MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 10932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020061	ACG	2	6	223377	223382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222660
4502	NC_020061	TGGC	2	8	223390	223397	0 %	25 %	50 %	25 %	440222660
4503	NC_020061	CAGA	2	8	223445	223452	50 %	0 %	25 %	25 %	440222660
4504	NC_020061	AAC	2	6	223574	223579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222660
4505	NC_020061	TCGG	2	8	223601	223608	0 %	25 %	50 %	25 %	440222660
4506	NC_020061	CAT	3	9	223642	223650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222660
4507	NC_020061	TGCC	2	8	223794	223801	0 %	25 %	25 %	50 %	440222660
4508	NC_020061	GCAT	2	8	223833	223840	25 %	25 %	25 %	25 %	440222660
4509	NC_020061	GGC	2	6	223906	223911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222660
4510	NC_020061	AGG	2	6	223917	223922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222660
4511	NC_020061	GCC	2	6	223946	223951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222660
4512	NC_020061	TCA	3	9	223953	223961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222660
4513	NC_020061	AGG	2	6	224072	224077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222660
4514	NC_020061	ATG	2	6	224112	224117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222661
4515	NC_020061	CCG	2	6	224193	224198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222661
4516	NC_020061	CGA	2	6	224300	224305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222661
4517	NC_020061	AC	3	6	224320	224325	50 %	0 %	0 %	50 %	440222661
4518	NC_020061	CCTT	2	8	224365	224372	0 %	50 %	0 %	50 %	440222661
4519	NC_020061	AGC	2	6	224377	224382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222661
4520	NC_020061	ACA	2	6	224383	224388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222661
4521	NC_020061	CGG	2	6	224399	224404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222661
4522	NC_020061	CTT	2	6	224477	224482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222661
4523	NC_020061	GGC	2	6	224539	224544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222661
4524	NC_020061	TCA	2	6	224554	224559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222661
4525	NC_020061	TCA	2	6	224575	224580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222661
4526	NC_020061	CGG	2	6	224615	224620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222661
4527	NC_020061	CTC	2	6	224625	224630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222661
4528	NC_020061	CAG	2	6	224642	224647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222661
4529	NC_020061	ATC	2	6	224667	224672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222661
4530	NC_020061	ACG	2	6	224676	224681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222661
4531	NC_020061	GGCC	2	8	224701	224708	0 %	0 %	50 %	50 %	440222661
4532	NC_020061	CCG	2	6	224730	224735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222661
4533	NC_020061	ACTC	2	8	224749	224756	25 %	25 %	0 %	50 %	440222661
4534	NC_020061	ACAA	2	8	224832	224839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_020061	CG	3	6	224885	224890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_020061	ATT	2	6	224980	224985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_020061	GCG	2	6	224996	225001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_020061	GAC	3	9	225016	225024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_020061	GCT	2	6	225027	225032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_020061	TGA	2	6	225041	225046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_020061	GCA	2	6	225207	225212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222662
4542	NC_020061	CGA	2	6	225229	225234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222662
4543	NC_020061	G	6	6	225378	225383	0 %	0 %	100 %	0 %	440222662
4544	NC_020061	GTC	2	6	225390	225395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222662
4545	NC_020061	CAG	2	6	225507	225512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222662
4546	NC_020061	TTG	2	6	225621	225626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222662
4547	NC_020061	TTCG	2	8	225808	225815	0 %	50 %	25 %	25 %	440222662
4548	NC_020061	ACG	2	6	225997	226002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_020061	GC	3	6	226018	226023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_020061	CAG	2	6	226036	226041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_020061	CAT	3	9	226122	226130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_020061	CCA	2	6	226145	226150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_020061	TGC	2	6	226172	226177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_020061	AGGA	2	8	226185	226192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_020061	GTC	2	6	226211	226216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_020061	CGCCGG	2	12	226272	226283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_020061	GAAAA	2	10	226293	226302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_020061	ATT	2	6	226340	226345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_020061	GCC	2	6	226347	226352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_020061	GTC	2	6	226363	226368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_020061	CCTG	2	8	226369	226376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_020061	GATC	2	8	226427	226434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_020061	ACGA	2	8	226492	226499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_020061	CGC	2	6	226534	226539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_020061	GC	3	6	226595	226600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_020061	AGA	2	6	226688	226693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_020061	GCC	2	6	226711	226716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_020061	CGA	2	6	226779	226784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_020061	CG	3	6	226826	226831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_020061	CAA	2	6	226867	226872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_020061	CT	3	6	226896	226901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_020061	ATC	2	6	226908	226913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_020061	GTG	2	6	227085	227090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222663
4574	NC_020061	CT	3	6	227205	227210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_020061	GTT	2	6	227214	227219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_020061	AGA	2	6	227251	227256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_020061	GTCC	2	8	227289	227296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_020061	TTG	2	6	227321	227326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_020061	ACC	2	6	227392	227397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222664
4580	NC_020061	GAA	2	6	227470	227475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222664
4581	NC_020061	A	8	8	227493	227500	100 %	0 %	0 %	0 %	440222664
4582	NC_020061	CG	3	6	227501	227506	0 %	0 %	50 %	50 %	440222664
4583	NC_020061	CTCG	2	8	227518	227525	0 %	25 %	25 %	50 %	440222664
4584	NC_020061	CG	3	6	227524	227529	0 %	0 %	50 %	50 %	440222664
4585	NC_020061	GCG	2	6	227665	227670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222664
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4587	NC_020061	GCT	2	6	227772	227777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222664
4588	NC_020061	CGC	2	6	227890	227895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_020061	ATC	2	6	227911	227916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_020061	CACT	2	8	227961	227968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_020061	CGGT	2	8	227976	227983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_020061	TCG	2	6	228001	228006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_020061	CCA	2	6	228070	228075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_020061	GCC	2	6	228123	228128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222665
4595	NC_020061	GC	3	6	228171	228176	0 %	0 %	50 %	50 %	440222665
4596	NC_020061	GC	3	6	228186	228191	0 %	0 %	50 %	50 %	440222665
4597	NC_020061	CCG	2	6	228198	228203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222665
4598	NC_020061	CCT	2	6	228214	228219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222665
4599	NC_020061	GCCACC	2	12	228246	228257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	440222665
4600	NC_020061	GCT	2	6	228258	228263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222665
4601	NC_020061	CGG	2	6	228294	228299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222665
4602	NC_020061	CGA	2	6	228316	228321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222665
4603	NC_020061	GGGCCG	2	12	228391	228402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222665
4604	NC_020061	TCGC	2	8	228449	228456	0 %	25 %	25 %	50 %	440222665
4605	NC_020061	TTC	2	6	228485	228490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222665
4606	NC_020061	GCT	2	6	228500	228505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222665
4607	NC_020061	GGC	2	6	228506	228511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222665
4608	NC_020061	TAC	3	9	228565	228573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222665
4609	NC_020061	TGAT	2	8	228578	228585	25 %	50 %	25 %	0 %	440222665
4610	NC_020061	AGG	2	6	228587	228592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222665
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4613	NC_020061	GCA	2	6	228747	228752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222665
4614	NC_020061	TTG	2	6	228805	228810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222665
4615	NC_020061	CAG	2	6	228826	228831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222665
4616	NC_020061	CATC	2	8	228972	228979	25 %	25 %	0 %	50 %	440222665
4617	NC_020061	CGGC	2	8	229086	229093	0 %	0 %	50 %	50 %	440222665
4618	NC_020061	GCC	2	6	229144	229149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222665
4619	NC_020061	CGG	2	6	229168	229173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222665
4620	NC_020061	AGCA	2	8	229247	229254	50 %	0 %	25 %	25 %	440222665
4621	NC_020061	GGT	2	6	229358	229363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222665
4622	NC_020061	CCG	2	6	229408	229413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_020061	T	6	6	229429	229434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_020061	AAGG	3	12	229441	229452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_020061	TTTTTC	2	12	229520	229531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4626	NC_020061	T	6	6	229539	229544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_020061	ACGC	2	8	229563	229570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_020061	CAA	2	6	229609	229614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_020061	GCT	2	6	229647	229652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_020061	ACTAA	2	10	229677	229686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4631	NC_020061	TTA	2	6	229697	229702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_020061	CTC	2	6	229835	229840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222666
4633	NC_020061	TCA	2	6	229917	229922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222666
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4635	NC_020061	CGTG	2	8	229962	229969	0 %	25 %	50 %	25 %	440222666
4636	NC_020061	GATCT	2	10	230007	230016	20 %	40 %	20 %	20 %	440222666
4637	NC_020061	GC	3	6	230074	230079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4638	NC_020061	GCA	2	6	230131	230136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4639	NC_020061	GCC	2	6	230153	230158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4640	NC_020061	TGAG	3	12	230166	230177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4641	NC_020061	GCC	2	6	230202	230207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4642	NC_020061	CG	3	6	230213	230218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4643	NC_020061	CT	3	6	230270	230275	0 %	50 %	0 %	50 %	440222667
4644	NC_020061	CGA	2	6	230291	230296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222667
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4646	NC_020061	CCGG	2	8	230388	230395	0 %	0 %	50 %	50 %	440222667
4647	NC_020061	GCC	2	6	230411	230416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222667
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4652	NC_020061	GCG	3	9	230788	230796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4653	NC_020061	AT	3	6	230979	230984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4654	NC_020061	T	6	6	230991	230996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4655	NC_020061	A	7	7	231001	231007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4656	NC_020061	T	6	6	231034	231039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4657	NC_020061	A	7	7	231121	231127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4658	NC_020061	GGA	2	6	231136	231141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4659	NC_020061	ATC	2	6	231211	231216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4660	NC_020061	AG	3	6	231230	231235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4661	NC_020061	ACC	2	6	231273	231278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4662	NC_020061	ATCGG	2	10	231319	231328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4663	NC_020061	GTGCG	2	10	231346	231355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4664	NC_020061	T	6	6	231389	231394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_020061	AAT	3	9	231443	231451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4686	NC_020061	CGA	2	6	232861	232866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222670
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4736	NC_020061	ATC	2	6	235514	235519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4737	NC_020061	CTA	2	6	235546	235551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4749	NC_020061	GAC	2	6	236164	236169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222673
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4751	NC_020061	TGCG	2	8	236288	236295	0 %	25 %	50 %	25 %	440222674
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4753	NC_020061	ATCT	2	8	236319	236326	25 %	50 %	0 %	25 %	440222674
4754	NC_020061	GAC	2	6	236334	236339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222674
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4757	NC_020061	GC	3	6	236603	236608	0 %	0 %	50 %	50 %	440222674
4758	NC_020061	GGC	2	6	236663	236668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222674
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4762	NC_020061	CAT	2	6	236852	236857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222674
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4791	NC_020061	GA	3	6	238231	238236	50 %	0 %	50 %	0 %	440222675
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4867	NC_020061	CGGGA	2	10	241965	241974	20 %	0 %	60 %	20 %	440222679
4868	NC_020061	TCG	2	6	241982	241987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222679
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4875	NC_020061	CGGC	3	12	242262	242273	0 %	0 %	50 %	50 %	440222679
4876	NC_020061	TTC	2	6	242326	242331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222679
4877	NC_020061	GCG	2	6	242349	242354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222679
4878	NC_020061	TGA	2	6	242396	242401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4879	NC_020061	CG	3	6	242499	242504	0 %	0 %	50 %	50 %	440222680
4880	NC_020061	GGC	2	6	242513	242518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222680
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4888	NC_020061	GCCA	2	8	242680	242687	25 %	0 %	25 %	50 %	440222680
4889	NC_020061	CG	3	6	242730	242735	0 %	0 %	50 %	50 %	440222680
4890	NC_020061	TCG	2	6	242878	242883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4999	NC_020061	CTT	2	6	248690	248695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222687
5000	NC_020061	CAG	2	6	248696	248701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222687

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