MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020061	ATC	2	6	275138	275143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222714
5502	NC_020061	TGC	2	6	275150	275155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222714
5503	NC_020061	ATC	2	6	275182	275187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222714
5504	NC_020061	CAA	2	6	275196	275201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222714
5505	NC_020061	TGA	3	9	275262	275270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020061	AGA	2	6	275344	275349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020061	TGTT	2	8	275408	275415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_020061	CG	3	6	275479	275484	0 %	0 %	50 %	50 %	440222715
5509	NC_020061	GCT	2	6	275601	275606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222715
5510	NC_020061	TGC	2	6	275639	275644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222715
5511	NC_020061	CG	3	6	275744	275749	0 %	0 %	50 %	50 %	440222715
5512	NC_020061	GCG	2	6	275819	275824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
5513	NC_020061	AAG	2	6	275848	275853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222715
5514	NC_020061	CAT	2	6	275874	275879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222715
5515	NC_020061	GGC	2	6	276010	276015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
5516	NC_020061	GCCGC	2	10	276114	276123	0 %	0 %	40 %	60 %	440222715
5517	NC_020061	GTG	2	6	276127	276132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222715
5518	NC_020061	CCG	2	6	276200	276205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222715
5519	NC_020061	CGG	2	6	276244	276249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
5520	NC_020061	AAGATA	2	12	276255	276266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440222715
5521	NC_020061	GCG	2	6	276316	276321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
5522	NC_020061	TCG	2	6	276406	276411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222716
5523	NC_020061	GCG	3	9	276478	276486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
5524	NC_020061	GAT	2	6	276570	276575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
5525	NC_020061	CGAA	2	8	276658	276665	50 %	0 %	25 %	25 %	440222716
5526	NC_020061	GAT	2	6	276672	276677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
5527	NC_020061	CGG	2	6	276727	276732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
5528	NC_020061	TGG	2	6	276771	276776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222716
5529	NC_020061	CCG	2	6	276783	276788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222716
5530	NC_020061	TTG	2	6	276886	276891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222716
5531	NC_020061	GCC	2	6	276935	276940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222716
5532	NC_020061	TGA	2	6	277004	277009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
5533	NC_020061	TG	3	6	277041	277046	0 %	50 %	50 %	0 %	440222716
5534	NC_020061	CTG	2	6	277057	277062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222716
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5537	NC_020061	CAG	2	6	277137	277142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222716
5538	NC_020061	CG	3	6	277327	277332	0 %	0 %	50 %	50 %	440222716
5539	NC_020061	CG	4	8	277456	277463	0 %	0 %	50 %	50 %	440222716
5540	NC_020061	GAG	2	6	277467	277472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222716
5541	NC_020061	ACCAGG	2	12	277570	277581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222716
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5543	NC_020061	ACCCG	2	10	277659	277668	20 %	0 %	20 %	60 %	440222716
5544	NC_020061	AG	3	6	277733	277738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020061	GCG	2	6	277742	277747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_020061	CG	4	8	277789	277796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_020061	GCC	2	6	277825	277830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_020061	CAT	2	6	277917	277922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_020061	CGG	2	6	277969	277974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_020061	CGG	2	6	277984	277989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_020061	TGA	2	6	278030	278035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020061	GC	3	6	278044	278049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_020061	CAA	2	6	278101	278106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_020061	ATC	2	6	278114	278119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_020061	CGA	2	6	278149	278154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_020061	GCC	2	6	278162	278167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_020061	GCC	2	6	278185	278190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_020061	GCC	2	6	278198	278203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_020061	CGA	2	6	278230	278235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_020061	GGC	2	6	278283	278288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_020061	CGC	2	6	278416	278421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_020061	CCG	2	6	278468	278473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_020061	CTC	2	6	278477	278482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_020061	TAG	2	6	278495	278500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_020061	TGC	2	6	278544	278549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_020061	GCAA	2	8	278560	278567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_020061	GT	3	6	278604	278609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020061	TGA	2	6	278665	278670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_020061	TCCG	2	8	278745	278752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5572	NC_020061	AGG	2	6	278905	278910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222717
5573	NC_020061	CAT	2	6	278918	278923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222717
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5575	NC_020061	GGC	2	6	279002	279007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_020061	TCG	2	6	279092	279097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_020061	GCG	2	6	279116	279121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_020061	ATC	2	6	279274	279279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5590	NC_020061	GATC	2	8	280291	280298	25 %	25 %	25 %	25 %	440222718
5591	NC_020061	TGGC	2	8	280334	280341	0 %	25 %	50 %	25 %	440222718
5592	NC_020061	GGA	2	6	280370	280375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222718
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5607	NC_020061	CGT	2	6	281231	281236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222718
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5615	NC_020061	GCG	2	6	281613	281618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_020061	CTCC	2	8	281624	281631	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5617	NC_020061	ATC	2	6	281644	281649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5625	NC_020061	TCG	2	6	282168	282173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222719
5626	NC_020061	CCA	2	6	282181	282186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222719
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5634	NC_020061	CGTG	2	8	282589	282596	0 %	25 %	50 %	25 %	440222719
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5640	NC_020061	GGA	2	6	282914	282919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_020061	CTC	2	6	282945	282950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5642	NC_020061	GTTT	2	8	283055	283062	0 %	75 %	25 %	0 %	440222720
5643	NC_020061	ATG	2	6	283195	283200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5648	NC_020061	GAT	2	6	283686	283691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5651	NC_020061	CG	3	6	283859	283864	0 %	0 %	50 %	50 %	440222722
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5675	NC_020061	CGG	2	6	285255	285260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5691	NC_020061	ACA	2	6	285961	285966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222723
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5698	NC_020061	GGC	2	6	286392	286397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222724
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5727	NC_020061	GCCTG	2	10	287820	287829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5728	NC_020061	AGGCT	2	10	287845	287854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5729	NC_020061	CGC	2	6	287857	287862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5730	NC_020061	GCC	2	6	287902	287907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5742	NC_020061	TCG	2	6	288508	288513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222725
5743	NC_020061	CAT	2	6	288608	288613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222725
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5745	NC_020061	CTG	2	6	288663	288668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222725
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5863	NC_020061	GC	3	6	294137	294142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222732
5864	NC_020061	GAT	2	6	294183	294188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222732
5865	NC_020061	AAAG	2	8	294224	294231	75 %	0 %	25 %	0 %	440222732
5866	NC_020061	GCTCG	2	10	294256	294265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5868	NC_020061	TTG	2	6	294275	294280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5993	NC_020061	TC	3	6	300716	300721	0 %	50 %	0 %	50 %	440222739
5994	NC_020061	CGT	2	6	300809	300814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222739
5995	NC_020061	TTCA	2	8	300815	300822	25 %	50 %	0 %	25 %	440222739
5996	NC_020061	GC	3	6	300850	300855	0 %	0 %	50 %	50 %	440222739
5997	NC_020061	TCC	2	6	300899	300904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222739
5998	NC_020061	ACG	2	6	300928	300933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222739
5999	NC_020061	TAC	2	6	300956	300961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222739
6000	NC_020061	GGC	2	6	301047	301052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222739

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