MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
134001	NC_019678	T	6	6	6218664	6218669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134002	NC_019678	CAA	2	6	6218705	6218710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134003	NC_019678	ATT	2	6	6218761	6218766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134004	NC_019678	CTAT	2	8	6218814	6218821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134005	NC_019678	AGA	2	6	6218828	6218833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134006	NC_019678	AG	3	6	6218901	6218906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134007	NC_019678	AGT	2	6	6218973	6218978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134008	NC_019678	TGC	2	6	6219072	6219077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427738376
134009	NC_019678	ACA	2	6	6219081	6219086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427738376
134010	NC_019678	GTT	2	6	6219089	6219094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738376
134011	NC_019678	TCA	2	6	6219136	6219141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738376
134012	NC_019678	AAC	2	6	6219336	6219341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427738376
134013	NC_019678	TAA	2	6	6219346	6219351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738376
134014	NC_019678	TTA	2	6	6219383	6219388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738376
134015	NC_019678	AAT	2	6	6219459	6219464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738376
134016	NC_019678	CAA	2	6	6219510	6219515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134017	NC_019678	TTG	2	6	6219592	6219597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134018	NC_019678	AATT	2	8	6219608	6219615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134019	NC_019678	TTC	2	6	6219672	6219677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134020	NC_019678	GATTGC	2	12	6219683	6219694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134021	NC_019678	GAA	2	6	6219698	6219703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134022	NC_019678	GCC	2	6	6219773	6219778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134023	NC_019678	CTT	2	6	6219875	6219880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134024	NC_019678	TGA	2	6	6219896	6219901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134025	NC_019678	TATG	2	8	6219926	6219933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134026	NC_019678	TTTA	2	8	6219937	6219944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134027	NC_019678	ATT	2	6	6219954	6219959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134028	NC_019678	ATT	2	6	6219972	6219977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134029	NC_019678	CA	3	6	6219980	6219985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134030	NC_019678	T	6	6	6220000	6220005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134031	NC_019678	AAT	2	6	6220008	6220013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134032	NC_019678	ACA	2	6	6220074	6220079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427738377
134033	NC_019678	GTC	2	6	6220115	6220120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427738377
134034	NC_019678	GTA	2	6	6220222	6220227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738377
134035	NC_019678	GTT	2	6	6220255	6220260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738377
134036	NC_019678	CTC	2	6	6220283	6220288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427738377
134037	NC_019678	CTT	2	6	6220325	6220330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738377
134038	NC_019678	TTA	2	6	6220445	6220450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738377
134039	NC_019678	GAA	2	6	6220453	6220458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427738377
134040	NC_019678	TAC	2	6	6220464	6220469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738377
134041	NC_019678	CTA	2	6	6220477	6220482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738377
134042	NC_019678	GAA	2	6	6220552	6220557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427738377
134043	NC_019678	TTGG	2	8	6220566	6220573	0 %	50 %	50 %	0 %	427738377
134044	NC_019678	GCTTG	2	10	6220629	6220638	0 %	40 %	40 %	20 %	427738377
134045	NC_019678	ACC	2	6	6220641	6220646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427738377
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134050	NC_019678	GAT	2	6	6220899	6220904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738377
134051	NC_019678	GAG	2	6	6220909	6220914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427738377
134052	NC_019678	ATT	2	6	6221035	6221040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134053	NC_019678	TTA	2	6	6221047	6221052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134054	NC_019678	AAG	2	6	6221056	6221061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134055	NC_019678	GAA	2	6	6221104	6221109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427738378
134056	NC_019678	ATT	2	6	6221223	6221228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738378
134057	NC_019678	ATA	2	6	6221255	6221260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738378
134058	NC_019678	GAA	2	6	6221275	6221280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427738378
134059	NC_019678	GAA	3	9	6221296	6221304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427738378
134060	NC_019678	TGA	2	6	6221316	6221321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738378
134061	NC_019678	TTA	2	6	6221332	6221337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738378
134062	NC_019678	ACTG	2	8	6221340	6221347	25 %	25 %	25 %	25 %	427738378
134063	NC_019678	A	6	6	6221357	6221362	100 %	0 %	0 %	0 %	427738378
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134067	NC_019678	A	6	6	6221492	6221497	100 %	0 %	0 %	0 %	427738379
134068	NC_019678	GTA	2	6	6221502	6221507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427738379
134069	NC_019678	TGT	2	6	6221523	6221528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427738379
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134071	NC_019678	ATA	2	6	6221662	6221667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738379
134072	NC_019678	GTG	2	6	6221692	6221697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427738379
134073	NC_019678	ATC	2	6	6221713	6221718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738379
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134075	NC_019678	AAT	2	6	6221754	6221759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427738379
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134078	NC_019678	TGAT	2	8	6221895	6221902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134079	NC_019678	AT	3	6	6221905	6221910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134080	NC_019678	GAA	2	6	6221936	6221941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134081	NC_019678	ATG	2	6	6221990	6221995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134082	NC_019678	C	6	6	6222000	6222005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134083	NC_019678	AAG	2	6	6222061	6222066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134084	NC_019678	CTT	2	6	6222087	6222092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134085	NC_019678	AGCA	2	8	6222103	6222110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134086	NC_019678	ATTG	2	8	6222114	6222121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134087	NC_019678	GA	3	6	6222134	6222139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134088	NC_019678	A	6	6	6222139	6222144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134089	NC_019678	GCA	2	6	6222150	6222155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134090	NC_019678	GCA	2	6	6222224	6222229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134091	NC_019678	AATC	2	8	6222247	6222254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134092	NC_019678	TTA	2	6	6222264	6222269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134093	NC_019678	AGT	2	6	6222341	6222346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134094	NC_019678	TCG	2	6	6222353	6222358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134095	NC_019678	AAT	2	6	6222388	6222393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134096	NC_019678	TGCTG	2	10	6222433	6222442	0 %	40 %	40 %	20 %	427738380
134097	NC_019678	GA	3	6	6222467	6222472	50 %	0 %	50 %	0 %	427738380
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134103	NC_019678	CAT	2	6	6222755	6222760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427738380
134104	NC_019678	TTA	2	6	6222761	6222766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427738380
134105	NC_019678	TTTG	2	8	6222795	6222802	0 %	75 %	25 %	0 %	427738380
134106	NC_019678	GTTG	2	8	6222910	6222917	0 %	50 %	50 %	0 %	427738380
134107	NC_019678	TTC	2	6	6222990	6222995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427738380
134108	NC_019678	AATTTA	2	12	6223098	6223109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134109	NC_019678	TCGCAG	2	12	6223114	6223125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134110	NC_019678	ATC	2	6	6223186	6223191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134111	NC_019678	ATT	2	6	6223218	6223223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134112	NC_019678	T	6	6	6223222	6223227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134113	NC_019678	TATT	2	8	6223243	6223250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134114	NC_019678	AT	3	6	6223259	6223264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134115	NC_019678	AATTG	2	10	6223314	6223323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134116	NC_019678	TAAA	2	8	6223383	6223390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134117	NC_019678	A	6	6	6223388	6223393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134118	NC_019678	AACA	2	8	6223399	6223406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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134472	NC_019678	TCA	2	6	6239536	6239541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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134475	NC_019678	ATTA	2	8	6239681	6239688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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