MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114501	NC_019678	TTG	2	6	5321644	5321649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737679
114502	NC_019678	AAT	2	6	5321741	5321746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737680
114503	NC_019678	T	6	6	5321805	5321810	0 %	100 %	0 %	0 %	427737680
114504	NC_019678	ACTTA	2	10	5321857	5321866	40 %	40 %	0 %	20 %	427737680
114505	NC_019678	CAA	2	6	5321886	5321891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737680
114506	NC_019678	ATT	2	6	5321917	5321922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737680
114507	NC_019678	ATA	2	6	5321987	5321992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737680
114508	NC_019678	ATC	2	6	5322166	5322171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737680
114509	NC_019678	AT	3	6	5322299	5322304	50 %	50 %	0 %	0 %	427737680
114510	NC_019678	TGCT	2	8	5322322	5322329	0 %	50 %	25 %	25 %	427737680
114511	NC_019678	TAGC	2	8	5322330	5322337	25 %	25 %	25 %	25 %	427737680
114512	NC_019678	CGAAC	2	10	5322347	5322356	40 %	0 %	20 %	40 %	427737680
114513	NC_019678	GTAA	2	8	5322373	5322380	50 %	25 %	25 %	0 %	427737680
114514	NC_019678	TCC	2	6	5322455	5322460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427737680
114515	NC_019678	CAAC	3	12	5322520	5322531	50 %	0 %	0 %	50 %	427737680
114516	NC_019678	GTA	2	6	5322535	5322540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737680
114517	NC_019678	AAC	2	6	5322581	5322586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737680
114518	NC_019678	ATTA	2	8	5322654	5322661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114519	NC_019678	T	6	6	5322681	5322686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114520	NC_019678	GCT	2	6	5322714	5322719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737681
114521	NC_019678	AGA	2	6	5322776	5322781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427737681
114522	NC_019678	GCT	2	6	5322786	5322791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737681
114523	NC_019678	GTC	2	6	5322845	5322850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737681
114524	NC_019678	ATT	2	6	5322863	5322868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737681
114525	NC_019678	GTT	2	6	5322937	5322942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737681
114526	NC_019678	GCT	2	6	5322960	5322965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737681
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114528	NC_019678	T	6	6	5323008	5323013	0 %	100 %	0 %	0 %	427737681
114529	NC_019678	ACCGT	2	10	5323131	5323140	20 %	20 %	20 %	40 %	427737681
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114531	NC_019678	GTA	2	6	5323241	5323246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737681
114532	NC_019678	GTT	2	6	5323358	5323363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737681
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114534	NC_019678	CTTG	2	8	5323471	5323478	0 %	50 %	25 %	25 %	427737681
114535	NC_019678	TGA	2	6	5323496	5323501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737681
114536	NC_019678	TTCTTT	2	12	5323535	5323546	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	427737681
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114538	NC_019678	T	7	7	5323564	5323570	0 %	100 %	0 %	0 %	427737681
114539	NC_019678	TTC	2	6	5323625	5323630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737681
114540	NC_019678	CAA	2	6	5323642	5323647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737681
114541	NC_019678	TAA	2	6	5323752	5323757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737681
114542	NC_019678	TAT	2	6	5323780	5323785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737681
114543	NC_019678	TGA	2	6	5323794	5323799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737681
114544	NC_019678	T	6	6	5323918	5323923	0 %	100 %	0 %	0 %	427737681
114545	NC_019678	AAT	2	6	5323973	5323978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114546	NC_019678	TTC	2	6	5324105	5324110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737682
114547	NC_019678	AAT	2	6	5324124	5324129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737682
114548	NC_019678	CAT	2	6	5324166	5324171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737682
114549	NC_019678	ATC	2	6	5324239	5324244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737682
114550	NC_019678	TTTG	2	8	5324339	5324346	0 %	75 %	25 %	0 %	427737682
114551	NC_019678	CTG	2	6	5324413	5324418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737682
114552	NC_019678	TAA	2	6	5324433	5324438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737682
114553	NC_019678	CCA	2	6	5324528	5324533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427737682
114554	NC_019678	CTA	2	6	5324556	5324561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737682
114555	NC_019678	AAG	2	6	5324645	5324650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427737682
114556	NC_019678	TAA	2	6	5324670	5324675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737682
114557	NC_019678	ATA	2	6	5324699	5324704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737682
114558	NC_019678	ACC	2	6	5324761	5324766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427737682
114559	NC_019678	T	8	8	5324866	5324873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114560	NC_019678	GAT	2	6	5324879	5324884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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114562	NC_019678	TA	3	6	5324938	5324943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114563	NC_019678	A	7	7	5325004	5325010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114564	NC_019678	TC	3	6	5325092	5325097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114565	NC_019678	ATTA	2	8	5325166	5325173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114566	NC_019678	GTT	2	6	5325190	5325195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114567	NC_019678	TTA	2	6	5325207	5325212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114568	NC_019678	TAT	2	6	5325234	5325239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114569	NC_019678	A	6	6	5325255	5325260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114570	NC_019678	TTTCT	2	10	5325266	5325275	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114571	NC_019678	TCAT	2	8	5325313	5325320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114572	NC_019678	TATC	2	8	5325377	5325384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114573	NC_019678	ATA	2	6	5325517	5325522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114575	NC_019678	TAA	2	6	5325569	5325574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114576	NC_019678	AATA	2	8	5325588	5325595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114577	NC_019678	AATT	2	8	5325601	5325608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114578	NC_019678	GTAA	2	8	5325621	5325628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114579	NC_019678	TAAA	2	8	5325645	5325652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114582	NC_019678	T	6	6	5325707	5325712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114583	NC_019678	TAA	2	6	5325744	5325749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114587	NC_019678	G	6	6	5325889	5325894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114588	NC_019678	TAA	3	9	5325919	5325927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114589	NC_019678	TTTA	2	8	5326100	5326107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114590	NC_019678	ACTT	2	8	5326113	5326120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114591	NC_019678	TACAT	2	10	5326153	5326162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114592	NC_019678	AAAAT	2	10	5326168	5326177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114593	NC_019678	CAA	2	6	5326248	5326253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114594	NC_019678	AAG	2	6	5326305	5326310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114595	NC_019678	TG	3	6	5326336	5326341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114596	NC_019678	GTT	2	6	5326357	5326362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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114598	NC_019678	AAG	2	6	5326420	5326425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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114600	NC_019678	TA	3	6	5326549	5326554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114601	NC_019678	TTA	2	6	5326573	5326578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114602	NC_019678	TAAC	2	8	5326612	5326619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114603	NC_019678	TAA	2	6	5326647	5326652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114604	NC_019678	TTA	2	6	5326681	5326686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114605	NC_019678	AAT	2	6	5326768	5326773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114606	NC_019678	T	6	6	5326796	5326801	0 %	100 %	0 %	0 %	427737683
114607	NC_019678	CAA	3	9	5326826	5326834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737683
114608	NC_019678	TGC	2	6	5326841	5326846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737683
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114610	NC_019678	TGC	2	6	5326896	5326901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737683
114611	NC_019678	TTGC	2	8	5326919	5326926	0 %	50 %	25 %	25 %	427737683
114612	NC_019678	TAAA	2	8	5326992	5326999	75 %	25 %	0 %	0 %	427737683
114613	NC_019678	T	6	6	5327052	5327057	0 %	100 %	0 %	0 %	427737683
114614	NC_019678	TAC	2	6	5327075	5327080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737683
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