MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018609	TCGC	2	8	361799	361806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_018609	ACT	2	6	361808	361813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_018609	TCC	2	6	361837	361842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_018609	GT	3	6	361943	361948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_018609	TCG	2	6	361986	361991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_018609	TTTC	2	8	362031	362038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_018609	T	7	7	362043	362049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_018609	TGCT	2	8	362123	362130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_018609	TGT	2	6	362149	362154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_018609	TAAAT	2	10	362177	362186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_018609	CCT	2	6	362226	362231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_018609	AGGC	2	8	362239	362246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_018609	CTT	2	6	362320	362325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_018609	TAG	2	6	362362	362367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_018609	TCTT	2	8	362518	362525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_018609	TA	3	6	362558	362563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_018609	A	7	7	362573	362579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_018609	TAAG	2	8	362592	362599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_018609	CT	3	6	362600	362605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_018609	GT	3	6	362773	362778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_018609	GT	3	6	362942	362947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_018609	TGA	2	6	362968	362973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_018609	CT	3	6	362995	363000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_018609	ATG	2	6	363037	363042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_018609	GAC	2	6	363105	363110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_018609	GCA	2	6	363117	363122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_018609	GAA	2	6	363138	363143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_018609	ATC	2	6	363200	363205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_018609	ACT	2	6	363481	363486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_018609	CAC	2	6	363559	363564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_018609	GCT	2	6	363640	363645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_018609	AAG	2	6	363721	363726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_018609	CGT	2	6	363744	363749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_018609	CTG	2	6	363803	363808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_018609	CCG	2	6	363939	363944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_018609	CGC	2	6	364055	364060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_018609	T	6	6	364194	364199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_018609	GTT	2	6	364209	364214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_018609	TTC	2	6	364238	364243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_018609	T	8	8	364301	364308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_018609	A	6	6	364328	364333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_018609	ATT	2	6	364340	364345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_018609	T	7	7	364344	364350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_018609	ACT	2	6	364357	364362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_018609	CCT	2	6	364382	364387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_018609	ACT	2	6	364405	364410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_018609	TCT	2	6	364423	364428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_018609	AATC	2	8	364429	364436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8049	NC_018609	CT	4	8	364445	364452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_018609	T	7	7	364509	364515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_018609	CATAT	2	10	364517	364526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8052	NC_018609	AGAT	2	8	364564	364571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_018609	AT	3	6	364570	364575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_018609	AT	4	8	364590	364597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_018609	TTC	2	6	364644	364649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451111
8056	NC_018609	GTA	2	6	364688	364693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451111
8057	NC_018609	ATG	2	6	364803	364808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451111
8058	NC_018609	T	6	6	364818	364823	0 %	100 %	0 %	0 %	407451111
8059	NC_018609	ATT	2	6	364858	364863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451111
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8062	NC_018609	TCA	2	6	365104	365109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451111
8063	NC_018609	TGTT	2	8	365149	365156	0 %	75 %	25 %	0 %	407451111
8064	NC_018609	T	6	6	365236	365241	0 %	100 %	0 %	0 %	407451111
8065	NC_018609	GAG	2	6	365242	365247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451111
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8068	NC_018609	TCA	2	6	365296	365301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451111
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8071	NC_018609	T	6	6	365367	365372	0 %	100 %	0 %	0 %	407451111
8072	NC_018609	TAAATC	2	12	365403	365414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407451111
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8076	NC_018609	TA	3	6	365499	365504	50 %	50 %	0 %	0 %	407451111
8077	NC_018609	T	7	7	365540	365546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_018609	TCA	2	6	365607	365612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_018609	ATTAT	2	10	365645	365654	40 %	60 %	0 %	0 %	407451112
8081	NC_018609	TTG	2	6	365681	365686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451112
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8088	NC_018609	TTA	2	6	366142	366147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451112
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8092	NC_018609	TAA	2	6	366373	366378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_018609	GTA	2	6	366386	366391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_018609	ACT	2	6	366595	366600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451113
8102	NC_018609	CAT	2	6	366605	366610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451113
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8104	NC_018609	TAA	2	6	366656	366661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451113
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8108	NC_018609	T	6	6	366773	366778	0 %	100 %	0 %	0 %	407451113
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8113	NC_018609	AT	3	6	366922	366927	50 %	50 %	0 %	0 %	407451114
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8116	NC_018609	T	7	7	367014	367020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_018609	ACTC	2	8	367141	367148	25 %	25 %	0 %	50 %	407451115
8118	NC_018609	ACTAA	2	10	367233	367242	60 %	20 %	0 %	20 %	407451115
8119	NC_018609	AGATTA	2	12	367263	367274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407451115
8120	NC_018609	T	8	8	367282	367289	0 %	100 %	0 %	0 %	407451115
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8126	NC_018609	TCTT	2	8	367445	367452	0 %	75 %	0 %	25 %	407451115
8127	NC_018609	AT	3	6	367515	367520	50 %	50 %	0 %	0 %	407451115
8128	NC_018609	AAGTT	2	10	367521	367530	40 %	40 %	20 %	0 %	407451115
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