MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017584	GCC	2	6	630231	630236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
16002	NC_017584	GA	3	6	630264	630269	50 %	0 %	50 %	0 %	386348568
16003	NC_017584	GC	3	6	630329	630334	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
16004	NC_017584	CG	3	6	630361	630366	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
16005	NC_017584	GC	3	6	630450	630455	0 %	0 %	50 %	50 %	386348568
16006	NC_017584	GCC	2	6	630491	630496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
16007	NC_017584	GCC	2	6	630596	630601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
16008	NC_017584	CCG	2	6	630613	630618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
16009	NC_017584	GGC	2	6	630647	630652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348568
16010	NC_017584	AGA	2	6	630673	630678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348568
16011	NC_017584	CGC	2	6	630812	630817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
16012	NC_017584	ACG	2	6	630933	630938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348568
16013	NC_017584	TGG	2	6	630961	630966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348568
16014	NC_017584	G	6	6	630983	630988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017584	C	6	6	631009	631014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16016	NC_017584	CTTG	2	8	631037	631044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_017584	TTCG	2	8	631093	631100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16018	NC_017584	GAC	2	6	631130	631135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
16019	NC_017584	GC	3	6	631187	631192	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
16020	NC_017584	GCC	3	9	631208	631216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
16021	NC_017584	CGA	2	6	631228	631233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
16022	NC_017584	ACC	2	6	631263	631268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348569
16023	NC_017584	CGC	2	6	631307	631312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
16024	NC_017584	GGCG	2	8	631315	631322	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
16025	NC_017584	CCG	2	6	631374	631379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
16026	NC_017584	GGTC	2	8	631395	631402	0 %	25 %	50 %	25 %	386348569
16027	NC_017584	CGGTC	2	10	631405	631414	0 %	20 %	40 %	40 %	386348569
16028	NC_017584	CG	3	6	631437	631442	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
16029	NC_017584	GGT	2	6	631459	631464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348569
16030	NC_017584	CCCG	2	8	631484	631491	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
16031	NC_017584	CGGG	2	8	631609	631616	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
16032	NC_017584	GGC	2	6	631633	631638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348569
16033	NC_017584	GGGC	2	8	631678	631685	0 %	0 %	75 %	25 %	386348569
16034	NC_017584	CGCC	2	8	631702	631709	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
16035	NC_017584	GC	3	6	631711	631716	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
16036	NC_017584	CGA	2	6	631753	631758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348569
16037	NC_017584	GCC	2	6	631825	631830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348569
16038	NC_017584	CGG	2	6	631850	631855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348569
16039	NC_017584	GC	3	6	631861	631866	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
16040	NC_017584	GC	3	6	631879	631884	0 %	0 %	50 %	50 %	386348569
16041	NC_017584	GCCT	2	8	631890	631897	0 %	25 %	25 %	50 %	386348569
16042	NC_017584	GCCA	2	8	631928	631935	25 %	0 %	25 %	50 %	386348569
16043	NC_017584	CCGC	2	8	631947	631954	0 %	0 %	25 %	75 %	386348569
16044	NC_017584	GGT	2	6	632003	632008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348569
16045	NC_017584	AG	4	8	632045	632052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017584	AGA	2	6	632132	632137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_017584	GCG	2	6	632154	632159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_017584	GGA	2	6	632231	632236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_017584	GGC	2	6	632237	632242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_017584	GA	3	6	632296	632301	50 %	0 %	50 %	0 %	386348570
16051	NC_017584	TGCTC	2	10	632330	632339	0 %	40 %	20 %	40 %	386348570
16052	NC_017584	TCA	2	6	632371	632376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348570
16053	NC_017584	GCC	2	6	632393	632398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
16054	NC_017584	GCG	2	6	632413	632418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16055	NC_017584	CAGG	2	8	632449	632456	25 %	0 %	50 %	25 %	386348570
16056	NC_017584	CTG	2	6	632478	632483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16057	NC_017584	CTG	2	6	632520	632525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16058	NC_017584	GAA	2	6	632532	632537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348570
16059	NC_017584	TCG	2	6	632557	632562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16060	NC_017584	CG	3	6	632644	632649	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
16061	NC_017584	CGG	2	6	632652	632657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16062	NC_017584	GAT	2	6	632670	632675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348570
16063	NC_017584	TTC	2	6	632722	632727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348570
16064	NC_017584	CGA	2	6	632755	632760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16065	NC_017584	TCA	3	9	632815	632823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348570
16066	NC_017584	CG	3	6	632838	632843	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
16067	NC_017584	GCT	2	6	632858	632863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16068	NC_017584	GCG	2	6	632905	632910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16069	NC_017584	CGG	2	6	632920	632925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16070	NC_017584	ATG	2	6	632965	632970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348570
16071	NC_017584	GCC	2	6	633030	633035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
16072	NC_017584	CGC	2	6	633044	633049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
16073	NC_017584	GTC	2	6	633057	633062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348570
16074	NC_017584	CG	3	6	633071	633076	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
16075	NC_017584	GAT	2	6	633098	633103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348570
16076	NC_017584	CGG	2	6	633134	633139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16077	NC_017584	CGC	2	6	633170	633175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348570
16078	NC_017584	GC	3	6	633186	633191	0 %	0 %	50 %	50 %	386348570
16079	NC_017584	GAG	2	6	633204	633209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348570
16080	NC_017584	AAGG	2	8	633216	633223	50 %	0 %	50 %	0 %	386348570
16081	NC_017584	TAC	2	6	633234	633239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348570
16082	NC_017584	GTG	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348570
16083	NC_017584	GCG	2	6	633324	633329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348570
16084	NC_017584	TGAT	2	8	633437	633444	25 %	50 %	25 %	0 %	386348571
16085	NC_017584	ACT	2	6	633473	633478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348571
16086	NC_017584	GCT	2	6	633513	633518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348571
16087	NC_017584	GAC	2	6	633615	633620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348571
16088	NC_017584	GAGG	2	8	633678	633685	25 %	0 %	75 %	0 %	386348571
16089	NC_017584	TGA	2	6	633702	633707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348571
16090	NC_017584	GGC	2	6	633759	633764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348571
16091	NC_017584	TCG	2	6	633776	633781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348571
16092	NC_017584	AAG	2	6	633788	633793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348571
16093	NC_017584	GAAA	2	8	633806	633813	75 %	0 %	25 %	0 %	386348571
16094	NC_017584	GATTTT	2	12	633871	633882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386348571
16095	NC_017584	T	7	7	633879	633885	0 %	100 %	0 %	0 %	386348571
16096	NC_017584	C	7	7	633985	633991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16097	NC_017584	TCG	2	6	634027	634032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_017584	TCA	2	6	634122	634127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348572
16099	NC_017584	GAT	2	6	634153	634158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
16100	NC_017584	ATC	2	6	634178	634183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348572
16101	NC_017584	CAG	2	6	634192	634197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16102	NC_017584	CGA	2	6	634248	634253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16103	NC_017584	GGCG	2	8	634401	634408	0 %	0 %	75 %	25 %	386348572
16104	NC_017584	ATC	2	6	634433	634438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348572
16105	NC_017584	ATG	2	6	634439	634444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
16106	NC_017584	CAG	2	6	634519	634524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16107	NC_017584	TGGG	2	8	634562	634569	0 %	25 %	75 %	0 %	386348572
16108	NC_017584	TCG	2	6	634610	634615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16109	NC_017584	AGC	2	6	634616	634621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16110	NC_017584	CAC	2	6	634666	634671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348572
16111	NC_017584	GTG	2	6	634685	634690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348572
16112	NC_017584	ACC	2	6	634709	634714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348572
16113	NC_017584	CGG	2	6	634764	634769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16114	NC_017584	TCG	2	6	634817	634822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16115	NC_017584	CG	3	6	634824	634829	0 %	0 %	50 %	50 %	386348572
16116	NC_017584	CCT	2	6	634881	634886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348572
16117	NC_017584	GGC	2	6	634909	634914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16118	NC_017584	TGT	2	6	634923	634928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348572
16119	NC_017584	CGG	2	6	634942	634947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16120	NC_017584	GGTC	2	8	634998	635005	0 %	25 %	50 %	25 %	386348572
16121	NC_017584	CAG	2	6	635038	635043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16122	NC_017584	CTC	2	6	635098	635103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348572
16123	NC_017584	TCG	2	6	635150	635155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16124	NC_017584	CCA	2	6	635185	635190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348572
16125	NC_017584	AGC	2	6	635216	635221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
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16127	NC_017584	CGG	2	6	635331	635336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16128	NC_017584	GTC	2	6	635339	635344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348572
16129	NC_017584	GCCC	2	8	635346	635353	0 %	0 %	25 %	75 %	386348572
16130	NC_017584	CGG	2	6	635370	635375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16131	NC_017584	GAT	2	6	635383	635388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
16132	NC_017584	GGC	2	6	635446	635451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16133	NC_017584	GAT	2	6	635485	635490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
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16142	NC_017584	TGA	2	6	635739	635744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348572
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16147	NC_017584	GCC	3	9	635843	635851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348572
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16153	NC_017584	AGC	2	6	636032	636037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348572
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16156	NC_017584	GCG	2	6	636127	636132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16157	NC_017584	GCG	2	6	636156	636161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16158	NC_017584	GCG	2	6	636195	636200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348572
16159	NC_017584	CGG	2	6	636251	636256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16160	NC_017584	TCGCC	2	10	636268	636277	0 %	20 %	20 %	60 %	386348573
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16165	NC_017584	CAA	2	6	636506	636511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348573
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16168	NC_017584	CAG	2	6	636692	636697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348573
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16173	NC_017584	GGC	2	6	636853	636858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348573
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16192	NC_017584	CGAG	2	8	637567	637574	25 %	0 %	50 %	25 %	386348573
16193	NC_017584	CGA	2	6	637576	637581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348573
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16216	NC_017584	CGG	2	6	638657	638662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16217	NC_017584	CCG	2	6	638664	638669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16218	NC_017584	TGA	2	6	638689	638694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348575
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16227	NC_017584	GGTT	2	8	639021	639028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16228	NC_017584	GTC	3	9	639042	639050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348576
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16230	NC_017584	CGGCG	2	10	639089	639098	0 %	0 %	60 %	40 %	386348576
16231	NC_017584	G	6	6	639200	639205	0 %	0 %	100 %	0 %	386348576
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16236	NC_017584	ATC	2	6	639455	639460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348576
16237	NC_017584	GGC	2	6	639464	639469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348576
16238	NC_017584	GGC	3	9	639496	639504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348576
16239	NC_017584	AGGGCG	2	12	639516	639527	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386348576
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16482	NC_017584	CAT	2	6	649519	649524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348583
16483	NC_017584	GCC	2	6	649576	649581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348583
16484	NC_017584	CGG	2	6	649596	649601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16485	NC_017584	GCG	2	6	649628	649633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
16486	NC_017584	ACG	2	6	649634	649639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348583
16487	NC_017584	GGC	2	6	649648	649653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348583
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