MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_019678	CTT	2	6	415859	415864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733935
9003	NC_019678	GTC	2	6	415909	415914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_019678	CTC	2	6	415915	415920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_019678	TAA	2	6	415923	415928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_019678	AAT	2	6	415953	415958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_019678	CAA	2	6	415988	415993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733936
9008	NC_019678	ATC	2	6	416006	416011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733936
9009	NC_019678	A	7	7	416018	416024	100 %	0 %	0 %	0 %	427733936
9010	NC_019678	A	6	6	416098	416103	100 %	0 %	0 %	0 %	427733936
9011	NC_019678	CAA	2	6	416144	416149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733936
9012	NC_019678	GTG	2	6	416185	416190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733936
9013	NC_019678	AAG	2	6	416201	416206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733936
9014	NC_019678	ATT	2	6	416250	416255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733936
9015	NC_019678	AAG	2	6	416309	416314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733936
9016	NC_019678	AAAC	2	8	416320	416327	75 %	0 %	0 %	25 %	427733936
9017	NC_019678	AAT	2	6	416355	416360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_019678	GTA	2	6	416364	416369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_019678	TGA	2	6	416382	416387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_019678	ATTGC	2	10	416468	416477	20 %	40 %	20 %	20 %	427733937
9021	NC_019678	AGTGA	2	10	416580	416589	40 %	20 %	40 %	0 %	427733937
9022	NC_019678	A	6	6	416621	416626	100 %	0 %	0 %	0 %	427733937
9023	NC_019678	A	6	6	416663	416668	100 %	0 %	0 %	0 %	427733937
9024	NC_019678	A	6	6	416690	416695	100 %	0 %	0 %	0 %	427733937
9025	NC_019678	TAA	2	6	416709	416714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733937
9026	NC_019678	TTG	2	6	416715	416720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733937
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9028	NC_019678	TGCTAT	2	12	416806	416817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427733937
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9030	NC_019678	CCA	2	6	416831	416836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733937
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9034	NC_019678	T	6	6	416920	416925	0 %	100 %	0 %	0 %	427733937
9035	NC_019678	ACA	2	6	416942	416947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733937
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9037	NC_019678	GATA	2	8	417085	417092	50 %	25 %	25 %	0 %	427733937
9038	NC_019678	AAAT	2	8	417099	417106	75 %	25 %	0 %	0 %	427733937
9039	NC_019678	AAT	2	6	417273	417278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733937
9040	NC_019678	TAC	2	6	417316	417321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_019678	GT	3	6	417340	417345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_019678	CAT	2	6	417480	417485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_019678	GTTA	2	8	417494	417501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_019678	CTT	2	6	417521	417526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_019678	A	7	7	417531	417537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_019678	CAA	2	6	417547	417552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_019678	ATT	2	6	417594	417599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733938
9048	NC_019678	AT	3	6	417609	417614	50 %	50 %	0 %	0 %	427733938
9049	NC_019678	CTA	2	6	417637	417642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733938
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9058	NC_019678	TATT	2	8	418136	418143	25 %	75 %	0 %	0 %	427733938
9059	NC_019678	TAA	2	6	418212	418217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733938
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9065	NC_019678	A	8	8	418496	418503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_019678	GTAA	2	8	418506	418513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_019678	AAAT	2	8	418536	418543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9089	NC_019678	ATAA	3	12	419958	419969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9105	NC_019678	AAAG	2	8	420731	420738	75 %	0 %	25 %	0 %	427733942
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9116	NC_019678	ATA	2	6	421099	421104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9118	NC_019678	TAT	2	6	421113	421118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_019678	ATA	2	6	421122	421127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_019678	AAT	2	6	421131	421136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_019678	A	6	6	421157	421162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_019678	TGCAT	2	10	421236	421245	20 %	40 %	20 %	20 %	427733943
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