MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018609	AG	3	6	579594	579599	50 %	0 %	50 %	0 %	407451326
13002	NC_018609	TA	3	6	579622	579627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_018609	ACA	2	6	579642	579647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_018609	T	8	8	579656	579663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_018609	A	7	7	579687	579693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_018609	GTT	2	6	579702	579707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_018609	ATATG	2	10	579718	579727	40 %	40 %	20 %	0 %	407451327
13008	NC_018609	GAA	2	6	579733	579738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451327
13009	NC_018609	A	7	7	579740	579746	100 %	0 %	0 %	0 %	407451327
13010	NC_018609	AATT	2	8	579784	579791	50 %	50 %	0 %	0 %	407451327
13011	NC_018609	TTA	2	6	579807	579812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451327
13012	NC_018609	GTTT	2	8	579859	579866	0 %	75 %	25 %	0 %	407451327
13013	NC_018609	AAC	2	6	579938	579943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451327
13014	NC_018609	TATT	2	8	580074	580081	25 %	75 %	0 %	0 %	407451327
13015	NC_018609	CTA	2	6	580119	580124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451327
13016	NC_018609	ATTTAG	2	12	580131	580142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407451327
13017	NC_018609	CAT	2	6	580162	580167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451327
13018	NC_018609	AGA	2	6	580174	580179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451327
13019	NC_018609	TGGTT	2	10	580195	580204	0 %	60 %	40 %	0 %	407451327
13020	NC_018609	TCAA	2	8	580287	580294	50 %	25 %	0 %	25 %	407451327
13021	NC_018609	A	8	8	580293	580300	100 %	0 %	0 %	0 %	407451327
13022	NC_018609	TCA	2	6	580305	580310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451327
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13024	NC_018609	CAT	2	6	580457	580462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451327
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13027	NC_018609	A	7	7	580603	580609	100 %	0 %	0 %	0 %	407451327
13028	NC_018609	AAG	2	6	580611	580616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451327
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13031	NC_018609	GAAAAA	2	12	580747	580758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407451327
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13033	NC_018609	CAA	2	6	580819	580824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451327
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13035	NC_018609	A	7	7	580873	580879	100 %	0 %	0 %	0 %	407451327
13036	NC_018609	GCA	2	6	580952	580957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451328
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13040	NC_018609	ATG	2	6	581201	581206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451328
13041	NC_018609	CTT	2	6	581218	581223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451328
13042	NC_018609	AATG	2	8	581248	581255	50 %	25 %	25 %	0 %	407451328
13043	NC_018609	AAAAT	2	10	581373	581382	80 %	20 %	0 %	0 %	407451328
13044	NC_018609	TG	3	6	581385	581390	0 %	50 %	50 %	0 %	407451328
13045	NC_018609	AAT	2	6	581435	581440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451328
13046	NC_018609	TAT	2	6	581524	581529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451328
13047	NC_018609	TGA	2	6	581530	581535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451328
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13049	NC_018609	CTA	2	6	581588	581593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451328
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13052	NC_018609	TAA	2	6	581661	581666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451329
13053	NC_018609	TTA	2	6	581850	581855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451329
13054	NC_018609	GGA	2	6	581917	581922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451329
13055	NC_018609	ATT	2	6	582053	582058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451329
13056	NC_018609	TAG	2	6	582197	582202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451329
13057	NC_018609	ATT	2	6	582222	582227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451329
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13059	NC_018609	TC	3	6	582266	582271	0 %	50 %	0 %	50 %	407451329
13060	NC_018609	AGA	2	6	582273	582278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451329
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13062	NC_018609	CA	3	6	582323	582328	50 %	0 %	0 %	50 %	407451329
13063	NC_018609	AAT	2	6	582406	582411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_018609	CTT	2	6	582472	582477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451330
13065	NC_018609	CTA	2	6	582495	582500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451330
13066	NC_018609	TAC	2	6	582544	582549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451330
13067	NC_018609	GCT	2	6	582602	582607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451330
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13074	NC_018609	A	6	6	582934	582939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_018609	TTTA	2	8	582949	582956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_018609	CTTT	2	8	583479	583486	0 %	75 %	0 %	25 %	407451331
13094	NC_018609	TGC	2	6	583522	583527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451331
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13097	NC_018609	AGTT	2	8	583593	583600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_018609	A	6	6	583615	583620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_018609	ATAC	2	8	583629	583636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13100	NC_018609	TTATT	2	10	583639	583648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13118	NC_018609	GTA	2	6	584365	584370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451333
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13122	NC_018609	AAATA	2	10	584697	584706	80 %	20 %	0 %	0 %	407451333
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13124	NC_018609	CAA	2	6	584781	584786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451333
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13229	NC_018609	ATCT	2	8	588548	588555	25 %	50 %	0 %	25 %	407451338
13230	NC_018609	CT	3	6	588554	588559	0 %	50 %	0 %	50 %	407451338
13231	NC_018609	T	6	6	588559	588564	0 %	100 %	0 %	0 %	407451338
13232	NC_018609	CCA	2	6	588568	588573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451338
13233	NC_018609	CAT	2	6	588649	588654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451338
13234	NC_018609	TAAGTT	2	12	588658	588669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407451338
13235	NC_018609	GTG	2	6	588748	588753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451338
13236	NC_018609	ATCT	2	8	588758	588765	25 %	50 %	0 %	25 %	407451338
13237	NC_018609	AAAT	2	8	588785	588792	75 %	25 %	0 %	0 %	407451338
13238	NC_018609	TGC	2	6	588842	588847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451338
13239	NC_018609	CAC	2	6	588901	588906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451338
13240	NC_018609	AC	3	6	588913	588918	50 %	0 %	0 %	50 %	407451338
13241	NC_018609	A	8	8	589319	589326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_018609	TAT	2	6	589360	589365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451339
13243	NC_018609	CTT	2	6	589405	589410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451339
13244	NC_018609	TGA	2	6	589500	589505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451339
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