MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 86090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020059	GC	3	6	523235	523240	0 %	0 %	50 %	50 %	440225387
12003	NC_020059	CTGC	2	8	523256	523263	0 %	25 %	25 %	50 %	440225387
12004	NC_020059	TG	3	6	523264	523269	0 %	50 %	50 %	0 %	440225387
12005	NC_020059	CGC	2	6	523340	523345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225388
12006	NC_020059	CGT	2	6	523387	523392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12007	NC_020059	CAT	2	6	523402	523407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225388
12008	NC_020059	GAC	2	6	523420	523425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12009	NC_020059	GCT	2	6	523441	523446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12010	NC_020059	GTC	2	6	523589	523594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12011	NC_020059	GCT	2	6	523654	523659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12012	NC_020059	GCG	3	9	523683	523691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225388
12013	NC_020059	TGGC	2	8	523697	523704	0 %	25 %	50 %	25 %	440225388
12014	NC_020059	TCT	2	6	523740	523745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225388
12015	NC_020059	GCC	2	6	523802	523807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225388
12016	NC_020059	CGAT	2	8	523893	523900	25 %	25 %	25 %	25 %	440225388
12017	NC_020059	TCA	2	6	523911	523916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225388
12018	NC_020059	GGC	2	6	523942	523947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225388
12019	NC_020059	GCT	2	6	523948	523953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225388
12020	NC_020059	GCTG	2	8	523959	523966	0 %	25 %	50 %	25 %	440225388
12021	NC_020059	GATG	2	8	523969	523976	25 %	25 %	50 %	0 %	440225388
12022	NC_020059	GAT	2	6	524143	524148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225389
12023	NC_020059	GAT	2	6	524157	524162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225389
12024	NC_020059	CAGG	2	8	524184	524191	25 %	0 %	50 %	25 %	440225389
12025	NC_020059	TCG	2	6	524306	524311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225389
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12028	NC_020059	ATC	2	6	524489	524494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225390
12029	NC_020059	TAT	2	6	524510	524515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440225390
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12031	NC_020059	CGG	2	6	524589	524594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225390
12032	NC_020059	CGG	2	6	524605	524610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225390
12033	NC_020059	CACCG	2	10	524614	524623	20 %	0 %	20 %	60 %	440225390
12034	NC_020059	GCC	2	6	524654	524659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225390
12035	NC_020059	TGA	2	6	524664	524669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225390
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12041	NC_020059	GCA	2	6	524835	524840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225390
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12050	NC_020059	CGGCCT	2	12	525160	525171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440225390
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12052	NC_020059	TCA	2	6	525231	525236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225390
12053	NC_020059	CGGG	2	8	525300	525307	0 %	0 %	75 %	25 %	440225390
12054	NC_020059	GAT	2	6	525361	525366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225390
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12056	NC_020059	GAT	2	6	525460	525465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225390
12057	NC_020059	GGC	2	6	525466	525471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225390
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12059	NC_020059	GGGC	2	8	525565	525572	0 %	0 %	75 %	25 %	440225390
12060	NC_020059	GTC	2	6	525589	525594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225390
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12063	NC_020059	GCC	2	6	525661	525666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12064	NC_020059	CCG	2	6	525682	525687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12065	NC_020059	GTC	2	6	525701	525706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225391
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12089	NC_020059	GGCG	2	8	526716	526723	0 %	0 %	75 %	25 %	440225391
12090	NC_020059	TTG	2	6	526831	526836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225391
12091	NC_020059	CTGG	2	8	526878	526885	0 %	25 %	50 %	25 %	440225391
12092	NC_020059	TCG	2	6	526924	526929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225391
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12099	NC_020059	GT	3	6	527225	527230	0 %	50 %	50 %	0 %	440225391
12100	NC_020059	CG	3	6	527240	527245	0 %	0 %	50 %	50 %	440225391
12101	NC_020059	CGG	2	6	527327	527332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225391
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12112	NC_020059	TCGCG	2	10	527613	527622	0 %	20 %	40 %	40 %	440225392
12113	NC_020059	CTT	2	6	527680	527685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225392
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12117	NC_020059	CGGC	2	8	527846	527853	0 %	0 %	50 %	50 %	440225392
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12233	NC_020059	TCC	2	6	532578	532583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12237	NC_020059	CA	3	6	532800	532805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12238	NC_020059	GGA	2	6	532814	532819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12246	NC_020059	CTCAT	2	10	533321	533330	20 %	40 %	0 %	40 %	440225395
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12351	NC_020059	GCAA	2	8	537862	537869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12355	NC_020059	AAC	2	6	537956	537961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440225400
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12359	NC_020059	CCG	2	6	538075	538080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225400
12360	NC_020059	TCA	2	6	538103	538108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225400
12361	NC_020059	GGC	2	6	538126	538131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225400
12362	NC_020059	GCTATC	2	12	538186	538197	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440225400
12363	NC_020059	TGG	2	6	538227	538232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225400
12364	NC_020059	ATC	2	6	538263	538268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225400
12365	NC_020059	GCC	2	6	538286	538291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225400
12366	NC_020059	GC	3	6	538300	538305	0 %	0 %	50 %	50 %	440225400
12367	NC_020059	TTTC	2	8	538446	538453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12368	NC_020059	CGG	2	6	538562	538567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225401
12369	NC_020059	GCC	2	6	538607	538612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225401
12370	NC_020059	CGGT	2	8	538618	538625	0 %	25 %	50 %	25 %	440225401
12371	NC_020059	GGC	2	6	538631	538636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225401
12372	NC_020059	GCT	2	6	538659	538664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12373	NC_020059	CAG	2	6	538688	538693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12374	NC_020059	GCG	2	6	538782	538787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225401
12375	NC_020059	AGC	2	6	538845	538850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225401
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12377	NC_020059	GCT	2	6	538946	538951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12378	NC_020059	CG	3	6	538963	538968	0 %	0 %	50 %	50 %	440225401
12379	NC_020059	GCA	2	6	538993	538998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12380	NC_020059	TTG	2	6	539100	539105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440225401
12381	NC_020059	GC	3	6	539153	539158	0 %	0 %	50 %	50 %	440225401
12382	NC_020059	TGC	2	6	539216	539221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12383	NC_020059	GCGAT	2	10	539263	539272	20 %	20 %	40 %	20 %	440225401
12384	NC_020059	GAC	2	6	539273	539278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225401
12385	NC_020059	GCC	2	6	539307	539312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225401
12386	NC_020059	GCG	2	6	539365	539370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225401
12387	NC_020059	ACA	2	6	539503	539508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12388	NC_020059	TCA	2	6	539578	539583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12389	NC_020059	GAC	2	6	539616	539621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225402
12390	NC_020059	TTC	2	6	539650	539655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225402
12391	NC_020059	GCG	2	6	539686	539691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225402
12392	NC_020059	TGA	2	6	539723	539728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225402
12393	NC_020059	CGAT	2	8	539744	539751	25 %	25 %	25 %	25 %	440225402
12394	NC_020059	GCT	2	6	539799	539804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225402
12395	NC_020059	GC	3	6	539825	539830	0 %	0 %	50 %	50 %	440225402
12396	NC_020059	TCG	2	6	539837	539842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225402
12397	NC_020059	GAG	2	6	539851	539856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225402
12398	NC_020059	CGG	2	6	539885	539890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225402
12399	NC_020059	GCG	2	6	539911	539916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225402
12400	NC_020059	GCT	2	6	539979	539984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225402
12401	NC_020059	GCC	2	6	539991	539996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225402
12402	NC_020059	TCG	2	6	540014	540019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225402
12403	NC_020059	GAG	2	6	540047	540052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225402
12404	NC_020059	CGG	2	6	540135	540140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225402
12405	NC_020059	CCG	2	6	540157	540162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225402
12406	NC_020059	ATC	2	6	540208	540213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225402
12407	NC_020059	GA	3	6	540236	540241	50 %	0 %	50 %	0 %	440225402
12408	NC_020059	GGC	2	6	540282	540287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12409	NC_020059	AAGG	2	8	540346	540353	50 %	0 %	50 %	0 %	440225403
12410	NC_020059	GCC	3	9	540397	540405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225403
12411	NC_020059	GGC	2	6	540462	540467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225403
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12413	NC_020059	ATT	2	6	540494	540499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440225403
12414	NC_020059	GCC	2	6	540523	540528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225403
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12416	NC_020059	TCG	2	6	540593	540598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225403
12417	NC_020059	GCC	2	6	540610	540615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225403
12418	NC_020059	TCG	2	6	540665	540670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225403
12419	NC_020059	AGG	2	6	540773	540778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225403
12420	NC_020059	GCG	3	9	540802	540810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225403
12421	NC_020059	TGC	2	6	540821	540826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225403
12422	NC_020059	CGG	2	6	540831	540836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225403
12423	NC_020059	TCGC	2	8	540881	540888	0 %	25 %	25 %	50 %	440225403
12424	NC_020059	GCC	2	6	540978	540983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12425	NC_020059	TGCAT	2	10	541015	541024	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12426	NC_020059	GTA	2	6	541045	541050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12427	NC_020059	TC	3	6	541067	541072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12428	NC_020059	CTC	2	6	541109	541114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12429	NC_020059	CGG	2	6	541210	541215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225404
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12431	NC_020059	CAG	2	6	541505	541510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225404
12432	NC_020059	CGG	2	6	541587	541592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225404
12433	NC_020059	CAT	2	6	541633	541638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225404
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12436	NC_020059	TCG	2	6	541731	541736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225404
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12438	NC_020059	AAGG	2	8	541826	541833	50 %	0 %	50 %	0 %	440225404
12439	NC_020059	GCT	2	6	541837	541842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225404
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12441	NC_020059	TGC	2	6	541920	541925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225404
12442	NC_020059	GGA	2	6	541957	541962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440225404
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12446	NC_020059	GGAA	2	8	542020	542027	50 %	0 %	50 %	0 %	440225404
12447	NC_020059	A	6	6	542026	542031	100 %	0 %	0 %	0 %	440225404
12448	NC_020059	GCT	2	6	542042	542047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225404
12449	NC_020059	CCGG	2	8	542063	542070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12450	NC_020059	CCGG	2	8	542084	542091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12451	NC_020059	ACG	2	6	542121	542126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12452	NC_020059	GCAAT	2	10	542236	542245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12453	NC_020059	TGC	2	6	542254	542259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12454	NC_020059	CTC	3	9	542324	542332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12455	NC_020059	CTC	4	12	542360	542371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12456	NC_020059	TCC	3	9	542405	542413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12457	NC_020059	CTT	2	6	542423	542428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12458	NC_020059	T	7	7	542427	542433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12459	NC_020059	GTGA	2	8	542445	542452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12460	NC_020059	ATG	2	6	542600	542605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225405
12461	NC_020059	TCGC	2	8	542675	542682	0 %	25 %	25 %	50 %	440225405
12462	NC_020059	GCC	2	6	542691	542696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225405
12463	NC_020059	CCT	2	6	542752	542757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225405
12464	NC_020059	CGA	2	6	542763	542768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225405
12465	NC_020059	GAA	2	6	542920	542925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225405
12466	NC_020059	ACG	2	6	542933	542938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225405
12467	NC_020059	CAA	2	6	543034	543039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440225405
12468	NC_020059	CG	3	6	543126	543131	0 %	0 %	50 %	50 %	440225405
12469	NC_020059	CTCG	2	8	543184	543191	0 %	25 %	25 %	50 %	440225405
12470	NC_020059	TGC	2	6	543198	543203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225405
12471	NC_020059	CGC	2	6	543211	543216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225405
12472	NC_020059	CAA	2	6	543328	543333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440225405
12473	NC_020059	GCA	2	6	543386	543391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225405
12474	NC_020059	CG	3	6	543440	543445	0 %	0 %	50 %	50 %	440225405
12475	NC_020059	GTG	2	6	543617	543622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225405
12476	NC_020059	CG	3	6	543785	543790	0 %	0 %	50 %	50 %	440225405
12477	NC_020059	CGGC	2	8	543825	543832	0 %	0 %	50 %	50 %	440225405
12478	NC_020059	GCA	2	6	543873	543878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225405
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12480	NC_020059	AGC	2	6	543921	543926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12481	NC_020059	TGC	2	6	543939	543944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12482	NC_020059	AT	3	6	543974	543979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12483	NC_020059	TTGG	2	8	544013	544020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12484	NC_020059	TG	3	6	544056	544061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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