MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_019678	CTA	2	6	620322	620327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734086
13502	NC_019678	CAT	2	6	620328	620333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734086
13503	NC_019678	AAT	2	6	620337	620342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734086
13504	NC_019678	ATTTG	2	10	620398	620407	20 %	60 %	20 %	0 %	427734086
13505	NC_019678	CTT	2	6	620418	620423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734086
13506	NC_019678	CAA	2	6	620667	620672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734086
13507	NC_019678	CTAA	2	8	620696	620703	50 %	25 %	0 %	25 %	427734086
13508	NC_019678	TAG	2	6	620732	620737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734086
13509	NC_019678	AAT	2	6	620792	620797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734086
13510	NC_019678	TCT	2	6	620924	620929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734086
13511	NC_019678	AGAA	2	8	621052	621059	75 %	0 %	25 %	0 %	427734086
13512	NC_019678	CTT	2	6	621222	621227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734086
13513	NC_019678	T	6	6	621264	621269	0 %	100 %	0 %	0 %	427734086
13514	NC_019678	T	7	7	621337	621343	0 %	100 %	0 %	0 %	427734087
13515	NC_019678	AGC	2	6	621358	621363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734087
13516	NC_019678	CTA	2	6	621367	621372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734087
13517	NC_019678	ACA	2	6	621471	621476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734087
13518	NC_019678	TAG	2	6	621621	621626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734087
13519	NC_019678	TTGC	2	8	621656	621663	0 %	50 %	25 %	25 %	427734087
13520	NC_019678	TCA	3	9	621687	621695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734087
13521	NC_019678	G	6	6	621719	621724	0 %	0 %	100 %	0 %	427734087
13522	NC_019678	CTTTT	2	10	621729	621738	0 %	80 %	0 %	20 %	427734087
13523	NC_019678	CTT	2	6	621744	621749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734087
13524	NC_019678	CGG	2	6	621808	621813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734087
13525	NC_019678	CAC	2	6	621820	621825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734087
13526	NC_019678	TTGT	2	8	621928	621935	0 %	75 %	25 %	0 %	427734087
13527	NC_019678	CGC	2	6	621981	621986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427734087
13528	NC_019678	GAA	2	6	622078	622083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734087
13529	NC_019678	GGT	3	9	622197	622205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734087
13530	NC_019678	ATAA	2	8	622214	622221	75 %	25 %	0 %	0 %	427734087
13531	NC_019678	TC	3	6	622350	622355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13532	NC_019678	TTAG	2	8	622457	622464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_019678	TTTCG	2	10	622478	622487	0 %	60 %	20 %	20 %	427734088
13534	NC_019678	GAA	2	6	622548	622553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734088
13535	NC_019678	AAAGT	2	10	622567	622576	60 %	20 %	20 %	0 %	427734088
13536	NC_019678	AGA	3	9	622598	622606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734088
13537	NC_019678	CAT	2	6	622614	622619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734088
13538	NC_019678	CTG	2	6	622662	622667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734088
13539	NC_019678	AAG	2	6	622674	622679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734088
13540	NC_019678	GTG	2	6	622725	622730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734088
13541	NC_019678	CCCAT	2	10	622908	622917	20 %	20 %	0 %	60 %	427734088
13542	NC_019678	GCT	2	6	622943	622948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734088
13543	NC_019678	ACT	2	6	623122	623127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734088
13544	NC_019678	AGT	2	6	623271	623276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734088
13545	NC_019678	CACT	2	8	623463	623470	25 %	25 %	0 %	50 %	427734088
13546	NC_019678	AAT	2	6	623488	623493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734088
13547	NC_019678	ATTT	2	8	623719	623726	25 %	75 %	0 %	0 %	427734088
13548	NC_019678	TTG	2	6	623739	623744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734088
13549	NC_019678	TAA	3	9	623784	623792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734088
13550	NC_019678	TCT	2	6	623819	623824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734088
13551	NC_019678	AAAT	2	8	623868	623875	75 %	25 %	0 %	0 %	427734088
13552	NC_019678	CAC	2	6	623904	623909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734088
13553	NC_019678	TAT	2	6	623979	623984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734088
13554	NC_019678	ATT	2	6	624051	624056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_019678	T	6	6	624070	624075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_019678	ATT	2	6	624101	624106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_019678	ACT	2	6	624111	624116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_019678	TTAAT	2	10	624155	624164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_019678	TAAT	2	8	624169	624176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_019678	TCA	2	6	624252	624257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_019678	AAT	2	6	624369	624374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734089
13562	NC_019678	TGG	2	6	624412	624417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734089
13563	NC_019678	GAC	2	6	624444	624449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734089
13564	NC_019678	CATC	2	8	624460	624467	25 %	25 %	0 %	50 %	427734089
13565	NC_019678	TA	3	6	624468	624473	50 %	50 %	0 %	0 %	427734089
13566	NC_019678	CAATC	2	10	624550	624559	40 %	20 %	0 %	40 %	427734089
13567	NC_019678	ATCTT	2	10	624572	624581	20 %	60 %	0 %	20 %	427734089
13568	NC_019678	CCAT	2	8	624591	624598	25 %	25 %	0 %	50 %	427734089
13569	NC_019678	ATACAA	2	12	624624	624635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427734089
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13572	NC_019678	TTC	2	6	624742	624747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734089
13573	NC_019678	CTT	2	6	624889	624894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734089
13574	NC_019678	CAT	2	6	624895	624900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734089
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13576	NC_019678	GCT	2	6	625268	625273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_019678	ATT	2	6	625301	625306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_019678	TAT	2	6	625328	625333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_019678	T	7	7	625361	625367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_019678	TA	3	6	625389	625394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_019678	AAGT	2	8	625402	625409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_019678	TAC	2	6	625428	625433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13587	NC_019678	ATA	2	6	625560	625565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_019678	T	6	6	625581	625586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_019678	AAT	2	6	625595	625600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_019678	A	7	7	625657	625663	100 %	0 %	0 %	0 %	427734090
13591	NC_019678	TCT	2	6	625682	625687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734090
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13596	NC_019678	ATT	2	6	625900	625905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_019678	TAT	2	6	625950	625955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_019678	TAA	2	6	625974	625979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_019678	TCT	2	6	625980	625985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_019678	AAT	2	6	625999	626004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_019678	AT	6	12	626003	626014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_019678	GTATTG	2	12	626022	626033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_019678	AT	3	6	626048	626053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_019678	A	6	6	626067	626072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_019678	TAA	2	6	626088	626093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_019678	TAT	2	6	626099	626104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_019678	CAT	2	6	626130	626135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_019678	TTA	2	6	626144	626149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_019678	TA	3	6	626158	626163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_019678	TAA	2	6	626166	626171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_019678	CCT	2	6	626237	626242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13612	NC_019678	AATA	2	8	626249	626256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_019678	AAT	2	6	626341	626346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_019678	TC	5	10	626355	626364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13615	NC_019678	CTT	2	6	626365	626370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_019678	T	7	7	626398	626404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_019678	CTC	2	6	626498	626503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13618	NC_019678	T	7	7	626562	626568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_019678	TGTAGC	2	12	626585	626596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13620	NC_019678	TAT	2	6	626763	626768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_019678	CTA	2	6	626792	626797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_019678	TATTT	2	10	626836	626845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_019678	T	6	6	626843	626848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_019678	GA	3	6	626860	626865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13626	NC_019678	CTG	2	6	626903	626908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13997	NC_019678	AGA	2	6	643431	643436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734106
13998	NC_019678	A	6	6	643440	643445	100 %	0 %	0 %	0 %	427734106
13999	NC_019678	AGC	2	6	643470	643475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734106
14000	NC_019678	T	6	6	643607	643612	0 %	100 %	0 %	0 %	427734106

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