MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018609	TTC	2	6	180289	180294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450953
4002	NC_018609	CAT	2	6	180342	180347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450953
4003	NC_018609	CTTCT	2	10	180354	180363	0 %	60 %	0 %	40 %	407450953
4004	NC_018609	CT	3	6	180371	180376	0 %	50 %	0 %	50 %	407450953
4005	NC_018609	CATA	2	8	180408	180415	50 %	25 %	0 %	25 %	407450953
4006	NC_018609	TCA	2	6	180419	180424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450953
4007	NC_018609	CCT	2	6	180426	180431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450953
4008	NC_018609	AG	3	6	180440	180445	50 %	0 %	50 %	0 %	407450953
4009	NC_018609	TTC	2	6	180490	180495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450953
4010	NC_018609	CCAG	2	8	180512	180519	25 %	0 %	25 %	50 %	407450953
4011	NC_018609	TG	3	6	180593	180598	0 %	50 %	50 %	0 %	407450954
4012	NC_018609	AGT	2	6	180610	180615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450954
4013	NC_018609	ATA	2	6	180658	180663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450954
4014	NC_018609	AGG	2	6	180670	180675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450954
4015	NC_018609	TCC	2	6	180676	180681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450954
4016	NC_018609	TTC	2	6	180688	180693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450954
4017	NC_018609	AAGA	2	8	180702	180709	75 %	0 %	25 %	0 %	407450954
4018	NC_018609	AGT	2	6	180734	180739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450954
4019	NC_018609	CCA	2	6	180756	180761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450954
4020	NC_018609	ACAT	2	8	180803	180810	50 %	25 %	0 %	25 %	407450954
4021	NC_018609	AAG	2	6	180823	180828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450954
4022	NC_018609	T	6	6	180900	180905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018609	ATAAA	2	10	180938	180947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018609	TAT	2	6	180953	180958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018609	AGT	2	6	180968	180973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018609	T	6	6	180975	180980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_018609	ATT	2	6	180981	180986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_018609	T	8	8	180985	180992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018609	A	7	7	181001	181007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018609	TTA	2	6	181053	181058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
4031	NC_018609	ACC	2	6	181089	181094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
4032	NC_018609	CT	3	6	181192	181197	0 %	50 %	0 %	50 %	407450955
4033	NC_018609	TGC	2	6	181209	181214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
4034	NC_018609	TTTC	2	8	181243	181250	0 %	75 %	0 %	25 %	407450955
4035	NC_018609	CTG	2	6	181322	181327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
4036	NC_018609	CTG	3	9	181373	181381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
4037	NC_018609	ACC	2	6	181416	181421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
4038	NC_018609	TACC	2	8	181460	181467	25 %	25 %	0 %	50 %	407450955
4039	NC_018609	CCA	2	6	181475	181480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
4040	NC_018609	TCC	2	6	181501	181506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
4041	NC_018609	CATA	2	8	181532	181539	50 %	25 %	0 %	25 %	407450955
4042	NC_018609	TTC	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
4043	NC_018609	CAAAG	2	10	181623	181632	60 %	0 %	20 %	20 %	407450955
4044	NC_018609	CTC	2	6	181663	181668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
4045	NC_018609	ACG	2	6	181678	181683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450955
4046	NC_018609	TAT	2	6	181703	181708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
4047	NC_018609	CCA	2	6	181774	181779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450955
4048	NC_018609	GAA	2	6	181781	181786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450955
4049	NC_018609	TTA	2	6	181795	181800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
4050	NC_018609	TCT	2	6	181861	181866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
4051	NC_018609	ACGCC	2	10	181872	181881	20 %	0 %	20 %	60 %	407450955
4052	NC_018609	AAT	3	9	182039	182047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450955
4053	NC_018609	CTT	2	6	182057	182062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
4054	NC_018609	CAT	2	6	182066	182071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450955
4055	NC_018609	TTCT	2	8	182163	182170	0 %	75 %	0 %	25 %	407450955
4056	NC_018609	CTC	2	6	182171	182176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450955
4057	NC_018609	T	6	6	182213	182218	0 %	100 %	0 %	0 %	407450955
4058	NC_018609	A	6	6	182322	182327	100 %	0 %	0 %	0 %	407450955
4059	NC_018609	CTT	2	6	182368	182373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450955
4060	NC_018609	AAT	2	6	182386	182391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450955
4061	NC_018609	CTG	2	6	182393	182398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450955
4062	NC_018609	ATT	2	6	182449	182454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450955
4063	NC_018609	ATTG	2	8	182467	182474	25 %	50 %	25 %	0 %	407450955
4064	NC_018609	CAA	2	6	182498	182503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_018609	A	6	6	182527	182532	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
4066	NC_018609	CTTC	2	8	182554	182561	0 %	50 %	0 %	50 %	407450956
4067	NC_018609	ATA	2	6	182661	182666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
4068	NC_018609	T	6	6	182674	182679	0 %	100 %	0 %	0 %	407450956
4069	NC_018609	ATA	2	6	182720	182725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
4070	NC_018609	A	6	6	182820	182825	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
4071	NC_018609	GAA	2	6	182833	182838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450956
4072	NC_018609	AAT	2	6	182844	182849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450956
4073	NC_018609	A	6	6	182862	182867	100 %	0 %	0 %	0 %	407450956
4074	NC_018609	AAC	2	6	182910	182915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450956
4075	NC_018609	ACC	2	6	182916	182921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450956
4076	NC_018609	T	7	7	182938	182944	0 %	100 %	0 %	0 %	407450956
4077	NC_018609	TCC	2	6	182966	182971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450956
4078	NC_018609	TCT	2	6	183013	183018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450956
4079	NC_018609	ATT	2	6	183053	183058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450956
4080	NC_018609	AGT	2	6	183179	183184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018609	A	6	6	183231	183236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018609	CTA	2	6	183282	183287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_018609	TAAAT	2	10	183334	183343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018609	GAA	2	6	183354	183359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018609	GAA	2	6	183373	183378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
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4087	NC_018609	GA	3	6	183442	183447	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
4088	NC_018609	AAG	2	6	183471	183476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
4089	NC_018609	ACTAA	2	10	183485	183494	60 %	20 %	0 %	20 %	407450957
4090	NC_018609	AGAAA	2	10	183514	183523	80 %	0 %	20 %	0 %	407450957
4091	NC_018609	AAT	2	6	183685	183690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
4092	NC_018609	CTAC	2	8	183711	183718	25 %	25 %	0 %	50 %	407450957
4093	NC_018609	TGA	2	6	183805	183810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
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4095	NC_018609	TCA	2	6	183825	183830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
4096	NC_018609	ATC	2	6	183833	183838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
4097	NC_018609	GAA	2	6	184032	184037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
4098	NC_018609	AGA	2	6	184055	184060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450957
4099	NC_018609	ATG	2	6	184065	184070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
4100	NC_018609	TGA	2	6	184126	184131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
4101	NC_018609	TAA	2	6	184147	184152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
4102	NC_018609	ACA	2	6	184174	184179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450957
4103	NC_018609	AGGT	2	8	184207	184214	25 %	25 %	50 %	0 %	407450957
4104	NC_018609	TACT	2	8	184236	184243	25 %	50 %	0 %	25 %	407450957
4105	NC_018609	TTA	2	6	184268	184273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450957
4106	NC_018609	TA	3	6	184300	184305	50 %	50 %	0 %	0 %	407450957
4107	NC_018609	AG	3	6	184313	184318	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
4108	NC_018609	CTAA	2	8	184322	184329	50 %	25 %	0 %	25 %	407450957
4109	NC_018609	TAGA	2	8	184374	184381	50 %	25 %	25 %	0 %	407450957
4110	NC_018609	TTC	2	6	184462	184467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450957
4111	NC_018609	GTTA	2	8	184478	184485	25 %	50 %	25 %	0 %	407450957
4112	NC_018609	CAT	2	6	184499	184504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450957
4113	NC_018609	AG	3	6	184541	184546	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
4114	NC_018609	GAT	2	6	184550	184555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450957
4115	NC_018609	A	6	6	184606	184611	100 %	0 %	0 %	0 %	407450957
4116	NC_018609	AAAT	2	8	184648	184655	75 %	25 %	0 %	0 %	407450957
4117	NC_018609	CAA	2	6	184685	184690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450957
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4119	NC_018609	AAT	2	6	184757	184762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450957
4120	NC_018609	AG	3	6	184772	184777	50 %	0 %	50 %	0 %	407450957
4121	NC_018609	CT	3	6	184796	184801	0 %	50 %	0 %	50 %	407450957
4122	NC_018609	GTT	2	6	184823	184828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450957
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4499	NC_018609	T	7	7	200274	200280	0 %	100 %	0 %	0 %	407450972
4500	NC_018609	A	6	6	200286	200291	100 %	0 %	0 %	0 %	407450972

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