MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 86090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020059	CG	3	6	544704	544709	0 %	0 %	50 %	50 %	440225406
12503	NC_020059	ATC	2	6	544923	544928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225406
12504	NC_020059	CAT	2	6	544985	544990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225406
12505	NC_020059	CGA	2	6	544993	544998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225406
12506	NC_020059	CGG	2	6	545098	545103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225406
12507	NC_020059	GCG	2	6	545184	545189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_020059	AGAA	2	8	545229	545236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020059	CGA	2	6	545326	545331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_020059	GCTC	2	8	545393	545400	0 %	25 %	25 %	50 %	440225407
12511	NC_020059	CCG	2	6	545444	545449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225407
12512	NC_020059	GCA	2	6	545490	545495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225407
12513	NC_020059	TCG	2	6	545578	545583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225407
12514	NC_020059	GCA	2	6	545588	545593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225407
12515	NC_020059	GGC	2	6	545648	545653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225407
12516	NC_020059	GC	3	6	545716	545721	0 %	0 %	50 %	50 %	440225407
12517	NC_020059	GC	3	6	545812	545817	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12518	NC_020059	GCC	2	6	545836	545841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225408
12519	NC_020059	GAT	2	6	545875	545880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225408
12520	NC_020059	GAC	2	6	545890	545895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225408
12521	NC_020059	CCG	2	6	545913	545918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225408
12522	NC_020059	GC	3	6	545933	545938	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12523	NC_020059	GCC	2	6	545968	545973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225408
12524	NC_020059	CGG	2	6	545982	545987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225408
12525	NC_020059	CGGAGG	2	12	546003	546014	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440225408
12526	NC_020059	CGA	2	6	546015	546020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225408
12527	NC_020059	AG	3	6	546105	546110	50 %	0 %	50 %	0 %	440225408
12528	NC_020059	GCCG	2	8	546226	546233	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12529	NC_020059	CGA	2	6	546246	546251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225408
12530	NC_020059	GACG	2	8	546253	546260	25 %	0 %	50 %	25 %	440225408
12531	NC_020059	GCC	3	9	546274	546282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225408
12532	NC_020059	GAA	2	6	546298	546303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225408
12533	NC_020059	CCGCA	2	10	546348	546357	20 %	0 %	20 %	60 %	440225408
12534	NC_020059	CGT	2	6	546369	546374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225408
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12536	NC_020059	CATC	2	8	546441	546448	25 %	25 %	0 %	50 %	440225408
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12538	NC_020059	GC	3	6	546459	546464	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12539	NC_020059	GCG	2	6	546526	546531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225408
12540	NC_020059	GCCG	2	8	546568	546575	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12541	NC_020059	CGA	2	6	546576	546581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225408
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12544	NC_020059	GCC	2	6	546640	546645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225408
12545	NC_020059	GCCG	2	8	546678	546685	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12546	NC_020059	AGC	2	6	546779	546784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225408
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12550	NC_020059	GC	3	6	546867	546872	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12551	NC_020059	CGTT	2	8	546902	546909	0 %	50 %	25 %	25 %	440225408
12552	NC_020059	GC	3	6	546914	546919	0 %	0 %	50 %	50 %	440225408
12553	NC_020059	GT	3	6	546972	546977	0 %	50 %	50 %	0 %	440225408
12554	NC_020059	GA	3	6	546994	546999	50 %	0 %	50 %	0 %	440225408
12555	NC_020059	CAT	2	6	547017	547022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_020059	T	7	7	547035	547041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_020059	TAA	2	6	547061	547066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020059	ATTT	2	8	547076	547083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_020059	GC	3	6	547130	547135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_020059	GGA	2	6	547144	547149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_020059	TGAA	2	8	547250	547257	50 %	25 %	25 %	0 %	440225409
12562	NC_020059	GCC	2	6	547283	547288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225409
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12587	NC_020059	TCGA	2	8	548237	548244	25 %	25 %	25 %	25 %	440225409
12588	NC_020059	AAGG	2	8	548249	548256	50 %	0 %	50 %	0 %	440225409
12589	NC_020059	CTG	2	6	548327	548332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12591	NC_020059	CGG	2	6	548416	548421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_020059	GGA	2	6	548445	548450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_020059	CGTCG	2	10	548507	548516	0 %	20 %	40 %	40 %	440225410
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12596	NC_020059	GCCG	2	8	548573	548580	0 %	0 %	50 %	50 %	440225410
12597	NC_020059	GCA	2	6	548675	548680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225410
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12602	NC_020059	GTC	2	6	548778	548783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225410
12603	NC_020059	CAT	2	6	548828	548833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225410
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12605	NC_020059	TCG	2	6	548881	548886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225410
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12608	NC_020059	GCGGT	2	10	549043	549052	0 %	20 %	60 %	20 %	440225410
12609	NC_020059	TGC	2	6	549079	549084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225410
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12621	NC_020059	GC	3	6	549755	549760	0 %	0 %	50 %	50 %	440225411
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12625	NC_020059	TGA	2	6	549939	549944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225411
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12631	NC_020059	CG	3	6	550119	550124	0 %	0 %	50 %	50 %	440225411
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12684	NC_020059	AT	3	6	552211	552216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12685	NC_020059	TAT	2	6	552223	552228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12733	NC_020059	CTC	2	6	554174	554179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12734	NC_020059	TC	3	6	554200	554205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12735	NC_020059	CT	3	6	554224	554229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12736	NC_020059	GAATG	2	10	554259	554268	40 %	20 %	40 %	0 %	440225416
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12862	NC_020059	GTTGAC	2	12	560171	560182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440225420
12863	NC_020059	GAC	3	9	560180	560188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225420
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12865	NC_020059	GCA	2	6	560230	560235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225420
12866	NC_020059	CAT	2	6	560243	560248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225420
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12870	NC_020059	GCGA	2	8	560406	560413	25 %	0 %	50 %	25 %	440225420
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12874	NC_020059	TCC	2	6	560526	560531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12875	NC_020059	CAC	2	6	560544	560549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12876	NC_020059	GCG	2	6	560565	560570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12877	NC_020059	T	7	7	560711	560717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12878	NC_020059	A	6	6	560727	560732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12881	NC_020059	AG	3	6	560874	560879	50 %	0 %	50 %	0 %	440225421
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12914	NC_020059	TGA	2	6	562497	562502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225424
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12917	NC_020059	GCA	2	6	562598	562603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225424
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12930	NC_020059	GCA	2	6	563234	563239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225425
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12932	NC_020059	CGGC	2	8	563297	563304	0 %	0 %	50 %	50 %	440225425
12933	NC_020059	TCT	2	6	563315	563320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225425
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12940	NC_020059	CGACGC	2	12	563543	563554	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440225425
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12950	NC_020059	CATGCT	2	12	563910	563921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440225425
12951	NC_020059	TCG	2	6	563926	563931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225425
12952	NC_020059	GCC	4	12	564131	564142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225426
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12961	NC_020059	CGATGG	2	12	564565	564576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440225426
12962	NC_020059	GTT	2	6	564635	564640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225426
12963	NC_020059	AGCG	2	8	564716	564723	25 %	0 %	50 %	25 %	440225426
12964	NC_020059	ATC	2	6	564774	564779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225426
12965	NC_020059	CGA	2	6	564784	564789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225426
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12967	NC_020059	CCG	2	6	564813	564818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225426
12968	NC_020059	GC	3	6	564827	564832	0 %	0 %	50 %	50 %	440225426
12969	NC_020059	TGC	2	6	564838	564843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225426
12970	NC_020059	GCA	2	6	564960	564965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225426
12971	NC_020059	ATCAGC	2	12	564978	564989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440225426
12972	NC_020059	CAG	2	6	565016	565021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225426
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12974	NC_020059	GAT	2	6	565058	565063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225426
12975	NC_020059	CAC	2	6	565090	565095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225426
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12977	NC_020059	GCC	2	6	565252	565257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12978	NC_020059	GAT	2	6	565264	565269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12979	NC_020059	ATG	2	6	565325	565330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12980	NC_020059	CAT	2	6	565359	565364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12981	NC_020059	AGC	2	6	565372	565377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12982	NC_020059	GCA	2	6	565476	565481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225427
12983	NC_020059	CTT	2	6	565518	565523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225427
12984	NC_020059	GAT	2	6	565558	565563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225427
12985	NC_020059	GTC	2	6	565597	565602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225427
12986	NC_020059	CAGT	2	8	565611	565618	25 %	25 %	25 %	25 %	440225427
12987	NC_020059	CGG	2	6	565620	565625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225427
12988	NC_020059	TGGTC	2	10	565674	565683	0 %	40 %	40 %	20 %	440225427
12989	NC_020059	CGC	2	6	565702	565707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225427
12990	NC_020059	CGC	2	6	565713	565718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225427
12991	NC_020059	GGT	2	6	565762	565767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225427
12992	NC_020059	AGGC	2	8	565773	565780	25 %	0 %	50 %	25 %	440225427
12993	NC_020059	GCC	2	6	565784	565789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225427
12994	NC_020059	GCC	3	9	565831	565839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225427
12995	NC_020059	GTT	2	6	565921	565926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225427
12996	NC_020059	GAC	2	6	565948	565953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225427
12997	NC_020059	TTG	2	6	565955	565960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225427
12998	NC_020059	CTT	2	6	565975	565980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225427
12999	NC_020059	CTG	2	6	565996	566001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225427
13000	NC_020059	TTC	2	6	566006	566011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225427

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