MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 4411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020060	GTC	2	6	176362	176367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3502	NC_020060	GC	3	6	176372	176377	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3503	NC_020060	GCG	2	6	176408	176413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3504	NC_020060	ACCAC	2	10	176579	176588	40 %	0 %	0 %	60 %	440228735
3505	NC_020060	TCG	2	6	176597	176602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3506	NC_020060	GAC	2	6	176610	176615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3507	NC_020060	GAT	2	6	176665	176670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3508	NC_020060	CTG	2	6	176676	176681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3509	NC_020060	TCA	2	6	176780	176785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3510	NC_020060	CCG	3	9	176789	176797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3511	NC_020060	GCC	2	6	176980	176985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3512	NC_020060	GCC	2	6	177010	177015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3513	NC_020060	CCG	2	6	177053	177058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3514	NC_020060	CGG	2	6	177107	177112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3515	NC_020060	TCG	2	6	177119	177124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3516	NC_020060	CGG	2	6	177218	177223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3517	NC_020060	ACCG	2	8	177244	177251	25 %	0 %	25 %	50 %	440228735
3518	NC_020060	ACGCC	2	10	177252	177261	20 %	0 %	20 %	60 %	440228735
3519	NC_020060	GTTG	2	8	177267	177274	0 %	50 %	50 %	0 %	440228735
3520	NC_020060	GCG	2	6	177336	177341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3521	NC_020060	CGT	2	6	177351	177356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3522	NC_020060	GCC	2	6	177367	177372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3523	NC_020060	AGA	2	6	177386	177391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228735
3524	NC_020060	GACC	2	8	177420	177427	25 %	0 %	25 %	50 %	440228735
3525	NC_020060	ACCG	2	8	177436	177443	25 %	0 %	25 %	50 %	440228735
3526	NC_020060	CAA	2	6	177471	177476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228735
3527	NC_020060	CAT	2	6	177573	177578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3528	NC_020060	TCG	2	6	177580	177585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3529	NC_020060	GACGAT	2	12	177624	177635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440228735
3530	NC_020060	GGC	2	6	177636	177641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3531	NC_020060	GGC	2	6	177717	177722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3532	NC_020060	GC	3	6	177721	177726	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3533	NC_020060	TCG	2	6	177761	177766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3534	NC_020060	TGA	2	6	177768	177773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3535	NC_020060	GCG	2	6	177817	177822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3536	NC_020060	ATC	3	9	177841	177849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3537	NC_020060	GCCGT	2	10	177874	177883	0 %	20 %	40 %	40 %	440228735
3538	NC_020060	GAT	2	6	177900	177905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3539	NC_020060	GAGCTC	2	12	177913	177924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3540	NC_020060	GAG	2	6	177928	177933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3541	NC_020060	CTG	2	6	177934	177939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3542	NC_020060	AAGG	2	8	177991	177998	50 %	0 %	50 %	0 %	440228735
3543	NC_020060	CTG	2	6	178042	178047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3544	NC_020060	ATC	2	6	178075	178080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3545	NC_020060	CCA	2	6	178118	178123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228735
3546	NC_020060	GAA	2	6	178206	178211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228735
3547	NC_020060	CCGG	2	8	178214	178221	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3548	NC_020060	GA	3	6	178265	178270	50 %	0 %	50 %	0 %	440228735
3549	NC_020060	ACG	3	9	178360	178368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3550	NC_020060	CCT	2	6	178418	178423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228735
3551	NC_020060	GGA	2	6	178482	178487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3552	NC_020060	GCC	2	6	178526	178531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3553	NC_020060	GAT	2	6	178578	178583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3554	NC_020060	CGA	2	6	178638	178643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3555	NC_020060	TCA	2	6	178658	178663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3556	NC_020060	TGC	2	6	178677	178682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3557	NC_020060	GACAAC	2	12	178708	178719	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440228735
3558	NC_020060	ACA	2	6	178727	178732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228735
3559	NC_020060	GCG	2	6	178831	178836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3560	NC_020060	GAT	2	6	178839	178844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3561	NC_020060	CGA	2	6	178911	178916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3562	NC_020060	AAG	2	6	178969	178974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228735
3563	NC_020060	GC	3	6	179007	179012	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3564	NC_020060	CAT	2	6	179092	179097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228735
3565	NC_020060	GCTC	2	8	179204	179211	0 %	25 %	25 %	50 %	440228735
3566	NC_020060	GCT	2	6	179215	179220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3567	NC_020060	AAC	2	6	179230	179235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228735
3568	NC_020060	CGC	2	6	179287	179292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3569	NC_020060	GCC	2	6	179314	179319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228735
3570	NC_020060	GC	3	6	179415	179420	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3571	NC_020060	ATG	2	6	179426	179431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3572	NC_020060	CTG	2	6	179540	179545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3573	NC_020060	TGG	2	6	179561	179566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228735
3574	NC_020060	GAG	2	6	179584	179589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3575	NC_020060	GCCG	2	8	179599	179606	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3576	NC_020060	TGA	2	6	179612	179617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3577	NC_020060	AGG	2	6	179648	179653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3578	NC_020060	CGG	2	6	179676	179681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3579	NC_020060	CTC	2	6	179743	179748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228735
3580	NC_020060	AGG	2	6	179768	179773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3581	NC_020060	TGA	3	9	179841	179849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228735
3582	NC_020060	GCG	2	6	179886	179891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3583	NC_020060	TCGC	2	8	179904	179911	0 %	25 %	25 %	50 %	440228735
3584	NC_020060	GGC	2	6	179917	179922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3585	NC_020060	GCG	2	6	179955	179960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228735
3586	NC_020060	GAG	2	6	179977	179982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3587	NC_020060	GC	3	6	179998	180003	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3588	NC_020060	GCA	2	6	180069	180074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_020060	AAT	2	6	180118	180123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_020060	CTC	2	6	180160	180165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_020060	GCC	2	6	180171	180176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3592	NC_020060	GCA	2	6	180177	180182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228736
3593	NC_020060	T	7	7	180246	180252	0 %	100 %	0 %	0 %	440228736
3594	NC_020060	GCC	2	6	180293	180298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3595	NC_020060	GCC	2	6	180305	180310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3596	NC_020060	AGGA	4	16	180336	180351	50 %	0 %	50 %	0 %	440228736
3597	NC_020060	CGC	2	6	180382	180387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3598	NC_020060	CCG	2	6	180398	180403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3599	NC_020060	GCA	2	6	180461	180466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228736
3600	NC_020060	GCC	2	6	180490	180495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228736
3601	NC_020060	ACA	2	6	180635	180640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228737
3602	NC_020060	AGTCGA	2	12	180647	180658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440228737
3603	NC_020060	CGC	2	6	180659	180664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228737
3604	NC_020060	GCC	2	6	180714	180719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228737
3605	NC_020060	CGC	2	6	180792	180797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228737
3606	NC_020060	TCG	3	9	180821	180829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228737
3607	NC_020060	GGC	2	6	180831	180836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228737
3608	NC_020060	GAT	2	6	180861	180866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228737
3609	NC_020060	CG	3	6	180876	180881	0 %	0 %	50 %	50 %	440228737
3610	NC_020060	TTGG	2	8	180935	180942	0 %	50 %	50 %	0 %	440228737
3611	NC_020060	GAG	2	6	180946	180951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228737
3612	NC_020060	AGC	3	9	181064	181072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228737
3613	NC_020060	CGC	2	6	181083	181088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228737
3614	NC_020060	GAG	2	6	181099	181104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228737
3615	NC_020060	GAA	2	6	181134	181139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228737
3616	NC_020060	TGG	2	6	181156	181161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228737
3617	NC_020060	GAT	2	6	181219	181224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228737
3618	NC_020060	CGGCC	2	10	181266	181275	0 %	0 %	40 %	60 %	440228737
3619	NC_020060	CAG	2	6	181324	181329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228737
3620	NC_020060	GCAA	2	8	181339	181346	50 %	0 %	25 %	25 %	440228737
3621	NC_020060	GAA	2	6	181353	181358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228737
3622	NC_020060	TCG	2	6	181367	181372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228737
3623	NC_020060	CAA	2	6	181377	181382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228737
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3652	NC_020060	CGG	3	9	182415	182423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3724	NC_020060	T	6	6	185598	185603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3725	NC_020060	ATGAA	2	10	185631	185640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3726	NC_020060	GC	4	8	185648	185655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3727	NC_020060	CGTTC	2	10	185665	185674	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3729	NC_020060	TCC	2	6	185718	185723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3731	NC_020060	CCG	2	6	185750	185755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3732	NC_020060	ATC	2	6	185882	185887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228742
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3740	NC_020060	GCCG	2	8	186367	186374	0 %	0 %	50 %	50 %	440228742
3741	NC_020060	CTA	2	6	186424	186429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228742
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3744	NC_020060	AGCG	2	8	186515	186522	25 %	0 %	50 %	25 %	440228742
3745	NC_020060	GC	3	6	186524	186529	0 %	0 %	50 %	50 %	440228742
3746	NC_020060	ATTG	2	8	186535	186542	25 %	50 %	25 %	0 %	440228742
3747	NC_020060	CGA	2	6	186649	186654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228742
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3758	NC_020060	GGACA	2	10	187041	187050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3766	NC_020060	CCG	2	6	187708	187713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3988	NC_020060	CGT	2	6	197287	197292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228755
3989	NC_020060	AGC	2	6	197416	197421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228755
3990	NC_020060	ATTG	2	8	197435	197442	25 %	50 %	25 %	0 %	440228756
3991	NC_020060	GTC	2	6	197451	197456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228756
3992	NC_020060	CTT	2	6	197490	197495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228756
3993	NC_020060	CCG	2	6	197548	197553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228756
3994	NC_020060	TCG	2	6	197622	197627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228756
3995	NC_020060	ATT	2	6	197642	197647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440228756
3996	NC_020060	TGG	2	6	197829	197834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228756
3997	NC_020060	CCG	2	6	197926	197931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228756
3998	NC_020060	TGATT	2	10	198029	198038	20 %	60 %	20 %	0 %	440228756
3999	NC_020060	GCG	2	6	198064	198069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228756
4000	NC_020060	ATT	2	6	198078	198083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440228756

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