MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_019678	GA	3	6	575335	575340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_019678	CTTC	2	8	575380	575387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_019678	TCT	2	6	575388	575393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_019678	CA	3	6	575408	575413	50 %	0 %	0 %	50 %	427734054
12505	NC_019678	AAT	2	6	575446	575451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734054
12506	NC_019678	GCT	2	6	575467	575472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734054
12507	NC_019678	TG	3	6	575480	575485	0 %	50 %	50 %	0 %	427734054
12508	NC_019678	GT	4	8	575501	575508	0 %	50 %	50 %	0 %	427734054
12509	NC_019678	ATA	2	6	575534	575539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734054
12510	NC_019678	AAG	2	6	575550	575555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734054
12511	NC_019678	AGA	2	6	575587	575592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734054
12512	NC_019678	ATC	2	6	575677	575682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734054
12513	NC_019678	TTTC	2	8	575753	575760	0 %	75 %	0 %	25 %	427734054
12514	NC_019678	AAT	2	6	575768	575773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734054
12515	NC_019678	ATCA	2	8	575839	575846	50 %	25 %	0 %	25 %	427734054
12516	NC_019678	TTCCC	2	10	575906	575915	0 %	40 %	0 %	60 %	427734054
12517	NC_019678	T	6	6	576050	576055	0 %	100 %	0 %	0 %	427734054
12518	NC_019678	TCTTTT	2	12	576106	576117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	427734054
12519	NC_019678	GTG	2	6	576123	576128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734054
12520	NC_019678	ATA	2	6	576273	576278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734054
12521	NC_019678	TGT	3	9	576292	576300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734054
12522	NC_019678	GTT	2	6	576312	576317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734054
12523	NC_019678	GGTT	2	8	576402	576409	0 %	50 %	50 %	0 %	427734054
12524	NC_019678	AAT	2	6	576422	576427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734054
12525	NC_019678	TCA	2	6	576492	576497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734054
12526	NC_019678	TTG	2	6	576502	576507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734054
12527	NC_019678	CAA	2	6	576595	576600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734054
12528	NC_019678	CTT	2	6	576644	576649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734054
12529	NC_019678	CTT	2	6	576654	576659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734054
12530	NC_019678	AGTT	2	8	576670	576677	25 %	50 %	25 %	0 %	427734054
12531	NC_019678	AGCCAA	2	12	576745	576756	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427734054
12532	NC_019678	T	6	6	576762	576767	0 %	100 %	0 %	0 %	427734054
12533	NC_019678	TGAC	2	8	576799	576806	25 %	25 %	25 %	25 %	427734054
12534	NC_019678	AGC	2	6	576841	576846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734054
12535	NC_019678	T	6	6	576849	576854	0 %	100 %	0 %	0 %	427734054
12536	NC_019678	GTA	2	6	576899	576904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734054
12537	NC_019678	T	6	6	576916	576921	0 %	100 %	0 %	0 %	427734054
12538	NC_019678	CTTT	2	8	577003	577010	0 %	75 %	0 %	25 %	427734054
12539	NC_019678	TGT	2	6	577091	577096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734054
12540	NC_019678	TTA	2	6	577097	577102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734054
12541	NC_019678	TTG	2	6	577105	577110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734054
12542	NC_019678	TCT	2	6	577280	577285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734054
12543	NC_019678	GTTG	2	8	577304	577311	0 %	50 %	50 %	0 %	427734054
12544	NC_019678	AATT	2	8	577333	577340	50 %	50 %	0 %	0 %	427734054
12545	NC_019678	ATT	2	6	577408	577413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734054
12546	NC_019678	ATT	2	6	577417	577422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734054
12547	NC_019678	AACT	2	8	577461	577468	50 %	25 %	0 %	25 %	427734054
12548	NC_019678	TAC	2	6	577504	577509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734054
12549	NC_019678	TAG	2	6	577513	577518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734054
12550	NC_019678	AT	3	6	577573	577578	50 %	50 %	0 %	0 %	427734054
12551	NC_019678	GATA	2	8	577582	577589	50 %	25 %	25 %	0 %	427734054
12552	NC_019678	CTT	2	6	577608	577613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734054
12553	NC_019678	G	7	7	577616	577622	0 %	0 %	100 %	0 %	427734054
12554	NC_019678	ACC	2	6	577658	577663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734054
12555	NC_019678	T	6	6	577692	577697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_019678	AAT	2	6	577711	577716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_019678	GAAC	2	8	577754	577761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12558	NC_019678	ATAA	2	8	577776	577783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_019678	AATT	2	8	577802	577809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_019678	AT	3	6	577830	577835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_019678	TCTA	2	8	577947	577954	25 %	50 %	0 %	25 %	427734055
12562	NC_019678	GAA	2	6	577958	577963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734055
12563	NC_019678	T	6	6	577970	577975	0 %	100 %	0 %	0 %	427734055
12564	NC_019678	GTTT	2	8	577980	577987	0 %	75 %	25 %	0 %	427734055
12565	NC_019678	TAT	2	6	578029	578034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734055
12566	NC_019678	T	6	6	578051	578056	0 %	100 %	0 %	0 %	427734055
12567	NC_019678	AAT	2	6	578062	578067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734055
12568	NC_019678	GCA	2	6	578090	578095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734055
12569	NC_019678	GCTTTA	2	12	578159	578170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427734055
12570	NC_019678	ACT	2	6	578243	578248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734055
12571	NC_019678	GTT	2	6	578322	578327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734055
12572	NC_019678	TATT	2	8	578343	578350	25 %	75 %	0 %	0 %	427734055
12573	NC_019678	TAA	2	6	578373	578378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734055
12574	NC_019678	TCT	2	6	578395	578400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734055
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12579	NC_019678	ATG	2	6	578569	578574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734055
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12581	NC_019678	TTG	2	6	578638	578643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734055
12582	NC_019678	T	6	6	578666	578671	0 %	100 %	0 %	0 %	427734055
12583	NC_019678	CCA	2	6	578684	578689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734055
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12586	NC_019678	TCT	2	6	578750	578755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734055
12587	NC_019678	TTTA	2	8	578878	578885	25 %	75 %	0 %	0 %	427734055
12588	NC_019678	ATC	2	6	578950	578955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734055
12589	NC_019678	ATA	2	6	579017	579022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_019678	TAA	2	6	579039	579044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_019678	TCT	2	6	579112	579117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734056
12592	NC_019678	TGA	2	6	579169	579174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734056
12593	NC_019678	CCT	2	6	579217	579222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734056
12594	NC_019678	TAG	2	6	579275	579280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734056
12595	NC_019678	TTC	2	6	579308	579313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734056
12596	NC_019678	CTG	2	6	579336	579341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734056
12597	NC_019678	TAAAAT	2	12	579387	579398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734056
12598	NC_019678	CCA	2	6	579448	579453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427734056
12599	NC_019678	CTC	2	6	579464	579469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734056
12600	NC_019678	AAAT	2	8	579509	579516	75 %	25 %	0 %	0 %	427734056
12601	NC_019678	GCT	2	6	579538	579543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734056
12602	NC_019678	TAC	2	6	579630	579635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734056
12603	NC_019678	TGT	2	6	579641	579646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734056
12604	NC_019678	TAA	2	6	579729	579734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734056
12605	NC_019678	GTT	2	6	579745	579750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734056
12606	NC_019678	T	6	6	579892	579897	0 %	100 %	0 %	0 %	427734056
12607	NC_019678	TAT	2	6	579920	579925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734056
12608	NC_019678	TTC	2	6	579939	579944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734056
12609	NC_019678	GCA	2	6	580013	580018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734056
12610	NC_019678	ATC	2	6	580102	580107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734056
12611	NC_019678	GTA	2	6	580120	580125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734056
12612	NC_019678	GGC	2	6	580287	580292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427734056
12613	NC_019678	TCC	2	6	580299	580304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427734056
12614	NC_019678	CGA	2	6	580339	580344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734056
12615	NC_019678	TGC	4	12	580356	580367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734056
12616	NC_019678	AGT	2	6	580381	580386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734056
12617	NC_019678	AACA	2	8	580416	580423	75 %	0 %	0 %	25 %	427734056
12618	NC_019678	AAAGC	2	10	580483	580492	60 %	0 %	20 %	20 %	427734056
12619	NC_019678	ATTA	2	8	580521	580528	50 %	50 %	0 %	0 %	427734056
12620	NC_019678	T	7	7	580589	580595	0 %	100 %	0 %	0 %	427734056
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