MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 4411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020060	TCGG	2	8	151497	151504	0 %	25 %	50 %	25 %	440228714
3002	NC_020060	GCA	2	6	151580	151585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228714
3003	NC_020060	TGA	2	6	151679	151684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228714
3004	NC_020060	GT	3	6	151742	151747	0 %	50 %	50 %	0 %	440228714
3005	NC_020060	CTT	2	6	151832	151837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228714
3006	NC_020060	GAC	2	6	151854	151859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228714
3007	NC_020060	TGG	2	6	152144	152149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_020060	GAA	2	6	152188	152193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_020060	CGT	2	6	152400	152405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228715
3010	NC_020060	ACG	3	9	152450	152458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228715
3011	NC_020060	CCG	2	6	152504	152509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228715
3012	NC_020060	CGT	2	6	152550	152555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228715
3013	NC_020060	TGA	2	6	152742	152747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228715
3014	NC_020060	GGAT	2	8	152801	152808	25 %	25 %	50 %	0 %	440228715
3015	NC_020060	TCC	2	6	152817	152822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228715
3016	NC_020060	CCT	2	6	152835	152840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228715
3017	NC_020060	CGT	2	6	152922	152927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228715
3018	NC_020060	CAG	2	6	153043	153048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3019	NC_020060	ACA	2	6	153120	153125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228716
3020	NC_020060	TC	3	6	153127	153132	0 %	50 %	0 %	50 %	440228716
3021	NC_020060	CG	3	6	153180	153185	0 %	0 %	50 %	50 %	440228716
3022	NC_020060	TGA	2	6	153216	153221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228716
3023	NC_020060	TTC	2	6	153226	153231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228716
3024	NC_020060	GCG	2	6	153246	153251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228716
3025	NC_020060	CGT	2	6	153295	153300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3026	NC_020060	GCC	2	6	153301	153306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228716
3027	NC_020060	CGA	2	6	153492	153497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3028	NC_020060	CGAC	2	8	153567	153574	25 %	0 %	25 %	50 %	440228716
3029	NC_020060	ACG	2	6	153602	153607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3030	NC_020060	TCA	2	6	153621	153626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228716
3031	NC_020060	GCC	2	6	153644	153649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228716
3032	NC_020060	GAC	2	6	153679	153684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3033	NC_020060	CGC	2	6	153726	153731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228716
3034	NC_020060	TGCT	2	8	153767	153774	0 %	50 %	25 %	25 %	440228716
3035	NC_020060	CAA	2	6	153781	153786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228716
3036	NC_020060	CGG	2	6	153792	153797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228716
3037	NC_020060	TCC	2	6	153835	153840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228716
3038	NC_020060	ACG	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228716
3039	NC_020060	TTC	2	6	153928	153933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228716
3040	NC_020060	CA	3	6	154016	154021	50 %	0 %	0 %	50 %	440228716
3041	NC_020060	GGC	2	6	154192	154197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228717
3042	NC_020060	TCCA	2	8	154355	154362	25 %	25 %	0 %	50 %	440228717
3043	NC_020060	CAG	2	6	154375	154380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228717
3044	NC_020060	ATG	3	9	154384	154392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228717
3045	NC_020060	CTGC	2	8	154479	154486	0 %	25 %	25 %	50 %	440228717
3046	NC_020060	GAA	2	6	154542	154547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228717
3047	NC_020060	TCC	2	6	154551	154556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228717
3048	NC_020060	TCA	2	6	154586	154591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228717
3049	NC_020060	TCGCTT	2	12	154622	154633	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440228717
3050	NC_020060	CCG	2	6	154685	154690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228717
3051	NC_020060	TG	3	6	154701	154706	0 %	50 %	50 %	0 %	440228717
3052	NC_020060	ACA	2	6	154713	154718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228717
3053	NC_020060	CCT	2	6	154752	154757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228717
3054	NC_020060	CAG	2	6	154768	154773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228717
3055	NC_020060	GTC	2	6	154781	154786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228717
3056	NC_020060	CGA	2	6	154879	154884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228717
3057	NC_020060	GTCC	2	8	154974	154981	0 %	25 %	25 %	50 %	440228717
3058	NC_020060	CGC	2	6	154998	155003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228717
3059	NC_020060	CGC	2	6	155064	155069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228717
3060	NC_020060	TCC	2	6	155073	155078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_020060	CAT	2	6	155090	155095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_020060	GTG	2	6	155130	155135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_020060	CTG	2	6	155206	155211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3064	NC_020060	GGC	2	6	155248	155253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3065	NC_020060	GCC	2	6	155336	155341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3066	NC_020060	CGC	2	6	155353	155358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3067	NC_020060	CGA	2	6	155398	155403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3068	NC_020060	GGC	2	6	155497	155502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3069	NC_020060	TCG	2	6	155630	155635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3070	NC_020060	GAT	2	6	155644	155649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228718
3071	NC_020060	TGA	2	6	155807	155812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228718
3072	NC_020060	TCC	2	6	155828	155833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228718
3073	NC_020060	ACG	2	6	155835	155840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3074	NC_020060	CGCT	2	8	155849	155856	0 %	25 %	25 %	50 %	440228718
3075	NC_020060	GCG	2	6	155857	155862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3076	NC_020060	GA	3	6	155864	155869	50 %	0 %	50 %	0 %	440228718
3077	NC_020060	CTG	2	6	155882	155887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3078	NC_020060	TCG	2	6	155940	155945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3079	NC_020060	GCA	2	6	155955	155960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3080	NC_020060	TTG	2	6	155966	155971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228718
3081	NC_020060	GCC	2	6	155994	155999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3082	NC_020060	GATC	2	8	156012	156019	25 %	25 %	25 %	25 %	440228718
3083	NC_020060	CCAGC	2	10	156051	156060	20 %	0 %	20 %	60 %	440228718
3084	NC_020060	CGT	2	6	156162	156167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3085	NC_020060	TCTCGA	2	12	156168	156179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440228718
3086	NC_020060	TCA	2	6	156236	156241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228718
3087	NC_020060	GC	3	6	156242	156247	0 %	0 %	50 %	50 %	440228718
3088	NC_020060	CCG	2	6	156254	156259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3089	NC_020060	CGC	2	6	156290	156295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3090	NC_020060	GTC	2	6	156298	156303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3091	NC_020060	ACA	2	6	156314	156319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228718
3092	NC_020060	T	6	6	156322	156327	0 %	100 %	0 %	0 %	440228718
3093	NC_020060	ATC	2	6	156338	156343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228718
3094	NC_020060	CGA	2	6	156363	156368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3095	NC_020060	TGA	2	6	156387	156392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228718
3096	NC_020060	GC	3	6	156434	156439	0 %	0 %	50 %	50 %	440228718
3097	NC_020060	CGT	2	6	156454	156459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3098	NC_020060	CGA	2	6	156531	156536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3099	NC_020060	CCG	2	6	156567	156572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3100	NC_020060	AGGTCG	2	12	156602	156613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440228718
3101	NC_020060	CTT	2	6	156643	156648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228718
3102	NC_020060	GC	3	6	156709	156714	0 %	0 %	50 %	50 %	440228718
3103	NC_020060	TGA	2	6	156726	156731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228718
3104	NC_020060	GCT	2	6	156772	156777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3105	NC_020060	CGA	2	6	156813	156818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3106	NC_020060	CTTT	2	8	156822	156829	0 %	75 %	0 %	25 %	440228718
3107	NC_020060	GCC	2	6	157045	157050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3108	NC_020060	CGG	2	6	157080	157085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3109	NC_020060	GAA	2	6	157111	157116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228718
3110	NC_020060	GGC	2	6	157162	157167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3111	NC_020060	AG	3	6	157299	157304	50 %	0 %	50 %	0 %	440228718
3112	NC_020060	CAC	2	6	157318	157323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228718
3113	NC_020060	CCG	2	6	157365	157370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228718
3114	NC_020060	TGC	2	6	157409	157414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3115	NC_020060	TTC	2	6	157447	157452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228718
3116	NC_020060	TCG	2	6	157460	157465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228718
3117	NC_020060	CT	3	6	157471	157476	0 %	50 %	0 %	50 %	440228718
3118	NC_020060	GGC	2	6	157539	157544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228718
3119	NC_020060	ACA	2	6	157650	157655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228718
3120	NC_020060	GAA	2	6	157693	157698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_020060	TCA	2	6	157702	157707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_020060	ATC	2	6	157738	157743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_020060	GAC	2	6	157747	157752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_020060	TGTC	2	8	157775	157782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_020060	GTC	3	9	157970	157978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_020060	GTG	2	6	157979	157984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_020060	ATGG	2	8	158017	158024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_020060	AGA	2	6	158121	158126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228719
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3132	NC_020060	CGGGG	2	10	158272	158281	0 %	0 %	80 %	20 %	440228719
3133	NC_020060	CAGCG	2	10	158438	158447	20 %	0 %	40 %	40 %	440228719
3134	NC_020060	CGG	2	6	158496	158501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228719
3135	NC_020060	GGC	2	6	158656	158661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228719
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3139	NC_020060	GCTGG	2	10	158834	158843	0 %	20 %	60 %	20 %	440228719
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3142	NC_020060	CAAT	2	8	158976	158983	50 %	25 %	0 %	25 %	440228719
3143	NC_020060	ATC	2	6	158985	158990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228719
3144	NC_020060	TCA	2	6	159036	159041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228719
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3146	NC_020060	CAT	2	6	159118	159123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228719
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3152	NC_020060	C	6	6	159380	159385	0 %	0 %	0 %	100 %	440228719
3153	NC_020060	CGG	2	6	159457	159462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228719
3154	NC_020060	CGG	2	6	159483	159488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228719
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3159	NC_020060	GTC	2	6	159626	159631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228719
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3175	NC_020060	TGG	3	9	160597	160605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3177	NC_020060	GGC	2	6	160711	160716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3178	NC_020060	T	7	7	160772	160778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3180	NC_020060	GC	3	6	160933	160938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3181	NC_020060	GCA	2	6	160998	161003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3182	NC_020060	TATC	2	8	161128	161135	25 %	50 %	0 %	25 %	440228720
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3214	NC_020060	AATTG	2	10	162712	162721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3216	NC_020060	TCA	2	6	162776	162781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228722
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3231	NC_020060	GAT	2	6	163641	163646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228723
3232	NC_020060	CCG	2	6	163670	163675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228723
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3235	NC_020060	CGG	2	6	163714	163719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228723
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3240	NC_020060	CCA	2	6	163914	163919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228723
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3242	NC_020060	CCGAT	2	10	164003	164012	20 %	20 %	20 %	40 %	440228723
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3244	NC_020060	CAG	2	6	164135	164140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228723
3245	NC_020060	CGG	2	6	164147	164152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228723
3246	NC_020060	CGA	2	6	164192	164197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228723
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3273	NC_020060	GA	3	6	165540	165545	50 %	0 %	50 %	0 %	440228724
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3282	NC_020060	GCTG	2	8	165932	165939	0 %	25 %	50 %	25 %	440228724
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3334	NC_020060	CCA	2	6	168354	168359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3351	NC_020060	GGA	2	6	169541	169546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3352	NC_020060	GC	3	6	169579	169584	0 %	0 %	50 %	50 %	440228728
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3355	NC_020060	GC	3	6	169729	169734	0 %	0 %	50 %	50 %	440228728
3356	NC_020060	GTC	2	6	169766	169771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228728
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3359	NC_020060	ATC	2	6	169941	169946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228728
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3363	NC_020060	CGA	2	6	170165	170170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228728
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3365	NC_020060	CCT	2	6	170219	170224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228728
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3367	NC_020060	GTC	2	6	170370	170375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228728
3368	NC_020060	CAAT	2	8	170393	170400	50 %	25 %	0 %	25 %	440228728
3369	NC_020060	GGA	3	9	170411	170419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3487	NC_020060	CGAT	3	12	175789	175800	25 %	25 %	25 %	25 %	440228735
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3490	NC_020060	CTT	2	6	175974	175979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228735
3491	NC_020060	CGCAAG	2	12	175981	175992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3492	NC_020060	CCGG	2	8	176040	176047	0 %	0 %	50 %	50 %	440228735
3493	NC_020060	GGA	2	6	176052	176057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3494	NC_020060	GGT	2	6	176081	176086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228735
3495	NC_020060	GCA	2	6	176091	176096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228735
3496	NC_020060	GAG	2	6	176176	176181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3497	NC_020060	CTT	2	6	176212	176217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228735
3498	NC_020060	CCA	2	6	176246	176251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228735
3499	NC_020060	GGA	2	6	176265	176270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228735
3500	NC_020060	TCG	2	6	176285	176290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228735

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