MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_020061	AATTG	2	10	455083	455092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_020061	TCC	2	6	455140	455145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_020061	AG	3	6	455227	455232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_020061	GT	3	6	455442	455447	0 %	50 %	50 %	0 %	440222862
9005	NC_020061	GTC	2	6	455564	455569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222862
9006	NC_020061	GAGC	2	8	455587	455594	25 %	0 %	50 %	25 %	440222862
9007	NC_020061	GCT	2	6	455627	455632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222862
9008	NC_020061	ATC	2	6	455661	455666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222862
9009	NC_020061	CGAC	2	8	455732	455739	25 %	0 %	25 %	50 %	440222862
9010	NC_020061	TGATGT	2	12	455786	455797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440222862
9011	NC_020061	ATT	2	6	455920	455925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222862
9012	NC_020061	TGT	2	6	456107	456112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_020061	GGCG	2	8	456186	456193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9014	NC_020061	GGC	2	6	456262	456267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_020061	CT	3	6	456299	456304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_020061	A	6	6	456356	456361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_020061	GGC	2	6	456369	456374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_020061	AGC	2	6	456409	456414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_020061	A	6	6	456423	456428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_020061	AT	3	6	456483	456488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_020061	TGC	2	6	456566	456571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_020061	TGAATC	2	12	456599	456610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9023	NC_020061	CTTCGG	2	12	456647	456658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_020061	GGC	2	6	456688	456693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_020061	CGG	2	6	456722	456727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_020061	ATG	2	6	456750	456755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_020061	CG	3	6	456762	456767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9028	NC_020061	TGG	2	6	456784	456789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_020061	ACG	2	6	456891	456896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_020061	TCG	2	6	456913	456918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_020061	GGA	2	6	457110	457115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_020061	A	6	6	457120	457125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_020061	GCCC	2	8	457132	457139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9034	NC_020061	AAG	2	6	457146	457151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_020061	CG	3	6	457227	457232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_020061	CAT	2	6	457257	457262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_020061	T	6	6	457269	457274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_020061	TCCT	2	8	457322	457329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_020061	TTG	2	6	457449	457454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222863
9040	NC_020061	CCA	3	9	457462	457470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222863
9041	NC_020061	CT	3	6	457489	457494	0 %	50 %	0 %	50 %	440222863
9042	NC_020061	CG	3	6	457560	457565	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
9043	NC_020061	AGC	2	6	457617	457622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
9044	NC_020061	GCC	2	6	457631	457636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222863
9045	NC_020061	AACC	2	8	457655	457662	50 %	0 %	0 %	50 %	440222863
9046	NC_020061	GCT	2	6	457697	457702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222863
9047	NC_020061	GGC	2	6	457778	457783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222863
9048	NC_020061	GC	3	6	457790	457795	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
9049	NC_020061	CAG	2	6	457951	457956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
9050	NC_020061	TCGC	2	8	457984	457991	0 %	25 %	25 %	50 %	440222863
9051	NC_020061	GTTC	3	12	458006	458017	0 %	50 %	25 %	25 %	440222863
9052	NC_020061	TTC	2	6	458145	458150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222863
9053	NC_020061	AT	3	6	458160	458165	50 %	50 %	0 %	0 %	440222863
9054	NC_020061	TGG	2	6	458199	458204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222863
9055	NC_020061	GAT	2	6	458230	458235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222863
9056	NC_020061	GC	3	6	458236	458241	0 %	0 %	50 %	50 %	440222863
9057	NC_020061	CA	3	6	458264	458269	50 %	0 %	0 %	50 %	440222863
9058	NC_020061	ACG	2	6	458318	458323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222863
9059	NC_020061	TGC	2	6	458359	458364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222863
9060	NC_020061	GGGC	2	8	458463	458470	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9061	NC_020061	TGG	2	6	458543	458548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_020061	C	6	6	458622	458627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9063	NC_020061	GAA	2	6	458674	458679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_020061	GCC	2	6	458857	458862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_020061	ACG	2	6	458946	458951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_020061	TGC	2	6	458966	458971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_020061	CAA	2	6	459081	459086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_020061	CGCAA	2	10	459099	459108	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9069	NC_020061	CGA	2	6	459156	459161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_020061	ACC	2	6	459178	459183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_020061	GAT	2	6	459241	459246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222864
9072	NC_020061	TGG	2	6	459248	459253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222864
9073	NC_020061	TCAG	2	8	459281	459288	25 %	25 %	25 %	25 %	440222864
9074	NC_020061	CATTA	2	10	459325	459334	40 %	40 %	0 %	20 %	440222864
9075	NC_020061	CAA	2	6	459414	459419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222864
9076	NC_020061	GCA	2	6	459495	459500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222864
9077	NC_020061	CTT	2	6	459640	459645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222864
9078	NC_020061	TGGGT	2	10	459648	459657	0 %	40 %	60 %	0 %	440222864
9079	NC_020061	TTCC	2	8	459701	459708	0 %	50 %	0 %	50 %	440222864
9080	NC_020061	CGT	2	6	459712	459717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222864
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9082	NC_020061	GA	3	6	459875	459880	50 %	0 %	50 %	0 %	440222864
9083	NC_020061	TCTTA	2	10	460066	460075	20 %	60 %	0 %	20 %	440222864
9084	NC_020061	AGC	2	6	460092	460097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222864
9085	NC_020061	AAG	2	6	460180	460185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222864
9086	NC_020061	GAT	2	6	460237	460242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222864
9087	NC_020061	GAA	2	6	460374	460379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222865
9088	NC_020061	CGATCT	2	12	460421	460432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440222865
9089	NC_020061	CAG	2	6	460515	460520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222865
9090	NC_020061	CGGCA	2	10	460562	460571	20 %	0 %	40 %	40 %	440222865
9091	NC_020061	CTC	2	6	460610	460615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222865
9092	NC_020061	CAG	2	6	460626	460631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222865
9093	NC_020061	TCT	2	6	460687	460692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_020061	TGC	2	6	460717	460722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222866
9095	NC_020061	GTC	2	6	460726	460731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222866
9096	NC_020061	AGA	2	6	460751	460756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222866
9097	NC_020061	GC	3	6	460770	460775	0 %	0 %	50 %	50 %	440222866
9098	NC_020061	GAA	2	6	460829	460834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222866
9099	NC_020061	GC	3	6	460844	460849	0 %	0 %	50 %	50 %	440222866
9100	NC_020061	TTG	2	6	460941	460946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222866
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9102	NC_020061	AAT	2	6	461012	461017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222866
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9104	NC_020061	TCT	2	6	461105	461110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222867
9105	NC_020061	CGCC	2	8	461132	461139	0 %	0 %	25 %	75 %	440222867
9106	NC_020061	GAC	3	9	461165	461173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222867
9107	NC_020061	CGG	2	6	461252	461257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222867
9108	NC_020061	TCG	2	6	461267	461272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_020061	TC	3	6	461284	461289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_020061	GCC	2	6	461359	461364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9111	NC_020061	GC	3	6	461460	461465	0 %	0 %	50 %	50 %	440222868
9112	NC_020061	GGC	2	6	461468	461473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222868
9113	NC_020061	GCC	2	6	461497	461502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222868
9114	NC_020061	AGG	2	6	461560	461565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222868
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9116	NC_020061	CGA	2	6	461716	461721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222868
9117	NC_020061	GA	3	6	461789	461794	50 %	0 %	50 %	0 %	440222868
9118	NC_020061	GC	4	8	461941	461948	0 %	0 %	50 %	50 %	440222868
9119	NC_020061	AG	4	8	462066	462073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_020061	CGC	2	6	462114	462119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222869
9121	NC_020061	CCA	2	6	462127	462132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222869
9122	NC_020061	AAG	2	6	462155	462160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222869
9123	NC_020061	TGCTT	2	10	462162	462171	0 %	60 %	20 %	20 %	440222869
9124	NC_020061	AGT	2	6	462183	462188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222869
9125	NC_020061	GAA	2	6	462271	462276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222869
9126	NC_020061	GCG	2	6	462533	462538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222869
9127	NC_020061	TGA	2	6	462547	462552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222869
9128	NC_020061	GTC	2	6	462561	462566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222869
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9133	NC_020061	TGA	2	6	462829	462834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222869
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9153	NC_020061	CTG	2	6	463757	463762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9229	NC_020061	AGC	2	6	466947	466952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9230	NC_020061	CCTGG	2	10	467036	467045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9231	NC_020061	GTC	2	6	467084	467089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9232	NC_020061	CGA	2	6	467100	467105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9234	NC_020061	ATG	2	6	467205	467210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9238	NC_020061	CGTTC	2	10	467357	467366	0 %	40 %	20 %	40 %	440222874
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9240	NC_020061	GCTG	2	8	467399	467406	0 %	25 %	50 %	25 %	440222874
9241	NC_020061	T	6	6	467500	467505	0 %	100 %	0 %	0 %	440222874
9242	NC_020061	TCG	2	6	467561	467566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222874
9243	NC_020061	TGA	2	6	467576	467581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222874
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9245	NC_020061	GAT	2	6	467637	467642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222874
9246	NC_020061	GC	3	6	467697	467702	0 %	0 %	50 %	50 %	440222874
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9496	NC_020061	TGATGC	2	12	480505	480516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440222887
9497	NC_020061	ATC	2	6	480527	480532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222887
9498	NC_020061	CGC	2	6	480690	480695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222888
9499	NC_020061	TTC	2	6	480717	480722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222888
9500	NC_020061	GAT	2	6	480791	480796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222888

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