MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_019678	AT	3	6	6266541	6266546	50 %	50 %	0 %	0 %	427738412
135002	NC_019678	TTA	2	6	6266587	6266592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135003	NC_019678	TCT	2	6	6266625	6266630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738412
135004	NC_019678	ATTC	2	8	6266671	6266678	25 %	50 %	0 %	25 %	427738412
135005	NC_019678	ATC	2	6	6266693	6266698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738412
135006	NC_019678	TTTTA	2	10	6266711	6266720	20 %	80 %	0 %	0 %	427738412
135007	NC_019678	AT	3	6	6266721	6266726	50 %	50 %	0 %	0 %	427738412
135008	NC_019678	TAA	3	9	6266783	6266791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738412
135009	NC_019678	ATT	2	6	6266859	6266864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135010	NC_019678	ATT	3	9	6266918	6266926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135011	NC_019678	GCTC	2	8	6266967	6266974	0 %	25 %	25 %	50 %	427738412
135012	NC_019678	ATT	2	6	6267008	6267013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135013	NC_019678	TCT	2	6	6267057	6267062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738412
135014	NC_019678	CTT	2	6	6267131	6267136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738412
135015	NC_019678	CTT	2	6	6267151	6267156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738412
135016	NC_019678	CAA	2	6	6267209	6267214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427738412
135017	NC_019678	GCTTGA	2	12	6267255	6267266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427738412
135018	NC_019678	TTAA	2	8	6267267	6267274	50 %	50 %	0 %	0 %	427738412
135019	NC_019678	TCA	2	6	6267294	6267299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738412
135020	NC_019678	TG	3	6	6267318	6267323	0 %	50 %	50 %	0 %	427738412
135021	NC_019678	TTA	2	6	6267468	6267473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135022	NC_019678	GTTT	2	8	6267501	6267508	0 %	75 %	25 %	0 %	427738412
135023	NC_019678	TGG	2	6	6267546	6267551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427738412
135024	NC_019678	T	6	6	6267560	6267565	0 %	100 %	0 %	0 %	427738412
135025	NC_019678	ATT	2	6	6267572	6267577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738412
135026	NC_019678	TGC	2	6	6267597	6267602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427738412
135027	NC_019678	TTG	2	6	6267683	6267688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738412
135028	NC_019678	TCG	2	6	6267782	6267787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427738412
135029	NC_019678	TTC	2	6	6267795	6267800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738412
135030	NC_019678	TTC	2	6	6267855	6267860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738413
135031	NC_019678	TC	3	6	6267859	6267864	0 %	50 %	0 %	50 %	427738413
135032	NC_019678	CAAT	2	8	6267893	6267900	50 %	25 %	0 %	25 %	427738413
135033	NC_019678	ATT	2	6	6267913	6267918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738413
135034	NC_019678	CAAACC	2	12	6267934	6267945	50 %	0 %	0 %	50 %	427738413
135035	NC_019678	ATT	2	6	6268003	6268008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738413
135036	NC_019678	T	6	6	6268052	6268057	0 %	100 %	0 %	0 %	427738413
135037	NC_019678	CAG	2	6	6268092	6268097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738413
135038	NC_019678	CCT	2	6	6268160	6268165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427738413
135039	NC_019678	TCTG	2	8	6268195	6268202	0 %	50 %	25 %	25 %	427738413
135040	NC_019678	ATA	2	6	6268227	6268232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738413
135041	NC_019678	ACG	2	6	6268252	6268257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738413
135042	NC_019678	AATT	2	8	6268311	6268318	50 %	50 %	0 %	0 %	427738413
135043	NC_019678	CCA	2	6	6268334	6268339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427738413
135044	NC_019678	CTAAA	2	10	6268344	6268353	60 %	20 %	0 %	20 %	427738413
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135046	NC_019678	A	6	6	6268405	6268410	100 %	0 %	0 %	0 %	427738413
135047	NC_019678	CAG	2	6	6268452	6268457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738413
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135049	NC_019678	TTG	2	6	6268540	6268545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738413
135050	NC_019678	ATT	2	6	6268559	6268564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738413
135051	NC_019678	ATA	2	6	6268585	6268590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738413
135052	NC_019678	T	6	6	6268615	6268620	0 %	100 %	0 %	0 %	427738413
135053	NC_019678	AGG	2	6	6268624	6268629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427738413
135054	NC_019678	TGT	2	6	6268648	6268653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738413
135055	NC_019678	TAC	2	6	6268722	6268727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738413
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135057	NC_019678	CAG	2	6	6268929	6268934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738413
135058	NC_019678	CTGAGT	2	12	6268955	6268966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427738413
135059	NC_019678	GTAT	2	8	6269034	6269041	25 %	50 %	25 %	0 %	427738413
135060	NC_019678	TTC	2	6	6269266	6269271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738413
135061	NC_019678	CTTC	2	8	6269288	6269295	0 %	50 %	0 %	50 %	427738413
135062	NC_019678	AAC	2	6	6269311	6269316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427738413
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135065	NC_019678	CCAA	2	8	6269518	6269525	50 %	0 %	0 %	50 %	427738413
135066	NC_019678	TAT	2	6	6269568	6269573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135074	NC_019678	TGTAA	2	10	6270268	6270277	40 %	40 %	20 %	0 %	427738414
135075	NC_019678	CAG	2	6	6270290	6270295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738414
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135081	NC_019678	TGTT	2	8	6270489	6270496	0 %	75 %	25 %	0 %	427738414
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135084	NC_019678	AGAA	2	8	6270537	6270544	75 %	0 %	25 %	0 %	427738414
135085	NC_019678	ATTGAT	2	12	6270561	6270572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427738414
135086	NC_019678	TAT	2	6	6270590	6270595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738414
135087	NC_019678	T	6	6	6270598	6270603	0 %	100 %	0 %	0 %	427738414
135088	NC_019678	ACC	2	6	6270606	6270611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427738414
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135090	NC_019678	GTA	2	6	6270658	6270663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738414
135091	NC_019678	GAAG	2	8	6270702	6270709	50 %	0 %	50 %	0 %	427738414
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135098	NC_019678	AGT	2	6	6270906	6270911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738414
135099	NC_019678	TAT	2	6	6270980	6270985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738414
135100	NC_019678	TTA	2	6	6271042	6271047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738414
135101	NC_019678	CACT	2	8	6271055	6271062	25 %	25 %	0 %	50 %	427738414
135102	NC_019678	TTC	2	6	6271071	6271076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738414
135103	NC_019678	ATATTT	2	12	6271084	6271095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738414
135104	NC_019678	ATT	2	6	6271122	6271127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738414
135105	NC_019678	TCC	2	6	6271155	6271160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427738414
135106	NC_019678	CAC	2	6	6271205	6271210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427738414
135107	NC_019678	TCT	2	6	6271213	6271218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738414
135108	NC_019678	ATC	2	6	6271227	6271232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738414
135109	NC_019678	CAG	2	6	6271241	6271246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427738414
135110	NC_019678	TAAA	2	8	6271253	6271260	75 %	25 %	0 %	0 %	427738414
135111	NC_019678	TCC	2	6	6271329	6271334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427738414
135112	NC_019678	CAT	2	6	6271373	6271378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738414
135113	NC_019678	AT	5	10	6271402	6271411	50 %	50 %	0 %	0 %	427738414
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135115	NC_019678	TAA	2	6	6271442	6271447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738414
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