MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_019678	CCT	2	6	5249580	5249585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113002	NC_019678	T	6	6	5249641	5249646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113003	NC_019678	TA	3	6	5249653	5249658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113004	NC_019678	T	7	7	5249677	5249683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113005	NC_019678	ATT	2	6	5249704	5249709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113006	NC_019678	TA	4	8	5249713	5249720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113007	NC_019678	T	7	7	5249768	5249774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113008	NC_019678	TTC	2	6	5249872	5249877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737623
113009	NC_019678	T	6	6	5249887	5249892	0 %	100 %	0 %	0 %	427737623
113010	NC_019678	ATT	2	6	5249915	5249920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737623
113011	NC_019678	AGT	2	6	5249922	5249927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737623
113012	NC_019678	TCTGCT	2	12	5249934	5249945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427737623
113013	NC_019678	CAA	2	6	5249970	5249975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737623
113014	NC_019678	AAC	2	6	5250146	5250151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427737623
113015	NC_019678	CTG	2	6	5250163	5250168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737623
113016	NC_019678	AGTCAG	2	12	5250177	5250188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427737623
113017	NC_019678	TCT	2	6	5250195	5250200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737623
113018	NC_019678	A	6	6	5250226	5250231	100 %	0 %	0 %	0 %	427737623
113019	NC_019678	TCG	2	6	5250240	5250245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737623
113020	NC_019678	TGG	2	6	5250272	5250277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427737623
113021	NC_019678	CGG	2	6	5250287	5250292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427737623
113022	NC_019678	CAAG	2	8	5250470	5250477	50 %	0 %	25 %	25 %	427737623
113023	NC_019678	GAT	2	6	5250549	5250554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737623
113024	NC_019678	CAG	2	6	5250619	5250624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737623
113025	NC_019678	GCA	2	6	5250633	5250638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737623
113026	NC_019678	TTC	2	6	5250639	5250644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737623
113027	NC_019678	CGG	2	6	5250689	5250694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427737623
113028	NC_019678	TTAA	2	8	5250713	5250720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113029	NC_019678	AT	3	6	5250773	5250778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113030	NC_019678	T	6	6	5250791	5250796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113031	NC_019678	AAAT	2	8	5250867	5250874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113032	NC_019678	A	6	6	5250897	5250902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113033	NC_019678	ATTA	2	8	5250957	5250964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113034	NC_019678	TAA	2	6	5250999	5251004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113035	NC_019678	GAGG	2	8	5251015	5251022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113036	NC_019678	ATT	2	6	5251155	5251160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113037	NC_019678	AC	3	6	5251171	5251176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113038	NC_019678	AT	3	6	5251191	5251196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113039	NC_019678	T	7	7	5251265	5251271	0 %	100 %	0 %	0 %	427737624
113040	NC_019678	TTGA	2	8	5251293	5251300	25 %	50 %	25 %	0 %	427737624
113041	NC_019678	TCA	2	6	5251471	5251476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737624
113042	NC_019678	ACT	2	6	5251477	5251482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737624
113043	NC_019678	GAA	2	6	5251577	5251582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427737624
113044	NC_019678	ATC	2	6	5251749	5251754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737624
113045	NC_019678	GCT	2	6	5251904	5251909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737624
113046	NC_019678	AGT	2	6	5251935	5251940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737624
113047	NC_019678	AGC	3	9	5251944	5251952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737624
113048	NC_019678	TCA	2	6	5251969	5251974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737624
113049	NC_019678	ACG	2	6	5251977	5251982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737624
113050	NC_019678	TCA	2	6	5252027	5252032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737624
113051	NC_019678	CGT	3	9	5252112	5252120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737624
113052	NC_019678	CATG	2	8	5252124	5252131	25 %	25 %	25 %	25 %	427737624
113053	NC_019678	G	7	7	5252131	5252137	0 %	0 %	100 %	0 %	427737624
113054	NC_019678	GCA	2	6	5252150	5252155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737624
113055	NC_019678	TGGA	2	8	5252168	5252175	25 %	25 %	50 %	0 %	427737625
113056	NC_019678	GAA	2	6	5252192	5252197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427737625
113057	NC_019678	CAC	2	6	5252389	5252394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427737625
113058	NC_019678	ATG	2	6	5252395	5252400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427737625
113059	NC_019678	TCT	2	6	5252507	5252512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737625
113060	NC_019678	ATA	2	6	5252616	5252621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427737625
113061	NC_019678	GCA	2	6	5252733	5252738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737625
113062	NC_019678	TA	3	6	5252791	5252796	50 %	50 %	0 %	0 %	427737625
113063	NC_019678	ATC	2	6	5252797	5252802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737625
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113065	NC_019678	TTTAA	2	10	5252879	5252888	40 %	60 %	0 %	0 %	427737625
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113067	NC_019678	GAA	2	6	5252988	5252993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427737625
113068	NC_019678	TTG	2	6	5252996	5253001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737625
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113071	NC_019678	AGC	2	6	5253064	5253069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427737625
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113074	NC_019678	TTGA	2	8	5253316	5253323	25 %	50 %	25 %	0 %	427737625
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113077	NC_019678	T	6	6	5253337	5253342	0 %	100 %	0 %	0 %	427737625
113078	NC_019678	TGC	2	6	5253457	5253462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427737625
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113085	NC_019678	AAT	2	6	5253898	5253903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113086	NC_019678	GA	3	6	5253913	5253918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113087	NC_019678	T	6	6	5253944	5253949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113089	NC_019678	TCT	2	6	5253978	5253983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113090	NC_019678	AT	3	6	5254058	5254063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113091	NC_019678	TCG	2	6	5254082	5254087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113092	NC_019678	ATT	2	6	5254094	5254099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113093	NC_019678	TA	3	6	5254135	5254140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113094	NC_019678	AT	4	8	5254147	5254154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113095	NC_019678	TAT	2	6	5254219	5254224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427737626
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113103	NC_019678	ATC	2	6	5254481	5254486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737626
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113105	NC_019678	ATC	2	6	5254526	5254531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427737626
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113116	NC_019678	TGT	2	6	5254946	5254951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427737626
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113118	NC_019678	TTC	2	6	5255005	5255010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427737626
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113121	NC_019678	T	6	6	5255177	5255182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113122	NC_019678	TATT	2	8	5255264	5255271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113123	NC_019678	GAA	2	6	5255322	5255327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113124	NC_019678	TAA	2	6	5255348	5255353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113126	NC_019678	TGAT	2	8	5255468	5255475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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113132	NC_019678	GAAG	2	8	5255666	5255673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113133	NC_019678	T	6	6	5255694	5255699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113230	NC_019678	GATT	2	8	5260623	5260630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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113232	NC_019678	AGCT	2	8	5260734	5260741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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113236	NC_019678	TA	3	6	5260981	5260986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113238	NC_019678	TGC	2	6	5261108	5261113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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113355	NC_019678	T	6	6	5266364	5266369	0 %	100 %	0 %	0 %	427737638
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