MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_020061	GGT	2	6	480797	480802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222888
9502	NC_020061	GAC	2	6	480809	480814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222888
9503	NC_020061	TGA	2	6	480952	480957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_020061	GAG	2	6	480981	480986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_020061	GC	3	6	480993	480998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9506	NC_020061	GCG	2	6	481002	481007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_020061	GAC	2	6	481149	481154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_020061	GTC	2	6	481176	481181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_020061	AAG	2	6	481227	481232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_020061	CG	3	6	481264	481269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9511	NC_020061	TGC	2	6	481314	481319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_020061	AGC	2	6	481357	481362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9513	NC_020061	GCA	2	6	481462	481467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9514	NC_020061	CGT	2	6	481506	481511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_020061	T	7	7	481511	481517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_020061	CGC	2	6	481572	481577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9517	NC_020061	CCTT	2	8	481601	481608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9518	NC_020061	GCCA	2	8	481753	481760	25 %	0 %	25 %	50 %	440222889
9519	NC_020061	ATG	2	6	481799	481804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222889
9520	NC_020061	GC	3	6	481835	481840	0 %	0 %	50 %	50 %	440222889
9521	NC_020061	AAGCC	2	10	481844	481853	40 %	0 %	20 %	40 %	440222889
9522	NC_020061	TTC	2	6	481877	481882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222889
9523	NC_020061	AAG	2	6	481915	481920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222889
9524	NC_020061	CGC	2	6	481927	481932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222889
9525	NC_020061	AGC	2	6	481940	481945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222889
9526	NC_020061	TCG	2	6	481966	481971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222889
9527	NC_020061	TGAT	2	8	482002	482009	25 %	50 %	25 %	0 %	440222889
9528	NC_020061	CGC	2	6	482012	482017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222889
9529	NC_020061	GCG	2	6	482081	482086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222889
9530	NC_020061	TCA	2	6	482127	482132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222889
9531	NC_020061	TGC	2	6	482158	482163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222889
9532	NC_020061	CCCT	2	8	482298	482305	0 %	25 %	0 %	75 %	440222889
9533	NC_020061	TCA	2	6	482331	482336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222889
9534	NC_020061	GCGT	2	8	482400	482407	0 %	25 %	50 %	25 %	440222889
9535	NC_020061	TTG	2	6	482501	482506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222889
9536	NC_020061	ATC	2	6	482651	482656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222889
9537	NC_020061	CCT	2	6	482709	482714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222889
9538	NC_020061	TTTC	2	8	482733	482740	0 %	75 %	0 %	25 %	440222889
9539	NC_020061	TA	3	6	482758	482763	50 %	50 %	0 %	0 %	440222889
9540	NC_020061	ACC	2	6	482841	482846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9541	NC_020061	CG	3	6	482883	482888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9542	NC_020061	TGCC	2	8	482913	482920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9543	NC_020061	GCA	2	6	482990	482995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_020061	CGC	2	6	483050	483055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9545	NC_020061	GATCG	2	10	483126	483135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9546	NC_020061	TC	3	6	483147	483152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9547	NC_020061	CCA	2	6	483251	483256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9548	NC_020061	GCG	2	6	483296	483301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_020061	TGC	2	6	483311	483316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9550	NC_020061	TGA	2	6	483383	483388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_020061	TCG	2	6	483464	483469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_020061	CAAGG	2	10	483477	483486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9553	NC_020061	GGC	2	6	483493	483498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_020061	CCG	2	6	483502	483507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9555	NC_020061	TTC	2	6	483523	483528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_020061	GC	3	6	483556	483561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9557	NC_020061	CGA	2	6	483660	483665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_020061	AGA	2	6	483753	483758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_020061	ACA	2	6	483776	483781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_020061	CTTG	2	8	483783	483790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9561	NC_020061	GAA	2	6	483818	483823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_020061	CTG	2	6	483985	483990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9563	NC_020061	CCG	2	6	484018	484023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9564	NC_020061	CAG	2	6	484113	484118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9565	NC_020061	TGA	2	6	484156	484161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222890
9566	NC_020061	ACG	2	6	484182	484187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222890
9567	NC_020061	CGA	2	6	484219	484224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222890
9568	NC_020061	GCG	2	6	484227	484232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222890
9569	NC_020061	ATG	2	6	484380	484385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222890
9570	NC_020061	CTG	2	6	484412	484417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NC_020061	GAC	2	6	484430	484435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_020061	AGG	2	6	484717	484722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222891
9573	NC_020061	AGG	2	6	484775	484780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_020061	GC	3	6	484867	484872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9575	NC_020061	GGC	2	6	484899	484904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_020061	CGA	2	6	484920	484925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_020061	GCC	2	6	484979	484984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9578	NC_020061	TGAG	2	8	485012	485019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_020061	AGG	2	6	485057	485062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_020061	CTG	2	6	485068	485073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9581	NC_020061	CCG	2	6	485095	485100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9582	NC_020061	CCGG	2	8	485102	485109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9583	NC_020061	GAT	2	6	485142	485147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_020061	ATC	2	6	485207	485212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9585	NC_020061	CGC	2	6	485425	485430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9586	NC_020061	GGC	2	6	485477	485482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9587	NC_020061	CAA	2	6	485508	485513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NC_020061	GTT	2	6	485578	485583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_020061	TC	3	6	485592	485597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9590	NC_020061	GC	3	6	485612	485617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9591	NC_020061	ACG	2	6	485621	485626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9592	NC_020061	GCC	2	6	485635	485640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_020061	CGT	2	6	485647	485652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9594	NC_020061	CCA	2	6	485673	485678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9595	NC_020061	CGA	2	6	485783	485788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_020061	CGA	2	6	485798	485803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_020061	TGT	2	6	485818	485823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_020061	GAC	2	6	485873	485878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9599	NC_020061	AAG	2	6	485892	485897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_020061	AAGTCG	2	12	485922	485933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9601	NC_020061	GCC	2	6	485996	486001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222892
9602	NC_020061	GCC	2	6	486011	486016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222892
9603	NC_020061	CAA	2	6	486040	486045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222892
9604	NC_020061	TCG	2	6	486047	486052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222892
9605	NC_020061	GGT	2	6	486066	486071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222892
9606	NC_020061	GGC	2	6	486154	486159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222892
9607	NC_020061	ACC	2	6	486169	486174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222892
9608	NC_020061	TTC	2	6	486204	486209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222892
9609	NC_020061	GTT	2	6	486244	486249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222892
9610	NC_020061	TCG	2	6	486269	486274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222892
9611	NC_020061	CACC	2	8	486367	486374	25 %	0 %	0 %	75 %	440222892
9612	NC_020061	TGC	2	6	486404	486409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222892
9613	NC_020061	ATG	2	6	486569	486574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222892
9614	NC_020061	TGCG	2	8	486589	486596	0 %	25 %	50 %	25 %	440222892
9615	NC_020061	AAT	2	6	486738	486743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222892
9616	NC_020061	CGG	2	6	486757	486762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222892
9617	NC_020061	CAT	2	6	486783	486788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222892
9618	NC_020061	GAACCG	2	12	486837	486848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222892
9619	NC_020061	TCG	2	6	486854	486859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222892
9620	NC_020061	CAA	2	6	486926	486931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222892
9621	NC_020061	ATC	2	6	487040	487045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222892
9622	NC_020061	TCT	2	6	487110	487115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222892
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9624	NC_020061	GACCG	2	10	487246	487255	20 %	0 %	40 %	40 %	440222892
9625	NC_020061	CG	3	6	487272	487277	0 %	0 %	50 %	50 %	440222892
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9879	NC_020061	TACC	2	8	498934	498941	25 %	25 %	0 %	50 %	440222904
9880	NC_020061	GAC	2	6	498965	498970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222904
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9883	NC_020061	GAAG	2	8	499066	499073	50 %	0 %	50 %	0 %	440222904
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9999	NC_020061	TCG	2	6	505343	505348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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