8	325205	325212	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
6656	NC_020062	TGC	2	6	325235	325240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223249
6657	NC_020062	GC	3	6	325256	325261	0 %	0 %	50 %	50 %	440223249
6658	NC_020062	CGC	2	6	325321	325326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6659	NC_020062	GAC	2	6	325342	325347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6660	NC_020062	GTC	2	6	325472	325477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223250
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6664	NC_020062	GCA	2	6	325696	325701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223250
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6680	NC_020062	CGT	3	9	326327	326335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223250
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6724	NC_020062	CTC	2	6	327960	327965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6725	NC_020062	A	7	7	328037	328043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6726	NC_020062	TTCG	2	8	328124	328131	0 %	50 %	25 %	25 %	440223252
6727	NC_020062	CGG	2	6	328155	328160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223252
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6730	NC_020062	TCT	2	6	328287	328292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223252
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6734	NC_020062	CGGC	2	8	328402	328409	0 %	0 %	50 %	50 %	440223252
6735	NC_020062	CG	3	6	328612	328617	0 %	0 %	50 %	50 %	440223252
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6740	NC_020062	CAT	2	6	328810	328815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223252
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6844	NC_020062	GGCG	2	8	332758	332765	0 %	0 %	75 %	25 %	440223255
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6852	NC_020062	GCTG	2	8	333436	333443	0 %	25 %	50 %	25 %	440223255
6853	NC_020062	GAC	2	6	333460	333465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223255
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6858	NC_020062	GAT	2	6	333823	333828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223256
6859	NC_020062	GTCA	2	8	333916	333923	25 %	25 %	25 %	25 %	440223256
6860	NC_020062	GCG	2	6	333927	333932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223256
6861	NC_020062	TCA	2	6	333947	333952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223256
6862	NC_020062	CG	3	6	334035	334040	0 %	0 %	50 %	50 %	440223256
6863	NC_020062	GCCG	2	8	334065	334072	0 %	0 %	50 %	50 %	440223256
6864	NC_020062	CGAA	2	8	334107	334114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6985	NC_020062	AGC	2	6	339429	339434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223261
6986	NC_020062	GAAGC	2	10	339448	339457	40 %	0 %	40 %	20 %	440223261
6987	NC_020062	GC	3	6	339470	339475	0 %	0 %	50 %	50 %	440223261
6988	NC_020062	GA	3	6	339519	339524	50 %	0 %	50 %	0 %	440223261
6989	NC_020062	ATGCCG	2	12	339573	339584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223261
6990	NC_020062	AGC	2	6	339705	339710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223261
6991	NC_020062	CG	3	6	339721	339726	0 %	0 %	50 %	50 %	440223261
6992	NC_020062	CGG	2	6	339833	339838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223262
6993	NC_020062	GAA	2	6	339867	339872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223262
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6997	NC_020062	TGG	2	6	339944	339949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223262
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