MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019678	CTT	2	6	506083	506088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11002	NC_019678	GCT	2	6	506134	506139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11003	NC_019678	TTC	2	6	506155	506160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11004	NC_019678	GCA	2	6	506161	506166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11005	NC_019678	ATT	2	6	506187	506192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734003
11006	NC_019678	TCT	2	6	506209	506214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11007	NC_019678	TCA	2	6	506224	506229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734003
11008	NC_019678	TCG	2	6	506268	506273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11009	NC_019678	AAGA	2	8	506284	506291	75 %	0 %	25 %	0 %	427734003
11010	NC_019678	ATTGC	2	10	506296	506305	20 %	40 %	20 %	20 %	427734003
11011	NC_019678	TCT	2	6	506312	506317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11012	NC_019678	GTTAT	2	10	506335	506344	20 %	60 %	20 %	0 %	427734003
11013	NC_019678	CGA	2	6	506374	506379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11014	NC_019678	TGC	2	6	506460	506465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11015	NC_019678	CTT	2	6	506510	506515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11016	NC_019678	CAA	2	6	506571	506576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734003
11017	NC_019678	AAT	2	6	506622	506627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11018	NC_019678	GTA	2	6	506731	506736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734003
11019	NC_019678	CGTT	2	8	506746	506753	0 %	50 %	25 %	25 %	427734003
11020	NC_019678	TAA	2	6	506781	506786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11021	NC_019678	ATC	2	6	506787	506792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734003
11022	NC_019678	AAT	2	6	506850	506855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11023	NC_019678	TTC	2	6	506946	506951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11024	NC_019678	CAG	2	6	506972	506977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11025	NC_019678	T	7	7	507012	507018	0 %	100 %	0 %	0 %	427734003
11026	NC_019678	CTTG	2	8	507019	507026	0 %	50 %	25 %	25 %	427734003
11027	NC_019678	TCA	2	6	507073	507078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734003
11028	NC_019678	AATC	2	8	507107	507114	50 %	25 %	0 %	25 %	427734003
11029	NC_019678	TTC	2	6	507140	507145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11030	NC_019678	AAT	2	6	507161	507166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11031	NC_019678	TAA	2	6	507246	507251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11032	NC_019678	CTT	2	6	507260	507265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734003
11033	NC_019678	GCAA	2	8	507309	507316	50 %	0 %	25 %	25 %	427734003
11034	NC_019678	AAT	2	6	507453	507458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11035	NC_019678	CTA	2	6	507554	507559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734003
11036	NC_019678	CAA	3	9	507668	507676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734003
11037	NC_019678	T	6	6	507752	507757	0 %	100 %	0 %	0 %	427734003
11038	NC_019678	TAA	2	6	507799	507804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11039	NC_019678	TAA	2	6	507815	507820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734003
11040	NC_019678	ATT	2	6	507834	507839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734003
11041	NC_019678	A	6	6	507844	507849	100 %	0 %	0 %	0 %	427734003
11042	NC_019678	TGC	2	6	507873	507878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11043	NC_019678	TAT	2	6	507887	507892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734003
11044	NC_019678	GCT	2	6	508016	508021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734003
11045	NC_019678	ATCTGA	2	12	508147	508158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11046	NC_019678	TTAT	2	8	508165	508172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_019678	AG	3	6	508245	508250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_019678	T	6	6	508251	508256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_019678	TGA	2	6	508268	508273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_019678	CAG	2	6	508347	508352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734004
11051	NC_019678	AGA	2	6	508360	508365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427734004
11052	NC_019678	A	6	6	508498	508503	100 %	0 %	0 %	0 %	427734004
11053	NC_019678	AGC	2	6	508549	508554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734004
11054	NC_019678	AGT	2	6	508563	508568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734004
11055	NC_019678	GTT	2	6	508675	508680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734004
11056	NC_019678	GAT	2	6	508732	508737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734004
11057	NC_019678	T	6	6	508755	508760	0 %	100 %	0 %	0 %	427734004
11058	NC_019678	TTAG	2	8	508781	508788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_019678	ACT	2	6	508817	508822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_019678	ATA	2	6	508847	508852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_019678	A	6	6	508858	508863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_019678	AGG	2	6	508884	508889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_019678	ATTA	2	8	508921	508928	50 %	50 %	0 %	0 %	427734005
11064	NC_019678	CAA	2	6	509024	509029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734005
11065	NC_019678	TTG	2	6	509065	509070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427734005
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11068	NC_019678	CCG	2	6	509176	509181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427734005
11069	NC_019678	ATT	2	6	509200	509205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427734005
11070	NC_019678	CTT	2	6	509280	509285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734005
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11073	NC_019678	CCAT	2	8	509500	509507	25 %	25 %	0 %	50 %	427734005
11074	NC_019678	AAC	2	6	509604	509609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734005
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11077	NC_019678	A	8	8	509702	509709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_019678	AAAAT	2	10	509711	509720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_019678	TGA	2	6	509723	509728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_019678	ACT	2	6	509791	509796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_019678	ACT	2	6	509798	509803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_019678	ACT	2	6	509805	509810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11085	NC_019678	ACT	2	6	509885	509890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427734006
11086	NC_019678	GCC	2	6	509932	509937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427734006
11087	NC_019678	TTTG	2	8	509944	509951	0 %	75 %	25 %	0 %	427734006
11088	NC_019678	GTC	2	6	509985	509990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734006
11089	NC_019678	TAA	2	6	510079	510084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427734006
11090	NC_019678	GC	3	6	510164	510169	0 %	0 %	50 %	50 %	427734006
11091	NC_019678	TTC	2	6	510175	510180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427734006
11092	NC_019678	GAG	2	6	510215	510220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427734006
11093	NC_019678	ATG	2	6	510258	510263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734006
11094	NC_019678	ATTCCC	2	12	510422	510433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	427734006
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11096	NC_019678	GA	3	6	510480	510485	50 %	0 %	50 %	0 %	427734006
11097	NC_019678	TAG	2	6	510513	510518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734006
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11101	NC_019678	A	6	6	510734	510739	100 %	0 %	0 %	0 %	427734006
11102	NC_019678	CTTG	2	8	510758	510765	0 %	50 %	25 %	25 %	427734006
11103	NC_019678	TCG	2	6	510778	510783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734006
11104	NC_019678	A	6	6	510822	510827	100 %	0 %	0 %	0 %	427734006
11105	NC_019678	GAT	2	6	510833	510838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427734006
11106	NC_019678	GCA	2	6	510923	510928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427734006
11107	NC_019678	CAA	2	6	510983	510988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427734006
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11110	NC_019678	AGAC	2	8	511236	511243	50 %	0 %	25 %	25 %	427734006
11111	NC_019678	GCGCTT	2	12	511266	511277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427734006
11112	NC_019678	TGG	2	6	511400	511405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427734006
11113	NC_019678	TAA	2	6	511447	511452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_019678	GT	3	6	511470	511475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_019678	TA	3	6	511505	511510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_019678	TTA	2	6	511536	511541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_019678	AAT	2	6	511608	511613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_019678	CAA	2	6	511624	511629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_019678	TTAA	2	8	511771	511778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_019678	TAC	2	6	511827	511832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_019678	ACC	2	6	511870	511875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11123	NC_019678	AAG	2	6	511899	511904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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