MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018609	CTT	2	6	487387	487392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451236
11002	NC_018609	ATT	2	6	487410	487415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451236
11003	NC_018609	AGA	2	6	487435	487440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11004	NC_018609	A	6	6	487523	487528	100 %	0 %	0 %	0 %	407451236
11005	NC_018609	CA	3	6	487547	487552	50 %	0 %	0 %	50 %	407451236
11006	NC_018609	TCC	2	6	487564	487569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451236
11007	NC_018609	ATT	2	6	487598	487603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451236
11008	NC_018609	GGGT	2	8	487617	487624	0 %	25 %	75 %	0 %	407451236
11009	NC_018609	CTT	2	6	487676	487681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451236
11010	NC_018609	AGA	2	6	487690	487695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11011	NC_018609	ATG	2	6	487698	487703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451236
11012	NC_018609	GTA	2	6	487739	487744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451236
11013	NC_018609	AGAT	2	8	487779	487786	50 %	25 %	25 %	0 %	407451236
11014	NC_018609	AATC	2	8	487825	487832	50 %	25 %	0 %	25 %	407451236
11015	NC_018609	CTA	2	6	487857	487862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451236
11016	NC_018609	AAG	2	6	487864	487869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11017	NC_018609	ACCAA	2	10	487880	487889	60 %	0 %	0 %	40 %	407451236
11018	NC_018609	GCTA	2	8	487891	487898	25 %	25 %	25 %	25 %	407451236
11019	NC_018609	TAC	2	6	487925	487930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451236
11020	NC_018609	AAG	2	6	487960	487965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11021	NC_018609	TGC	2	6	487999	488004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451236
11022	NC_018609	AGA	2	6	488018	488023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11023	NC_018609	TC	3	6	488135	488140	0 %	50 %	0 %	50 %	407451236
11024	NC_018609	TGA	2	6	488161	488166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451236
11025	NC_018609	ACA	2	6	488172	488177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451236
11026	NC_018609	GAA	2	6	488270	488275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11027	NC_018609	T	6	6	488287	488292	0 %	100 %	0 %	0 %	407451236
11028	NC_018609	AAG	2	6	488298	488303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451236
11029	NC_018609	TCA	3	9	488307	488315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451236
11030	NC_018609	TTTAA	2	10	488408	488417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_018609	A	6	6	488424	488429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_018609	TATCC	2	10	488448	488457	20 %	40 %	0 %	40 %	407451237
11033	NC_018609	CGG	2	6	488480	488485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407451237
11034	NC_018609	A	6	6	488521	488526	100 %	0 %	0 %	0 %	407451237
11035	NC_018609	CTG	2	6	488533	488538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451237
11036	NC_018609	A	6	6	488592	488597	100 %	0 %	0 %	0 %	407451237
11037	NC_018609	TAG	2	6	488605	488610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451237
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11039	NC_018609	GAT	2	6	488634	488639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451237
11040	NC_018609	CT	3	6	488657	488662	0 %	50 %	0 %	50 %	407451237
11041	NC_018609	TGA	2	6	488669	488674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451237
11042	NC_018609	GGA	2	6	488714	488719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451237
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11045	NC_018609	ATTGGG	2	12	488845	488856	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407451237
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11051	NC_018609	TG	3	6	489177	489182	0 %	50 %	50 %	0 %	407451237
11052	NC_018609	CTA	2	6	489195	489200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451237
11053	NC_018609	TGCC	2	8	489215	489222	0 %	25 %	25 %	50 %	407451237
11054	NC_018609	CTA	2	6	489299	489304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451237
11055	NC_018609	A	7	7	489324	489330	100 %	0 %	0 %	0 %	407451238
11056	NC_018609	TAT	2	6	489408	489413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451238
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11065	NC_018609	CAT	2	6	489782	489787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451238
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11069	NC_018609	TACCGT	2	12	489875	489886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407451238
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11071	NC_018609	TAA	2	6	489917	489922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_018609	AAAT	2	8	489939	489946	75 %	25 %	0 %	0 %	407451239
11073	NC_018609	CAT	2	6	490065	490070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451239
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11089	NC_018609	TTCG	2	8	490829	490836	0 %	50 %	25 %	25 %	407451239
11090	NC_018609	ATAC	2	8	490867	490874	50 %	25 %	0 %	25 %	407451239
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11110	NC_018609	A	7	7	491976	491982	100 %	0 %	0 %	0 %	407451240
11111	NC_018609	GA	3	6	491986	491991	50 %	0 %	50 %	0 %	407451240
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11491	NC_018609	TCT	3	9	511583	511591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451260
11492	NC_018609	TTC	2	6	511703	511708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451260
11493	NC_018609	TCA	2	6	511709	511714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451260
11494	NC_018609	TTA	2	6	511799	511804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451260
11495	NC_018609	TTCT	2	8	511830	511837	0 %	75 %	0 %	25 %	407451260
11496	NC_018609	CTG	2	6	511982	511987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451260
11497	NC_018609	ATC	2	6	512023	512028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451260
11498	NC_018609	AGGT	2	8	512044	512051	25 %	25 %	50 %	0 %	407451260
11499	NC_018609	ATG	2	6	512097	512102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451260
11500	NC_018609	ATA	2	6	512120	512125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451260

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