MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018609	CAG	2	6	289320	289325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6502	NC_018609	AAC	2	6	289338	289343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6503	NC_018609	AGA	2	6	289490	289495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6504	NC_018609	GAG	2	6	289521	289526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451053
6505	NC_018609	AG	4	8	289549	289556	50 %	0 %	50 %	0 %	407451053
6506	NC_018609	AGA	2	6	289611	289616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6507	NC_018609	CAT	2	6	289658	289663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451053
6508	NC_018609	TGG	2	6	289726	289731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407451053
6509	NC_018609	AG	3	6	289740	289745	50 %	0 %	50 %	0 %	407451053
6510	NC_018609	CAA	2	6	289778	289783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6511	NC_018609	GAA	2	6	289788	289793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6512	NC_018609	CAA	2	6	289818	289823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6513	NC_018609	CAG	2	6	289914	289919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6514	NC_018609	CTTAG	2	10	289929	289938	20 %	40 %	20 %	20 %	407451053
6515	NC_018609	CTA	3	9	289955	289963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451053
6516	NC_018609	CTTG	2	8	290082	290089	0 %	50 %	25 %	25 %	407451053
6517	NC_018609	GAA	2	6	290124	290129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6518	NC_018609	ACA	2	6	290231	290236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6519	NC_018609	CAA	2	6	290240	290245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6520	NC_018609	TTC	2	6	290304	290309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451053
6521	NC_018609	AGA	2	6	290318	290323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6522	NC_018609	CTA	2	6	290361	290366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451053
6523	NC_018609	TACC	2	8	290396	290403	25 %	25 %	0 %	50 %	407451053
6524	NC_018609	TAA	2	6	290438	290443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451053
6525	NC_018609	AAGA	2	8	290496	290503	75 %	0 %	25 %	0 %	407451053
6526	NC_018609	AGC	2	6	290534	290539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6527	NC_018609	TCAG	2	8	290596	290603	25 %	25 %	25 %	25 %	407451053
6528	NC_018609	AGA	2	6	290609	290614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6529	NC_018609	CAC	2	6	290619	290624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451053
6530	NC_018609	TCC	2	6	290671	290676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451053
6531	NC_018609	AAGC	2	8	290692	290699	50 %	0 %	25 %	25 %	407451053
6532	NC_018609	AGG	2	6	290713	290718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451053
6533	NC_018609	AT	3	6	290822	290827	50 %	50 %	0 %	0 %	407451053
6534	NC_018609	CTA	2	6	290861	290866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451053
6535	NC_018609	CCA	2	6	290867	290872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451053
6536	NC_018609	CAT	2	6	290876	290881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451053
6537	NC_018609	AAAG	2	8	290909	290916	75 %	0 %	25 %	0 %	407451053
6538	NC_018609	AGA	3	9	290926	290934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6539	NC_018609	AGCTC	2	10	290947	290956	20 %	20 %	20 %	40 %	407451053
6540	NC_018609	AAAC	2	8	290990	290997	75 %	0 %	0 %	25 %	407451053
6541	NC_018609	GCAAA	2	10	291039	291048	60 %	0 %	20 %	20 %	407451053
6542	NC_018609	ACCG	2	8	291075	291082	25 %	0 %	25 %	50 %	407451053
6543	NC_018609	TGC	2	6	291091	291096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6544	NC_018609	TAATG	2	10	291290	291299	40 %	40 %	20 %	0 %	407451053
6545	NC_018609	GAC	2	6	291309	291314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6546	NC_018609	ACA	2	6	291317	291322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451053
6547	NC_018609	GCG	2	6	291469	291474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407451053
6548	NC_018609	CA	3	6	291542	291547	50 %	0 %	0 %	50 %	407451053
6549	NC_018609	ACG	2	6	291649	291654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451053
6550	NC_018609	TACA	2	8	291783	291790	50 %	25 %	0 %	25 %	407451053
6551	NC_018609	CAC	2	6	291953	291958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451053
6552	NC_018609	ATG	2	6	291993	291998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451053
6553	NC_018609	ACCGAA	2	12	292008	292019	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407451053
6554	NC_018609	CCA	2	6	292021	292026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451053
6555	NC_018609	CAC	2	6	292032	292037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451053
6556	NC_018609	AGA	2	6	292054	292059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6557	NC_018609	CGGA	2	8	292129	292136	25 %	0 %	50 %	25 %	407451053
6558	NC_018609	AAG	2	6	292150	292155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451053
6559	NC_018609	AGCT	2	8	292167	292174	25 %	25 %	25 %	25 %	407451053
6560	NC_018609	CCA	2	6	292175	292180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_018609	GCT	2	6	292222	292227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_018609	CTC	2	6	292250	292255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_018609	CACG	2	8	292265	292272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_018609	CACCCC	2	12	292319	292330	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	407451054
6565	NC_018609	CCA	2	6	292356	292361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451054
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6567	NC_018609	CA	3	6	292381	292386	50 %	0 %	0 %	50 %	407451054
6568	NC_018609	CAAAA	2	10	292390	292399	80 %	0 %	0 %	20 %	407451054
6569	NC_018609	A	6	6	292396	292401	100 %	0 %	0 %	0 %	407451054
6570	NC_018609	GAG	2	6	292432	292437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407451054
6571	NC_018609	T	6	6	292443	292448	0 %	100 %	0 %	0 %	407451054
6572	NC_018609	GA	3	6	292534	292539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_018609	AGT	2	6	292543	292548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_018609	AT	3	6	292621	292626	50 %	50 %	0 %	0 %	407451055
6575	NC_018609	TTTCT	2	10	292649	292658	0 %	80 %	0 %	20 %	407451055
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6581	NC_018609	CAAT	2	8	292822	292829	50 %	25 %	0 %	25 %	407451055
6582	NC_018609	AT	3	6	292828	292833	50 %	50 %	0 %	0 %	407451055
6583	NC_018609	TTCT	2	8	292992	292999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6585	NC_018609	ATC	2	6	293018	293023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6587	NC_018609	CTAT	2	8	293046	293053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6588	NC_018609	ATA	2	6	293080	293085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_018609	GAT	2	6	293096	293101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6591	NC_018609	GCG	2	6	293149	293154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_018609	GA	3	6	293237	293242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_018609	TAAA	2	8	293348	293355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_018609	GAA	2	6	293566	293571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_018609	CTT	2	6	293743	293748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_018609	AG	3	6	293764	293769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_018609	CAG	2	6	293819	293824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_018609	TTC	2	6	293867	293872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_018609	A	6	6	293900	293905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_018609	AT	3	6	293931	293936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_018609	TGT	2	6	293945	293950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_018609	TAA	2	6	293997	294002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_018609	T	7	7	294013	294019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_018609	ATC	2	6	294052	294057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6606	NC_018609	T	6	6	294144	294149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_018609	TACTT	2	10	294194	294203	20 %	60 %	0 %	20 %	407451056
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6610	NC_018609	T	6	6	294293	294298	0 %	100 %	0 %	0 %	407451056
6611	NC_018609	TAT	2	6	294341	294346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451056
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6614	NC_018609	T	6	6	294385	294390	0 %	100 %	0 %	0 %	407451056
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6624	NC_018609	ATC	2	6	294619	294624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_018609	AT	3	6	294646	294651	50 %	50 %	0 %	0 %	407451057
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