MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020062	CGC	2	6	270058	270063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223205
5502	NC_020062	TCG	2	6	270078	270083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223205
5503	NC_020062	GTA	2	6	270092	270097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223205
5504	NC_020062	AGA	2	6	270100	270105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223205
5505	NC_020062	CTTC	2	8	270111	270118	0 %	50 %	0 %	50 %	440223205
5506	NC_020062	GTTCC	2	10	270136	270145	0 %	40 %	20 %	40 %	440223205
5507	NC_020062	GCC	2	6	270212	270217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223205
5508	NC_020062	GCC	2	6	270241	270246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223205
5509	NC_020062	GGT	2	6	270287	270292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223205
5510	NC_020062	GTA	2	6	270395	270400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020062	CG	3	6	270457	270462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_020062	TCG	2	6	270507	270512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223206
5513	NC_020062	GAC	2	6	270644	270649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223206
5514	NC_020062	TCA	2	6	270682	270687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223206
5515	NC_020062	TGC	2	6	270711	270716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223206
5516	NC_020062	GTCC	2	8	270730	270737	0 %	25 %	25 %	50 %	440223206
5517	NC_020062	CAT	2	6	270806	270811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223206
5518	NC_020062	GA	3	6	270848	270853	50 %	0 %	50 %	0 %	440223206
5519	NC_020062	TCG	2	6	270921	270926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223206
5520	NC_020062	TCGACC	2	12	271020	271031	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223206
5521	NC_020062	GGTT	2	8	271155	271162	0 %	50 %	50 %	0 %	440223206
5522	NC_020062	TGG	2	6	271322	271327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223206
5523	NC_020062	CCA	2	6	271336	271341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223206
5524	NC_020062	CCG	2	6	271374	271379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223206
5525	NC_020062	AGCG	2	8	271394	271401	25 %	0 %	50 %	25 %	440223206
5526	NC_020062	CCG	2	6	271434	271439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223206
5527	NC_020062	GAG	2	6	271440	271445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223206
5528	NC_020062	CCG	2	6	271446	271451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223206
5529	NC_020062	GTG	2	6	271452	271457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223206
5530	NC_020062	CCG	2	6	271721	271726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223206
5531	NC_020062	CT	3	6	271733	271738	0 %	50 %	0 %	50 %	440223206
5532	NC_020062	GCG	3	9	271740	271748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223206
5533	NC_020062	CTTCC	2	10	271848	271857	0 %	40 %	0 %	60 %	440223206
5534	NC_020062	AGCG	2	8	271865	271872	25 %	0 %	50 %	25 %	440223206
5535	NC_020062	TGG	2	6	272021	272026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_020062	T	6	6	272036	272041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020062	ATG	3	9	272085	272093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_020062	GGCC	2	8	272309	272316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_020062	CCA	2	6	272465	272470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_020062	CCAT	2	8	272501	272508	25 %	25 %	0 %	50 %	440223207
5541	NC_020062	ATCCG	2	10	272515	272524	20 %	20 %	20 %	40 %	440223207
5542	NC_020062	CAAT	2	8	272546	272553	50 %	25 %	0 %	25 %	440223207
5543	NC_020062	ATC	2	6	272558	272563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223207
5544	NC_020062	CGA	2	6	272592	272597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5545	NC_020062	CGA	2	6	272652	272657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5546	NC_020062	GATC	2	8	272691	272698	25 %	25 %	25 %	25 %	440223207
5547	NC_020062	CCT	2	6	272700	272705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223207
5548	NC_020062	CGTG	2	8	272742	272749	0 %	25 %	50 %	25 %	440223207
5549	NC_020062	CGC	2	6	272769	272774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223207
5550	NC_020062	CCAG	2	8	272790	272797	25 %	0 %	25 %	50 %	440223207
5551	NC_020062	ATCCC	2	10	272892	272901	20 %	20 %	0 %	60 %	440223207
5552	NC_020062	CGAAC	2	10	272944	272953	40 %	0 %	20 %	40 %	440223207
5553	NC_020062	TGA	2	6	272970	272975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223207
5554	NC_020062	ACA	2	6	273002	273007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223207
5555	NC_020062	GGC	2	6	273044	273049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5556	NC_020062	TCC	2	6	273080	273085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223207
5557	NC_020062	GGC	2	6	273133	273138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5558	NC_020062	ATCGCG	2	12	273163	273174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5559	NC_020062	CCTCGA	2	12	273192	273203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223207
5560	NC_020062	CAA	2	6	273271	273276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223207
5561	NC_020062	ATT	2	6	273292	273297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223207
5562	NC_020062	TGC	2	6	273333	273338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5563	NC_020062	GCC	2	6	273394	273399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223207
5564	NC_020062	CGA	2	6	273417	273422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5565	NC_020062	GGC	2	6	273466	273471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5566	NC_020062	CGC	2	6	273572	273577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223207
5567	NC_020062	GC	3	6	273637	273642	0 %	0 %	50 %	50 %	440223207
5568	NC_020062	TGGT	2	8	273792	273799	0 %	50 %	50 %	0 %	440223207
5569	NC_020062	GTT	2	6	273853	273858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223207
5570	NC_020062	TTG	2	6	273895	273900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223207
5571	NC_020062	GCG	3	9	273926	273934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5572	NC_020062	CAG	2	6	273936	273941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223207
5573	NC_020062	GGC	2	6	273949	273954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5574	NC_020062	GGC	2	6	274033	274038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223207
5575	NC_020062	G	6	6	274083	274088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_020062	CCG	2	6	274230	274235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_020062	GAA	2	6	274315	274320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223208
5578	NC_020062	TGG	2	6	274327	274332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223208
5579	NC_020062	GAT	2	6	274342	274347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223208
5580	NC_020062	CAT	2	6	274360	274365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223208
5581	NC_020062	CCTC	2	8	274383	274390	0 %	25 %	0 %	75 %	440223208
5582	NC_020062	GAC	2	6	274411	274416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223208
5583	NC_020062	GC	3	6	274488	274493	0 %	0 %	50 %	50 %	440223208
5584	NC_020062	TCG	2	6	274494	274499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223208
5585	NC_020062	ATG	2	6	274514	274519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223208
5586	NC_020062	TGC	2	6	274559	274564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223208
5587	NC_020062	CCG	2	6	274568	274573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223208
5588	NC_020062	CG	3	6	274617	274622	0 %	0 %	50 %	50 %	440223208
5589	NC_020062	TCG	2	6	274652	274657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223208
5590	NC_020062	CG	3	6	274656	274661	0 %	0 %	50 %	50 %	440223208
5591	NC_020062	AAC	2	6	274730	274735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223208
5592	NC_020062	CT	3	6	274800	274805	0 %	50 %	0 %	50 %	440223208
5593	NC_020062	CGA	2	6	274909	274914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223208
5594	NC_020062	CAC	2	6	274918	274923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223208
5595	NC_020062	CT	3	6	275055	275060	0 %	50 %	0 %	50 %	440223209
5596	NC_020062	CGT	2	6	275175	275180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223209
5597	NC_020062	AGA	2	6	275290	275295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223209
5598	NC_020062	GCATT	2	10	275309	275318	20 %	40 %	20 %	20 %	440223209
5599	NC_020062	GCG	2	6	275333	275338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223209
5600	NC_020062	TGC	2	6	275352	275357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223209
5601	NC_020062	GCC	2	6	275476	275481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223209
5602	NC_020062	TCAGGG	2	12	275486	275497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223209
5603	NC_020062	CGC	3	9	275571	275579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223209
5604	NC_020062	AGCG	2	8	275662	275669	25 %	0 %	50 %	25 %	440223209
5605	NC_020062	CAG	2	6	275787	275792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223209
5606	NC_020062	TTG	2	6	275978	275983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223210
5607	NC_020062	GAA	3	9	276025	276033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223210
5608	NC_020062	GCC	2	6	276035	276040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223210
5609	NC_020062	CCT	2	6	276144	276149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223210
5610	NC_020062	CAG	2	6	276172	276177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223210
5611	NC_020062	CAG	2	6	276268	276273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223210
5612	NC_020062	GACT	2	8	276275	276282	25 %	25 %	25 %	25 %	440223210
5613	NC_020062	TGA	2	6	276297	276302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223210
5614	NC_020062	CGA	2	6	276306	276311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223210
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5617	NC_020062	GGA	2	6	276503	276508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223210
5618	NC_020062	CGG	2	6	276559	276564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223210
5619	NC_020062	GGC	2	6	276574	276579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223210
5620	NC_020062	TCA	2	6	276618	276623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223210
5621	NC_020062	GCC	2	6	276676	276681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_020062	CGA	2	6	276747	276752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_020062	CCGG	2	8	276780	276787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_020062	AGCC	2	8	276806	276813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_020062	CTG	2	6	276953	276958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_020062	GTGAT	2	10	276988	276997	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_020062	CAA	2	6	277090	277095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_020062	GTT	2	6	277152	277157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_020062	TTA	2	6	277161	277166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_020062	GCT	2	6	277210	277215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_020062	TAT	2	6	277256	277261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_020062	CCG	2	6	277276	277281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_020062	CGA	2	6	277306	277311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_020062	CAT	2	6	277435	277440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_020062	CGGC	2	8	277453	277460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5636	NC_020062	AGACCC	2	12	277491	277502	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440223211
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5642	NC_020062	TGG	2	6	277852	277857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223211
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5646	NC_020062	GAT	2	6	278104	278109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223211
5647	NC_020062	CG	3	6	278136	278141	0 %	0 %	50 %	50 %	440223211
5648	NC_020062	CCA	2	6	278172	278177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223211
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5653	NC_020062	GC	3	6	278339	278344	0 %	0 %	50 %	50 %	440223211
5654	NC_020062	CG	3	6	278358	278363	0 %	0 %	50 %	50 %	440223211
5655	NC_020062	TCGA	2	8	278396	278403	25 %	25 %	25 %	25 %	440223211
5656	NC_020062	ATC	2	6	278465	278470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5657	NC_020062	GGA	2	6	278495	278500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5658	NC_020062	CGG	2	6	278614	278619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223212
5659	NC_020062	CTGC	2	8	278632	278639	0 %	25 %	25 %	50 %	440223212
5660	NC_020062	GAT	2	6	278702	278707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223212
5661	NC_020062	CG	3	6	278823	278828	0 %	0 %	50 %	50 %	440223212
5662	NC_020062	GGC	2	6	278840	278845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223212
5663	NC_020062	GC	3	6	278885	278890	0 %	0 %	50 %	50 %	440223212
5664	NC_020062	CGG	2	6	278989	278994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223212
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5680	NC_020062	GAC	2	6	280057	280062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223212
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5685	NC_020062	ATCG	2	8	280279	280286	25 %	25 %	25 %	25 %	440223213
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5687	NC_020062	GGT	2	6	280318	280323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223213
5688	NC_020062	AT	3	6	280336	280341	50 %	50 %	0 %	0 %	440223213
5689	NC_020062	CCGGC	2	10	280344	280353	0 %	0 %	40 %	60 %	440223213
5690	NC_020062	CGT	2	6	280387	280392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223213
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5696	NC_020062	ACGGC	2	10	280598	280607	20 %	0 %	40 %	40 %	440223213
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5701	NC_020062	CGA	2	6	280918	280923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223213
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5716	NC_020062	CGA	2	6	281368	281373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223213
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5722	NC_020062	CTGG	2	8	281587	281594	0 %	25 %	50 %	25 %	440223213
5723	NC_020062	TCA	2	6	281676	281681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223213
5724	NC_020062	GATC	2	8	281683	281690	25 %	25 %	25 %	25 %	440223213
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5728	NC_020062	TCAAG	2	10	281854	281863	40 %	20 %	20 %	20 %	440223213
5729	NC_020062	TCT	2	6	281913	281918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223213
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5731	NC_020062	GAC	2	6	281978	281983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223213
5732	NC_020062	TGC	2	6	282009	282014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223213
5733	NC_020062	GGA	2	6	282040	282045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223213
5734	NC_020062	CGGCG	2	10	282085	282094	0 %	0 %	60 %	40 %	440223213
5735	NC_020062	GCC	2	6	282104	282109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223213
5736	NC_020062	CT	3	6	282111	282116	0 %	50 %	0 %	50 %	440223213
5737	NC_020062	ATC	2	6	282137	282142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223213
5738	NC_020062	GCC	2	6	282144	282149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223213
5739	NC_020062	TCC	2	6	282287	282292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223213
5740	NC_020062	TGT	3	9	282303	282311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223213
5741	NC_020062	GGC	2	6	282376	282381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223213
5742	NC_020062	GCA	2	6	282439	282444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223213
5743	NC_020062	CCGCAG	2	12	282499	282510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223213
5744	NC_020062	AC	3	6	282589	282594	50 %	0 %	0 %	50 %	440223213
5745	NC_020062	TCCG	2	8	282621	282628	0 %	25 %	25 %	50 %	440223213
5746	NC_020062	CGG	2	6	282657	282662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223213
5747	NC_020062	GAG	2	6	282812	282817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5748	NC_020062	ACC	2	6	282827	282832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5749	NC_020062	GCC	2	6	282834	282839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5750	NC_020062	GCA	2	6	282936	282941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5751	NC_020062	GCC	2	6	283049	283054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223214
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5762	NC_020062	C	6	6	283601	283606	0 %	0 %	0 %	100 %	440223214
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5766	NC_020062	ATA	2	6	283937	283942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5767	NC_020062	ATGA	2	8	283996	284003	50 %	25 %	25 %	0 %	440223215
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5785	NC_020062	GA	3	6	284976	284981	50 %	0 %	50 %	0 %	440223215
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5868	NC_020062	AGAT	2	8	288816	288823	50 %	25 %	25 %	0 %	440223220
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5893	NC_020062	GCG	2	6	289929	289934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223221
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5959	NC_020062	CGA	2	6	293207	293212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223223
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5986	NC_020062	GCG	2	6	295088	295093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223225
5987	NC_020062	AGC	2	6	295094	295099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223225
5988	NC_020062	CGA	2	6	295121	295126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223225
5989	NC_020062	CCGGC	2	10	295131	295140	0 %	0 %	40 %	60 %	440223225
5990	NC_020062	GAGG	2	8	295185	295192	25 %	0 %	75 %	0 %	440223225
5991	NC_020062	GTCC	2	8	295228	295235	0 %	25 %	25 %	50 %	440223225
5992	NC_020062	CG	4	8	295271	295278	0 %	0 %	50 %	50 %	440223225
5993	NC_020062	TCGCC	2	10	295286	295295	0 %	20 %	20 %	60 %	440223225
5994	NC_020062	GCTG	2	8	295328	295335	0 %	25 %	50 %	25 %	440223225
5995	NC_020062	GCC	2	6	295371	295376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223225
5996	NC_020062	CCG	2	6	295408	295413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223226
5997	NC_020062	CGG	2	6	295416	295421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223226
5998	NC_020062	AG	3	6	295623	295628	50 %	0 %	50 %	0 %	440223226
5999	NC_020062	TCG	2	6	295644	295649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223226
6000	NC_020062	ACC	2	6	295697	295702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223226

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