MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019678	C	6	6	461695	461700	0 %	0 %	0 %	100 %	427733979
10002	NC_019678	GTT	2	6	461713	461718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733979
10003	NC_019678	CGA	2	6	461719	461724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733979
10004	NC_019678	TTTGT	2	10	461793	461802	0 %	80 %	20 %	0 %	427733979
10005	NC_019678	AGC	2	6	461874	461879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733979
10006	NC_019678	TCA	2	6	461950	461955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733979
10007	NC_019678	TCC	2	6	462054	462059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733979
10008	NC_019678	AATC	2	8	462068	462075	50 %	25 %	0 %	25 %	427733979
10009	NC_019678	TATC	2	8	462104	462111	25 %	50 %	0 %	25 %	427733979
10010	NC_019678	TA	3	6	462191	462196	50 %	50 %	0 %	0 %	427733979
10011	NC_019678	TAC	2	6	462204	462209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733979
10012	NC_019678	TACTTT	2	12	462276	462287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	427733979
10013	NC_019678	AGC	2	6	462345	462350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733979
10014	NC_019678	AT	3	6	462384	462389	50 %	50 %	0 %	0 %	427733979
10015	NC_019678	ACA	2	6	462493	462498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733979
10016	NC_019678	TTG	2	6	462513	462518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733979
10017	NC_019678	TTGC	2	8	462578	462585	0 %	50 %	25 %	25 %	427733979
10018	NC_019678	ATA	2	6	462588	462593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733979
10019	NC_019678	ATT	2	6	462603	462608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733979
10020	NC_019678	TTG	2	6	462642	462647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733979
10021	NC_019678	TTGG	2	8	462740	462747	0 %	50 %	50 %	0 %	427733979
10022	NC_019678	TTA	2	6	462820	462825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733979
10023	NC_019678	GTG	2	6	462830	462835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733979
10024	NC_019678	TAG	2	6	462907	462912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733979
10025	NC_019678	A	6	6	462970	462975	100 %	0 %	0 %	0 %	427733979
10026	NC_019678	GAT	2	6	463067	463072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733979
10027	NC_019678	AT	3	6	463071	463076	50 %	50 %	0 %	0 %	427733979
10028	NC_019678	T	6	6	463076	463081	0 %	100 %	0 %	0 %	427733979
10029	NC_019678	TAG	2	6	463100	463105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733979
10030	NC_019678	CTG	2	6	463118	463123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733979
10031	NC_019678	ATTT	2	8	463172	463179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_019678	CTA	2	6	463272	463277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_019678	AAT	2	6	463288	463293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_019678	GCA	2	6	463338	463343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_019678	TA	4	8	463381	463388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_019678	T	6	6	463438	463443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_019678	A	6	6	463454	463459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_019678	AATT	2	8	463521	463528	50 %	50 %	0 %	0 %	427733980
10039	NC_019678	ATC	2	6	463548	463553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
10040	NC_019678	CTT	2	6	463613	463618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733980
10041	NC_019678	ATT	2	6	463671	463676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733980
10042	NC_019678	TCA	2	6	463720	463725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
10043	NC_019678	TCC	2	6	463923	463928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733980
10044	NC_019678	ACG	2	6	463947	463952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733980
10045	NC_019678	ACT	2	6	463957	463962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
10046	NC_019678	CAA	2	6	464000	464005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733980
10047	NC_019678	CTTG	2	8	464027	464034	0 %	50 %	25 %	25 %	427733980
10048	NC_019678	GTT	2	6	464039	464044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733980
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10050	NC_019678	ATC	3	9	464166	464174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
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10052	NC_019678	ATT	2	6	464269	464274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733980
10053	NC_019678	CCA	2	6	464278	464283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733980
10054	NC_019678	CAT	2	6	464321	464326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
10055	NC_019678	TCT	2	6	464347	464352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733980
10056	NC_019678	AAT	2	6	464390	464395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733980
10057	NC_019678	TA	3	6	464414	464419	50 %	50 %	0 %	0 %	427733980
10058	NC_019678	GTA	2	6	464423	464428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733980
10059	NC_019678	TCGT	2	8	464445	464452	0 %	50 %	25 %	25 %	427733980
10060	NC_019678	CTT	2	6	464510	464515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733980
10061	NC_019678	TGG	2	6	464523	464528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733980
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10063	NC_019678	TTG	2	6	464551	464556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733980
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10065	NC_019678	CTT	2	6	464630	464635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733980
10066	NC_019678	CTG	2	6	464646	464651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733980
10067	NC_019678	CAT	2	6	464760	464765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
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10069	NC_019678	CTTT	2	8	464908	464915	0 %	75 %	0 %	25 %	427733980
10070	NC_019678	ACT	2	6	464944	464949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733980
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10073	NC_019678	TAG	2	6	465176	465181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733980
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10075	NC_019678	TGA	2	6	465412	465417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733980
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10080	NC_019678	TTC	2	6	465521	465526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733980
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10088	NC_019678	GCT	2	6	465985	465990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733980
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10090	NC_019678	ATT	2	6	466152	466157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733980
10091	NC_019678	TAAG	2	8	466268	466275	50 %	25 %	25 %	0 %	427733980
10092	NC_019678	TGT	2	6	466336	466341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733980
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10094	NC_019678	TGC	2	6	466449	466454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733980
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10096	NC_019678	GAA	2	6	466516	466521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_019678	T	7	7	466524	466530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10104	NC_019678	CTA	2	6	467050	467055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733981
10105	NC_019678	TATCG	2	10	467094	467103	20 %	40 %	20 %	20 %	427733981
10106	NC_019678	TTG	2	6	467299	467304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733981
10107	NC_019678	TCT	2	6	467323	467328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733981
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10109	NC_019678	AAG	2	6	467429	467434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733981
10110	NC_019678	AGA	2	6	467517	467522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733981
10111	NC_019678	CTG	2	6	467630	467635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733981
10112	NC_019678	CAG	2	6	467639	467644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733981
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10116	NC_019678	CAG	2	6	467831	467836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733981
10117	NC_019678	AT	3	6	467870	467875	50 %	50 %	0 %	0 %	427733981
10118	NC_019678	AGT	2	6	467916	467921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733981
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10496	NC_019678	ATT	2	6	483452	483457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_019678	CTT	2	6	483458	483463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10498	NC_019678	TTGTA	2	10	483523	483532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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