MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020061	GAG	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020061	GCC	2	6	24769	24774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_020061	CCA	2	6	24778	24783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_020061	ATGG	2	8	24904	24911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020061	CAG	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020061	CCCA	2	8	25022	25029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
507	NC_020061	CAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222485
508	NC_020061	TTGG	2	8	25061	25068	0 %	50 %	50 %	0 %	440222485
509	NC_020061	CGG	2	6	25084	25089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222485
510	NC_020061	AGA	2	6	25195	25200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222485
511	NC_020061	GTG	2	6	25298	25303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020061	GAA	2	6	25330	25335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020061	CCGAT	2	10	25377	25386	20 %	20 %	20 %	40 %	440222486
514	NC_020061	TGA	2	6	25447	25452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222486
515	NC_020061	GCAAGG	2	12	25481	25492	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440222486
516	NC_020061	CAA	2	6	25508	25513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222486
517	NC_020061	CTG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222486
518	NC_020061	GCA	2	6	25670	25675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222486
519	NC_020061	GTCG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	50 %	25 %	440222486
520	NC_020061	CATTT	2	10	25698	25707	20 %	60 %	0 %	20 %	440222486
521	NC_020061	CTC	2	6	25902	25907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_020061	GTG	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222487
523	NC_020061	ACC	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222487
524	NC_020061	ATG	2	6	26106	26111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222487
525	NC_020061	GCCT	2	8	26163	26170	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
526	NC_020061	CGCT	2	8	26175	26182	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
527	NC_020061	TTC	2	6	26336	26341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020061	CCG	2	6	26403	26408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_020061	TGC	2	6	26415	26420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_020061	ATG	2	6	26493	26498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020061	CCT	2	6	26623	26628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_020061	TTC	2	6	26722	26727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020061	CTT	2	6	26883	26888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020061	CGA	2	6	26918	26923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020061	TCG	2	6	26935	26940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_020061	TTC	2	6	26977	26982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020061	GCTG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_020061	GATC	2	8	27035	27042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_020061	GCG	2	6	27075	27080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020061	TGG	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020061	CG	3	6	27130	27135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_020061	GCG	2	6	27162	27167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020061	TCTCG	2	10	27173	27182	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
544	NC_020061	TGC	2	6	27262	27267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_020061	GC	3	6	27301	27306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_020061	CCT	2	6	27377	27382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_020061	GGC	2	6	27383	27388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020061	CTT	2	6	27428	27433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020061	ACCTC	2	10	27451	27460	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
550	NC_020061	GCG	2	6	27503	27508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_020061	CCA	2	6	27586	27591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_020061	AGC	2	6	27633	27638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020061	CTCC	2	8	27722	27729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
554	NC_020061	GCC	2	6	27762	27767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_020061	CGT	2	6	27803	27808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020061	GCAG	2	8	27879	27886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_020061	ATC	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020061	ATG	3	9	27973	27981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020061	GCC	2	6	27982	27987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_020061	TTTA	2	8	28077	28084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020061	TCA	2	6	28120	28125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020061	GCT	2	6	28172	28177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020061	AGTC	2	8	28311	28318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_020061	GCG	2	6	28333	28338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_020061	CTG	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020061	AAC	2	6	28470	28475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_020061	CGT	2	6	28644	28649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_020061	TCG	2	6	28673	28678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020061	GAT	2	6	28690	28695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020061	CAC	2	6	28788	28793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_020061	TAT	2	6	28864	28869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020061	CCG	2	6	28940	28945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_020061	TCA	2	6	28952	28957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020061	ACCGT	2	10	28967	28976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
575	NC_020061	GCA	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_020061	GGA	2	6	29028	29033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020061	AGC	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_020061	GCG	2	6	29054	29059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020061	CGGG	2	8	29090	29097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
580	NC_020061	TCG	2	6	29137	29142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020061	TCC	2	6	29339	29344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020061	AG	4	8	29406	29413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020061	CGA	2	6	29465	29470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_020061	TGG	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020061	CAA	2	6	29615	29620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_020061	GCC	2	6	29637	29642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_020061	ATC	2	6	29694	29699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_020061	GAC	2	6	29700	29705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_020061	CAC	2	6	29720	29725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_020061	GAG	2	6	29760	29765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020061	ATGGC	2	10	29770	29779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
592	NC_020061	CGA	2	6	29819	29824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020061	CGG	2	6	29849	29854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020061	CATG	2	8	29873	29880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_020061	ATC	2	6	29905	29910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_020061	AT	3	6	29978	29983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020061	CGC	2	6	30060	30065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_020061	CGC	2	6	30092	30097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_020061	T	6	6	30099	30104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020061	CCT	2	6	30207	30212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020061	AGC	2	6	30219	30224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020061	CGG	2	6	30253	30258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020061	CGAT	2	8	30267	30274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_020061	CGG	2	6	30288	30293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020061	GC	3	6	30310	30315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_020061	GCA	2	6	30342	30347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020061	CGAC	2	8	30384	30391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020061	GCA	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020061	ACG	2	6	30444	30449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_020061	CGG	2	6	30472	30477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_020061	TGGC	2	8	30489	30496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
612	NC_020061	CGG	2	6	30499	30504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020061	CGA	2	6	30505	30510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020061	TCG	2	6	30519	30524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_020061	GAC	2	6	30533	30538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020061	CGG	2	6	30559	30564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020061	TCC	2	6	30579	30584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_020061	CAT	2	6	30628	30633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020061	CGA	2	6	30640	30645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020061	CGG	2	6	30703	30708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020061	CTG	2	6	30800	30805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020061	GCG	2	6	30825	30830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020061	CAT	2	6	30904	30909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020061	ACA	2	6	30912	30917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020061	GCG	2	6	30924	30929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020061	AGG	2	6	31043	31048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020061	TAC	2	6	31073	31078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020061	GACC	2	8	31178	31185	25 %	0 %	25 %	50 %	440222488
629	NC_020061	GCG	2	6	31224	31229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222488
630	NC_020061	GCT	2	6	31245	31250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
631	NC_020061	TCG	2	6	31254	31259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
632	NC_020061	GCG	2	6	31288	31293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222488
633	NC_020061	GTC	2	6	31309	31314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
634	NC_020061	AAT	2	6	31347	31352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222488
635	NC_020061	CGG	2	6	31391	31396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222488
636	NC_020061	GCT	2	6	31440	31445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
637	NC_020061	TCG	2	6	31462	31467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
638	NC_020061	CG	3	6	31466	31471	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
639	NC_020061	CTG	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222488
640	NC_020061	GC	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
641	NC_020061	GGC	2	6	31523	31528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222488
642	NC_020061	TGAC	2	8	31583	31590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_020061	CG	3	6	31638	31643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
644	NC_020061	CCA	2	6	31675	31680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
645	NC_020061	GA	3	6	31708	31713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
646	NC_020061	GTT	2	6	31754	31759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_020061	GCC	2	6	31762	31767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_020061	GCT	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_020061	CCG	2	6	31800	31805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
650	NC_020061	GC	3	6	31879	31884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
651	NC_020061	CAG	2	6	31900	31905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_020061	GGC	2	6	31924	31929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_020061	GCC	2	6	32060	32065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222489
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660	NC_020061	CCG	2	6	32343	32348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222489
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671	NC_020061	GCC	2	6	33288	33293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_020061	C	6	6	33325	33330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
673	NC_020061	CTT	2	6	33333	33338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_020061	ACT	2	6	33345	33350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_020061	TGTCG	2	10	33425	33434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
677	NC_020061	ACA	2	6	33486	33491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_020061	AACG	2	8	33511	33518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
679	NC_020061	CGCA	2	8	33601	33608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
680	NC_020061	GAA	2	6	33674	33679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
681	NC_020061	TTTC	2	8	33686	33693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
682	NC_020061	TTC	2	6	33908	33913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_020061	TTC	2	6	33956	33961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
684	NC_020061	CTA	2	6	34037	34042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_020061	AT	3	6	34044	34049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_020061	AATC	2	8	34064	34071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
687	NC_020061	TCA	2	6	34083	34088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222490
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767	NC_020061	GCA	2	6	37666	37671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222493
768	NC_020061	CGT	2	6	37741	37746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
769	NC_020061	ACC	2	6	37748	37753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222494
770	NC_020061	ATC	3	9	37755	37763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
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772	NC_020061	TGC	2	6	37975	37980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
773	NC_020061	CTG	2	6	38030	38035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222494
774	NC_020061	GGC	2	6	38047	38052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222494
775	NC_020061	CGC	2	6	38122	38127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
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782	NC_020061	TCA	2	6	38421	38426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
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784	NC_020061	TCA	4	12	38517	38528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222494
785	NC_020061	CGG	2	6	38530	38535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222494
786	NC_020061	GCC	2	6	38567	38572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222494
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789	NC_020061	GCC	2	6	38945	38950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222495
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791	NC_020061	GGT	2	6	39026	39031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222495
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875	NC_020061	G	6	6	43433	43438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
876	NC_020061	ATCGA	2	10	43461	43470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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882	NC_020061	GCC	2	6	43811	43816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222500
883	NC_020061	CCA	2	6	43858	43863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222500
884	NC_020061	GA	3	6	43886	43891	50 %	0 %	50 %	0 %	440222500
885	NC_020061	AGC	2	6	43892	43897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222500
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889	NC_020061	GAG	2	6	44225	44230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222500
890	NC_020061	GCA	2	6	44338	44343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222500
891	NC_020061	GGC	2	6	44351	44356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222500
892	NC_020061	AGC	2	6	44367	44372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222500
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955	NC_020061	A	6	6	47313	47318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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