MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 1482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	G	6	6	56	61	0 %	0 %	100 %	0 %	386844998
2	NC_017773	GA	3	6	106	111	50 %	0 %	50 %	0 %	386844998
3	NC_017773	CGA	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844998
4	NC_017773	AAC	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844998
5	NC_017773	ATAC	2	8	296	303	50 %	25 %	0 %	25 %	386844998
6	NC_017773	AG	3	6	358	363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017773	CTG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017773	TGA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017773	GCTTT	2	10	554	563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017773	CTG	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017773	TTTC	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017773	TGC	2	6	704	709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
13	NC_017773	ATG	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844999
14	NC_017773	CAG	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
15	NC_017773	GAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844999
16	NC_017773	GTG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844999
17	NC_017773	GCG	2	6	979	984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844999
18	NC_017773	TGC	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
19	NC_017773	AGC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
20	NC_017773	GTC	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
21	NC_017773	GTTG	2	8	1115	1122	0 %	50 %	50 %	0 %	386844999
22	NC_017773	CGC	2	6	1131	1136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844999
23	NC_017773	TGT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844999
24	NC_017773	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844999
25	NC_017773	GAC	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
26	NC_017773	GTGA	2	8	1437	1444	25 %	25 %	50 %	0 %	386844999
27	NC_017773	ATC	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
28	NC_017773	ACGA	2	8	1462	1469	50 %	0 %	25 %	25 %	386844999
29	NC_017773	TGCT	2	8	1552	1559	0 %	50 %	25 %	25 %	386844999
30	NC_017773	GAA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844999
31	NC_017773	TTG	2	6	1702	1707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844999
32	NC_017773	TCA	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
33	NC_017773	TAT	2	6	1752	1757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844999
34	NC_017773	TCA	2	6	1784	1789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
35	NC_017773	GCT	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
36	NC_017773	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	386844999
37	NC_017773	CCT	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845000
38	NC_017773	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845000
39	NC_017773	CAGA	2	8	2283	2290	50 %	0 %	25 %	25 %	386845000
40	NC_017773	GAA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
41	NC_017773	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
42	NC_017773	TCG	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845000
43	NC_017773	AGC	2	6	2576	2581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
44	NC_017773	CCT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845000
45	NC_017773	GAGAA	2	10	2676	2685	60 %	0 %	40 %	0 %	386845000
46	NC_017773	CCGT	2	8	2692	2699	0 %	25 %	25 %	50 %	386845000
47	NC_017773	CAG	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
48	NC_017773	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
49	NC_017773	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
50	NC_017773	GAAT	2	8	2965	2972	50 %	25 %	25 %	0 %	386845001
51	NC_017773	A	6	6	2976	2981	100 %	0 %	0 %	0 %	386845001
52	NC_017773	TAA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845001
53	NC_017773	GGCGG	2	10	3120	3129	0 %	0 %	80 %	20 %	386845001
54	NC_017773	GCC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
55	NC_017773	CCG	2	6	3226	3231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
56	NC_017773	G	6	6	3245	3250	0 %	0 %	100 %	0 %	386845001
57	NC_017773	CAA	2	6	3307	3312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845001
58	NC_017773	CAG	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845001
59	NC_017773	AATG	2	8	3326	3333	50 %	25 %	25 %	0 %	386845001
60	NC_017773	ATG	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845001
61	NC_017773	AGCC	2	8	3386	3393	25 %	0 %	25 %	50 %	386845001
62	NC_017773	GCG	2	6	3395	3400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845001
63	NC_017773	TGC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
64	NC_017773	CGC	2	6	3454	3459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
65	NC_017773	GAT	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845001
66	NC_017773	GCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
67	NC_017773	GC	3	6	3758	3763	0 %	0 %	50 %	50 %	386845001
68	NC_017773	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845001
69	NC_017773	GCT	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
70	NC_017773	GCGT	2	8	3913	3920	0 %	25 %	50 %	25 %	386845001
71	NC_017773	CTGT	2	8	3954	3961	0 %	50 %	25 %	25 %	386845001
72	NC_017773	GAA	3	9	3972	3980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845001
73	NC_017773	GTCA	2	8	3999	4006	25 %	25 %	25 %	25 %	386845001
74	NC_017773	AAATA	2	10	4118	4127	80 %	20 %	0 %	0 %	386845001
75	NC_017773	TA	3	6	4126	4131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017773	AAAT	2	8	4174	4181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017773	GCT	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017773	AGC	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017773	CAG	2	6	4254	4259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017773	AGG	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017773	CTT	2	6	4352	4357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017773	AATA	2	8	4438	4445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017773	TA	3	6	4491	4496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017773	A	6	6	4560	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
85	NC_017773	CAA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845002
86	NC_017773	ACG	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845002
87	NC_017773	ATT	2	6	4633	4638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
88	NC_017773	GTG	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
89	NC_017773	TAT	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
90	NC_017773	CTG	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845002
91	NC_017773	TAT	2	6	4838	4843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
92	NC_017773	CTG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845002
93	NC_017773	GGT	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
94	NC_017773	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845002
95	NC_017773	AGC	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845002
96	NC_017773	GTG	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
97	NC_017773	CTGC	2	8	5242	5249	0 %	25 %	25 %	50 %	386845002
98	NC_017773	TAG	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845002
99	NC_017773	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
100	NC_017773	AAG	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845002
101	NC_017773	CGTTA	2	10	5464	5473	20 %	40 %	20 %	20 %	386845002
102	NC_017773	A	6	6	5504	5509	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
103	NC_017773	ACC	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845002
104	NC_017773	ATTT	2	8	5565	5572	25 %	75 %	0 %	0 %	386845002
105	NC_017773	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017773	TG	3	6	5725	5730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017773	CATTTG	2	12	5787	5798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017773	TGC	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017773	GCTT	2	8	5827	5834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017773	TAAG	2	8	5860	5867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017773	TGT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845003
112	NC_017773	CGA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845003
113	NC_017773	AGG	2	6	6008	6013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845003
114	NC_017773	TGA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845003
115	NC_017773	GGC	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845003
116	NC_017773	CTG	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845003
117	NC_017773	CAA	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845003
118	NC_017773	ACA	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845003
119	NC_017773	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845003
120	NC_017773	AGGG	2	8	6473	6480	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017773	TGC	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845004
122	NC_017773	TCT	2	6	6576	6581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845004
123	NC_017773	CAG	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017773	ATC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017773	GTC	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017773	ATT	2	6	6713	6718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845005
127	NC_017773	GCTG	2	8	6756	6763	0 %	25 %	50 %	25 %	386845005
128	NC_017773	CAT	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845005
129	NC_017773	AT	3	6	6860	6865	50 %	50 %	0 %	0 %	386845005
130	NC_017773	ATTC	2	8	7264	7271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017773	ATGTT	2	10	7325	7334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017773	ATG	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017773	TAG	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017773	CTG	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017773	TCA	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017773	GAT	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845006
137	NC_017773	CAG	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845006
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142	NC_017773	TGA	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845006
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155	NC_017773	TGAG	2	8	8423	8430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_017773	ATC	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_017773	TTTTA	2	10	20873	20882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017773	TCC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
405	NC_017773	ATG	2	6	21109	21114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845017
406	NC_017773	TGA	2	6	21146	21151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845017
407	NC_017773	TCA	2	6	21154	21159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845017
408	NC_017773	CTGGA	2	10	21181	21190	20 %	20 %	40 %	20 %	386845017
409	NC_017773	TGC	2	6	21191	21196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845017
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411	NC_017773	CAGGG	2	10	21325	21334	20 %	0 %	60 %	20 %	386845017
412	NC_017773	GGC	2	6	21335	21340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845017
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421	NC_017773	ATTAA	2	10	21707	21716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_017773	AAAT	2	8	21840	21847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_017773	AG	3	6	21853	21858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017773	GAT	2	6	21975	21980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017773	TGCC	2	8	21986	21993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
428	NC_017773	GACT	2	8	21996	22003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
429	NC_017773	CAC	2	6	22193	22198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845018
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431	NC_017773	TCAG	2	8	22274	22281	25 %	25 %	25 %	25 %	386845018
432	NC_017773	G	6	6	22331	22336	0 %	0 %	100 %	0 %	386845018
433	NC_017773	GCAA	2	8	22377	22384	50 %	0 %	25 %	25 %	386845018
434	NC_017773	AGA	2	6	22412	22417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845018
435	NC_017773	TTA	2	6	22614	22619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017773	AGA	2	6	22756	22761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845019
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452	NC_017773	TAC	2	6	23392	23397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845019
453	NC_017773	TAT	2	6	23510	23515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017773	TCA	2	6	23576	23581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845020
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477	NC_017773	GAA	2	6	25122	25127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_017773	TTA	2	6	25909	25914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_017773	TACT	2	8	25926	25933	25 %	50 %	0 %	25 %	386845022
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