MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017584	CGG	2	6	650238	650243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16502	NC_017584	GC	3	6	650275	650280	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
16503	NC_017584	GGC	2	6	650287	650292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16504	NC_017584	TCC	2	6	650300	650305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348583
16505	NC_017584	AGC	2	6	650318	650323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16506	NC_017584	TCG	2	6	650357	650362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16507	NC_017584	AGGGCT	2	12	650369	650380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386348583
16508	NC_017584	GCG	2	6	650390	650395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16509	NC_017584	CGG	2	6	650478	650483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16510	NC_017584	AGGGC	2	10	650493	650502	20 %	0 %	60 %	20 %	386348583
16511	NC_017584	TCG	2	6	650561	650566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16512	NC_017584	CTT	2	6	650604	650609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348583
16513	NC_017584	GGCC	2	8	650631	650638	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
16514	NC_017584	CGC	2	6	650653	650658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
16515	NC_017584	CCA	2	6	650679	650684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348583
16516	NC_017584	GCG	2	6	650711	650716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16517	NC_017584	CGGC	2	8	650717	650724	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
16518	NC_017584	GCA	3	9	650730	650738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16519	NC_017584	GGC	2	6	650745	650750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16520	NC_017584	TCG	2	6	650765	650770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16521	NC_017584	CGT	2	6	650787	650792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16522	NC_017584	CTC	2	6	650827	650832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348583
16523	NC_017584	CGG	2	6	650862	650867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16524	NC_017584	CGG	2	6	650883	650888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16525	NC_017584	GC	3	6	650911	650916	0 %	0 %	50 %	50 %	386348583
16526	NC_017584	GCCA	2	8	650942	650949	25 %	0 %	25 %	50 %	386348583
16527	NC_017584	CCG	2	6	650976	650981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
16528	NC_017584	GCC	2	6	650999	651004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
16529	NC_017584	GGCCAA	2	12	651012	651023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16530	NC_017584	GCC	2	6	651115	651120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
16531	NC_017584	CGGGG	2	10	651169	651178	0 %	0 %	80 %	20 %	386348583
16532	NC_017584	GGC	2	6	651179	651184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16533	NC_017584	GCG	2	6	651230	651235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_017584	GCC	2	6	651265	651270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16535	NC_017584	C	7	7	651319	651325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16536	NC_017584	GGC	2	6	651329	651334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_017584	GCC	2	6	651346	651351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16538	NC_017584	GC	3	6	651390	651395	0 %	0 %	50 %	50 %	386348584
16539	NC_017584	GCC	2	6	651400	651405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
16540	NC_017584	G	6	6	651413	651418	0 %	0 %	100 %	0 %	386348584
16541	NC_017584	CTG	2	6	651481	651486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348584
16542	NC_017584	CGG	4	12	651524	651535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16543	NC_017584	GC	3	6	651559	651564	0 %	0 %	50 %	50 %	386348584
16544	NC_017584	GAT	2	6	651571	651576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348584
16545	NC_017584	GCG	2	6	651611	651616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16546	NC_017584	GCG	2	6	651631	651636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16547	NC_017584	GCC	3	9	651637	651645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
16548	NC_017584	CGA	2	6	651711	651716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348584
16549	NC_017584	GAG	2	6	651730	651735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348584
16550	NC_017584	CGG	2	6	651751	651756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16551	NC_017584	CGG	2	6	651773	651778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16552	NC_017584	CGC	2	6	651786	651791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
16553	NC_017584	GGCGC	3	15	651813	651827	0 %	0 %	60 %	40 %	386348584
16554	NC_017584	GGC	2	6	651837	651842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16555	NC_017584	GGC	2	6	651858	651863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16556	NC_017584	TGC	2	6	651911	651916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348584
16557	NC_017584	GCC	2	6	651931	651936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
16558	NC_017584	GCG	2	6	651954	651959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16559	NC_017584	CTG	3	9	652012	652020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348584
16560	NC_017584	CG	3	6	652072	652077	0 %	0 %	50 %	50 %	386348584
16561	NC_017584	GGC	2	6	652082	652087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16562	NC_017584	CGG	2	6	652135	652140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16563	NC_017584	GGC	2	6	652182	652187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16564	NC_017584	GC	3	6	652186	652191	0 %	0 %	50 %	50 %	386348584
16565	NC_017584	GGT	2	6	652287	652292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348584
16566	NC_017584	GCG	3	9	652309	652317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16567	NC_017584	GGC	2	6	652383	652388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
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16569	NC_017584	ACGCCG	2	12	652423	652434	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386348584
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16571	NC_017584	G	6	6	652449	652454	0 %	0 %	100 %	0 %	386348584
16572	NC_017584	CG	3	6	652516	652521	0 %	0 %	50 %	50 %	386348584
16573	NC_017584	GCC	2	6	652531	652536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348584
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16575	NC_017584	CTT	2	6	652569	652574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348584
16576	NC_017584	GGC	2	6	652608	652613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16577	NC_017584	TCGATC	2	12	652631	652642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386348584
16578	NC_017584	CGG	3	9	652667	652675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16579	NC_017584	TGG	2	6	652694	652699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348584
16580	NC_017584	ACC	2	6	652702	652707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348584
16581	NC_017584	CTGC	2	8	652749	652756	0 %	25 %	25 %	50 %	386348584
16582	NC_017584	GGC	2	6	652764	652769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16583	NC_017584	TTG	2	6	652831	652836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348584
16584	NC_017584	GGCG	2	8	652859	652866	0 %	0 %	75 %	25 %	386348584
16585	NC_017584	GCG	2	6	652879	652884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16586	NC_017584	CTG	2	6	652888	652893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348584
16587	NC_017584	GCG	2	6	652902	652907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348584
16588	NC_017584	ATG	2	6	652938	652943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348584
16589	NC_017584	GATC	2	8	653095	653102	25 %	25 %	25 %	25 %	386348585
16590	NC_017584	CAT	2	6	653111	653116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348585
16591	NC_017584	ATC	2	6	653151	653156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348585
16592	NC_017584	AT	3	6	653244	653249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16593	NC_017584	CG	3	6	653287	653292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16594	NC_017584	GC	3	6	653324	653329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_017584	CGCC	2	8	653360	653367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16596	NC_017584	CGGG	2	8	653407	653414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16597	NC_017584	CGTCAT	2	12	653438	653449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16598	NC_017584	AGG	2	6	653474	653479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_017584	CCG	2	6	653517	653522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16600	NC_017584	TCG	3	9	653549	653557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16601	NC_017584	CGC	2	6	653607	653612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16602	NC_017584	CCTT	2	8	653663	653670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16603	NC_017584	GGCG	2	8	653698	653705	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16604	NC_017584	CGGG	2	8	653737	653744	0 %	0 %	75 %	25 %	386348586
16605	NC_017584	G	7	7	653742	653748	0 %	0 %	100 %	0 %	386348586
16606	NC_017584	CGG	2	6	653764	653769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348586
16607	NC_017584	TCG	2	6	653796	653801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348586
16608	NC_017584	GCC	2	6	653825	653830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348586
16609	NC_017584	CGA	2	6	653839	653844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348586
16610	NC_017584	CGC	2	6	653884	653889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348586
16611	NC_017584	CCG	2	6	653895	653900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348586
16612	NC_017584	CGGTGA	2	12	653968	653979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386348586
16613	NC_017584	GGCGG	2	10	654032	654041	0 %	0 %	80 %	20 %	386348586
16614	NC_017584	TCG	2	6	654108	654113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348586
16615	NC_017584	TCG	2	6	654132	654137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348586
16616	NC_017584	GCG	2	6	654150	654155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348586
16617	NC_017584	GCTG	2	8	654234	654241	0 %	25 %	50 %	25 %	386348586
16618	NC_017584	GGT	2	6	654242	654247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348586
16619	NC_017584	AAT	2	6	654256	654261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386348586
16620	NC_017584	ATC	2	6	654276	654281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348586
16621	NC_017584	GCG	3	9	654356	654364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348586
16622	NC_017584	GCG	2	6	654465	654470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348586
16623	NC_017584	GCT	2	6	654517	654522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348586
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16984	NC_017584	GCG	2	6	668176	668181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16985	NC_017584	G	6	6	668195	668200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16986	NC_017584	CCGC	2	8	668207	668214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16987	NC_017584	CGT	2	6	668215	668220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16988	NC_017584	GAT	2	6	668353	668358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348598
16989	NC_017584	GGC	2	6	668449	668454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348598
16990	NC_017584	GAG	2	6	668480	668485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348598
16991	NC_017584	GGT	2	6	668530	668535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348598
16992	NC_017584	GGC	2	6	668545	668550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348598
16993	NC_017584	GT	3	6	668668	668673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16994	NC_017584	CGG	2	6	668765	668770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348599
16995	NC_017584	G	7	7	668786	668792	0 %	0 %	100 %	0 %	386348599
16996	NC_017584	G	7	7	668803	668809	0 %	0 %	100 %	0 %	386348599
16997	NC_017584	CGC	2	6	668810	668815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348599
16998	NC_017584	TCA	2	6	669017	669022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348599
16999	NC_017584	TGCAT	2	10	669023	669032	20 %	40 %	20 %	20 %	386348599
17000	NC_017584	G	6	6	669077	669082	0 %	0 %	100 %	0 %	386348599

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