MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_018609	TAA	2	6	512206	512211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451260
11503	NC_018609	TCA	2	6	512216	512221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451260
11504	NC_018609	CCA	2	6	512238	512243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451260
11505	NC_018609	CAT	2	6	512265	512270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451260
11506	NC_018609	ATC	2	6	512278	512283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451260
11507	NC_018609	TAA	2	6	512349	512354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451260
11508	NC_018609	TCT	3	9	512375	512383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451260
11509	NC_018609	CAC	2	6	512443	512448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451260
11510	NC_018609	GTTT	2	8	512530	512537	0 %	75 %	25 %	0 %	407451260
11511	NC_018609	AGAATA	2	12	512568	512579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407451260
11512	NC_018609	ATG	2	6	512648	512653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451260
11513	NC_018609	CTG	2	6	512676	512681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451260
11514	NC_018609	CTT	2	6	512757	512762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451260
11515	NC_018609	TCCA	2	8	512765	512772	25 %	25 %	0 %	50 %	407451260
11516	NC_018609	TAG	2	6	512778	512783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451260
11517	NC_018609	TAGAA	2	10	512828	512837	60 %	20 %	20 %	0 %	407451260
11518	NC_018609	AGT	3	9	512845	512853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451260
11519	NC_018609	GCA	2	6	512996	513001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451261
11520	NC_018609	TCC	2	6	513005	513010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451261
11521	NC_018609	AGC	3	9	513013	513021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451261
11522	NC_018609	AAT	2	6	513022	513027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451261
11523	NC_018609	CAG	2	6	513030	513035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451261
11524	NC_018609	TAA	2	6	513081	513086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451261
11525	NC_018609	CAC	2	6	513150	513155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451261
11526	NC_018609	CTT	2	6	513161	513166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451261
11527	NC_018609	CATTA	2	10	513187	513196	40 %	40 %	0 %	20 %	407451261
11528	NC_018609	T	6	6	513228	513233	0 %	100 %	0 %	0 %	407451261
11529	NC_018609	T	6	6	513244	513249	0 %	100 %	0 %	0 %	407451261
11530	NC_018609	CAT	2	6	513270	513275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451261
11531	NC_018609	CTT	2	6	513298	513303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451261
11532	NC_018609	AAC	2	6	513368	513373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451261
11533	NC_018609	T	7	7	513378	513384	0 %	100 %	0 %	0 %	407451261
11534	NC_018609	TCT	2	6	513470	513475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451262
11535	NC_018609	CAC	2	6	513511	513516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451262
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11537	NC_018609	TA	3	6	513697	513702	50 %	50 %	0 %	0 %	407451262
11538	NC_018609	TACA	2	8	513709	513716	50 %	25 %	0 %	25 %	407451262
11539	NC_018609	CT	3	6	513718	513723	0 %	50 %	0 %	50 %	407451262
11540	NC_018609	AGC	2	6	513743	513748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451262
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11542	NC_018609	TTG	2	6	513794	513799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451262
11543	NC_018609	TAG	2	6	513802	513807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451262
11544	NC_018609	TATT	2	8	513823	513830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_018609	T	8	8	513856	513863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_018609	ATT	2	6	513876	513881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_018609	ATTT	2	8	513883	513890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_018609	CTT	2	6	513895	513900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_018609	T	6	6	513950	513955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_018609	ATT	2	6	513967	513972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_018609	AAC	2	6	513991	513996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451263
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11553	NC_018609	ATT	2	6	514075	514080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451263
11554	NC_018609	A	6	6	514107	514112	100 %	0 %	0 %	0 %	407451263
11555	NC_018609	TA	3	6	514126	514131	50 %	50 %	0 %	0 %	407451263
11556	NC_018609	T	6	6	514142	514147	0 %	100 %	0 %	0 %	407451263
11557	NC_018609	AAC	2	6	514148	514153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451263
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11589	NC_018609	TGT	2	6	515442	515447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451264
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11612	NC_018609	TA	3	6	516288	516293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_018609	CTCCTA	2	12	516318	516329	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407451266
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11619	NC_018609	TCTT	2	8	516650	516657	0 %	75 %	0 %	25 %	407451266
11620	NC_018609	TAT	2	6	516669	516674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451266
11621	NC_018609	TTTA	2	8	516703	516710	25 %	75 %	0 %	0 %	407451266
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11994	NC_018609	CAA	2	6	534424	534429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451282
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11996	NC_018609	CAA	2	6	534478	534483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451282
11997	NC_018609	A	6	6	534498	534503	100 %	0 %	0 %	0 %	407451282
11998	NC_018609	A	6	6	534549	534554	100 %	0 %	0 %	0 %	407451282
11999	NC_018609	GCT	2	6	534572	534577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451282
12000	NC_018609	CCG	2	6	534581	534586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407451282

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