MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_019678	TTA	2	6	852170	852175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734265
18503	NC_019678	T	8	8	852235	852242	0 %	100 %	0 %	0 %	427734265
18504	NC_019678	TCT	2	6	852247	852252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734265
18505	NC_019678	TAA	2	6	852291	852296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18506	NC_019678	AAC	2	6	852316	852321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734265
18507	NC_019678	AAAT	2	8	852338	852345	75 %	25 %	0 %	0 %	427734265
18508	NC_019678	ATA	2	6	852357	852362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18509	NC_019678	ATT	3	9	852369	852377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734265
18510	NC_019678	CAC	2	6	852434	852439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734265
18511	NC_019678	AAAT	2	8	852491	852498	75 %	25 %	0 %	0 %	427734265
18512	NC_019678	ACA	2	6	852506	852511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734265
18513	NC_019678	GGC	2	6	852533	852538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734265
18514	NC_019678	TGC	2	6	852541	852546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734265
18515	NC_019678	A	7	7	852580	852586	100 %	0 %	0 %	0 %	427734265
18516	NC_019678	AAG	2	6	852604	852609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734265
18517	NC_019678	AT	3	6	852644	852649	50 %	50 %	0 %	0 %	427734265
18518	NC_019678	TAA	2	6	852678	852683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18519	NC_019678	AAC	2	6	852697	852702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734265
18520	NC_019678	CAAGC	2	10	852785	852794	40 %	0 %	20 %	40 %	427734265
18521	NC_019678	TAA	2	6	852807	852812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18522	NC_019678	TAC	2	6	852851	852856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734265
18523	NC_019678	AACG	2	8	852872	852879	50 %	0 %	25 %	25 %	427734265
18524	NC_019678	TGA	2	6	852946	852951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734265
18525	NC_019678	TCA	2	6	853021	853026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734265
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18527	NC_019678	TAA	2	6	853056	853061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18528	NC_019678	GCA	2	6	853070	853075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734265
18529	NC_019678	TAA	2	6	853083	853088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734265
18530	NC_019678	TAA	2	6	853166	853171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_019678	TAAT	2	8	853195	853202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_019678	CCAG	2	8	853279	853286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18533	NC_019678	AAAC	2	8	853341	853348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18534	NC_019678	ACTG	2	8	853365	853372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18535	NC_019678	GAT	2	6	853467	853472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734266
18536	NC_019678	GAT	2	6	853512	853517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734266
18537	NC_019678	TGC	2	6	853558	853563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734266
18538	NC_019678	ATG	2	6	853584	853589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734266
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18540	NC_019678	ATT	2	6	853690	853695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734266
18541	NC_019678	TGG	2	6	853832	853837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734266
18542	NC_019678	TAG	2	6	853901	853906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734266
18543	NC_019678	CTC	2	6	853963	853968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734266
18544	NC_019678	ATCA	2	8	853984	853991	50 %	25 %	0 %	25 %	427734266
18545	NC_019678	TCC	2	6	854005	854010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734266
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18548	NC_019678	AAG	2	6	854153	854158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_019678	TTGA	2	8	854207	854214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_019678	ACT	2	6	854336	854341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734267
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18553	NC_019678	CAG	2	6	854406	854411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734267
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18555	NC_019678	GCA	2	6	854490	854495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734267
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18557	NC_019678	A	6	6	854556	854561	100 %	0 %	0 %	0 %	427734267
18558	NC_019678	GGT	2	6	854562	854567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734267
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18562	NC_019678	CAG	2	6	854662	854667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734267
18563	NC_019678	TAG	2	6	854695	854700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734267
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18566	NC_019678	GTT	2	6	854834	854839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_019678	GTT	2	6	854841	854846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_019678	TAA	2	6	854886	854891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_019678	GAA	2	6	854913	854918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_019678	CTAA	2	8	854978	854985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18571	NC_019678	AAT	2	6	855008	855013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18578	NC_019678	TAA	2	6	855357	855362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734268
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18589	NC_019678	ACTA	2	8	855844	855851	50 %	25 %	0 %	25 %	427734268
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18591	NC_019678	TAA	2	6	855970	855975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_019678	A	6	6	856016	856021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_019678	AAT	2	6	856062	856067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_019678	ATT	2	6	856087	856092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_019678	A	6	6	856113	856118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18602	NC_019678	TA	3	6	856302	856307	50 %	50 %	0 %	0 %	427734269
18603	NC_019678	CAA	2	6	856330	856335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734269
18604	NC_019678	AGC	2	6	856451	856456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734269
18605	NC_019678	A	8	8	856490	856497	100 %	0 %	0 %	0 %	427734269
18606	NC_019678	CCAA	2	8	856549	856556	50 %	0 %	0 %	50 %	427734269
18607	NC_019678	AGATTT	2	12	856640	856651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427734269
18608	NC_019678	CAAA	2	8	856658	856665	75 %	0 %	0 %	25 %	427734269
18609	NC_019678	AGA	2	6	856667	856672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734269
18610	NC_019678	AC	4	8	856725	856732	50 %	0 %	0 %	50 %	427734269
18611	NC_019678	AGC	2	6	856793	856798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734269
18612	NC_019678	TCC	2	6	856835	856840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734269
18613	NC_019678	TAC	2	6	856931	856936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734269
18614	NC_019678	CAT	2	6	856957	856962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734269
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18616	NC_019678	TTAA	2	8	857019	857026	50 %	50 %	0 %	0 %	427734269
18617	NC_019678	AGT	2	6	857120	857125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734269
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18620	NC_019678	ACA	2	6	857405	857410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734270
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