MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017584	GAA	2	6	611753	611758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_017584	CG	3	6	611771	611776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15503	NC_017584	GCC	2	6	611779	611784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15504	NC_017584	GGT	2	6	611801	611806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348551
15505	NC_017584	GGC	2	6	611815	611820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15506	NC_017584	CCG	2	6	611824	611829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15507	NC_017584	GAT	2	6	611849	611854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348551
15508	NC_017584	CTT	2	6	611873	611878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348551
15509	NC_017584	GCG	3	9	611910	611918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15510	NC_017584	CCG	3	9	611919	611927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15511	NC_017584	GC	3	6	611940	611945	0 %	0 %	50 %	50 %	386348551
15512	NC_017584	GTC	2	6	611957	611962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348551
15513	NC_017584	TGA	2	6	612046	612051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348551
15514	NC_017584	CCG	2	6	612099	612104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15515	NC_017584	CGGT	2	8	612186	612193	0 %	25 %	50 %	25 %	386348551
15516	NC_017584	AGGTC	2	10	612226	612235	20 %	20 %	40 %	20 %	386348551
15517	NC_017584	CG	3	6	612241	612246	0 %	0 %	50 %	50 %	386348551
15518	NC_017584	CAG	2	6	612260	612265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348551
15519	NC_017584	GCC	3	9	612339	612347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15520	NC_017584	CGC	2	6	612373	612378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15521	NC_017584	GCC	2	6	612450	612455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15522	NC_017584	TGG	2	6	612490	612495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348551
15523	NC_017584	CGG	2	6	612579	612584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15524	NC_017584	CGC	2	6	612595	612600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348551
15525	NC_017584	CGG	2	6	612627	612632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15526	NC_017584	CAG	2	6	612671	612676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348551
15527	NC_017584	GCGCA	2	10	612720	612729	20 %	0 %	40 %	40 %	386348551
15528	NC_017584	CGGT	2	8	612738	612745	0 %	25 %	50 %	25 %	386348551
15529	NC_017584	CGG	2	6	612800	612805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15530	NC_017584	GCG	2	6	612843	612848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348551
15531	NC_017584	G	7	7	612860	612866	0 %	0 %	100 %	0 %	386348551
15532	NC_017584	GC	4	8	612899	612906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15533	NC_017584	GCG	2	6	612928	612933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_017584	GGC	2	6	612956	612961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348552
15535	NC_017584	GAC	2	6	612979	612984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348552
15536	NC_017584	GTT	2	6	612999	613004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348552
15537	NC_017584	GCC	2	6	613006	613011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348552
15538	NC_017584	CCG	2	6	613044	613049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348552
15539	NC_017584	GGC	2	6	613077	613082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348552
15540	NC_017584	TCC	2	6	613132	613137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15541	NC_017584	TGG	2	6	613169	613174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_017584	ACT	2	6	613206	613211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_017584	CGCC	2	8	613269	613276	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15544	NC_017584	GCC	2	6	613342	613347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15545	NC_017584	CCGT	2	8	613354	613361	0 %	25 %	25 %	50 %	386348553
15546	NC_017584	GATC	2	8	613442	613449	25 %	25 %	25 %	25 %	386348553
15547	NC_017584	CTG	2	6	613474	613479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15548	NC_017584	GAA	3	9	613480	613488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348553
15549	NC_017584	GCC	2	6	613543	613548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15550	NC_017584	TGC	2	6	613562	613567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15551	NC_017584	GTC	2	6	613592	613597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15552	NC_017584	CTG	2	6	613636	613641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15553	NC_017584	GCC	2	6	613642	613647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15554	NC_017584	GC	3	6	613694	613699	0 %	0 %	50 %	50 %	386348553
15555	NC_017584	TGG	2	6	613730	613735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348553
15556	NC_017584	CCG	2	6	613736	613741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15557	NC_017584	GCC	2	6	613756	613761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15558	NC_017584	GC	3	6	613804	613809	0 %	0 %	50 %	50 %	386348553
15559	NC_017584	GCC	2	6	613813	613818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348553
15560	NC_017584	CCT	2	6	613832	613837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348553
15561	NC_017584	G	7	7	613855	613861	0 %	0 %	100 %	0 %	386348553
15562	NC_017584	ACG	2	6	613862	613867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15563	NC_017584	GGC	2	6	613911	613916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348553
15564	NC_017584	GCT	2	6	613962	613967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348553
15565	NC_017584	G	6	6	614010	614015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_017584	CG	3	6	614194	614199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15567	NC_017584	CGAG	2	8	614222	614229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15568	NC_017584	AGG	2	6	614251	614256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_017584	CGG	3	9	614505	614513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348554
15570	NC_017584	CGA	2	6	614593	614598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348554
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15573	NC_017584	GGCCCC	2	12	614662	614673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
15574	NC_017584	CGC	2	6	614680	614685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
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15579	NC_017584	GCC	2	6	614798	614803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
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15581	NC_017584	GGC	3	9	614821	614829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348554
15582	NC_017584	CGC	2	6	614851	614856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
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15587	NC_017584	TGG	2	6	614965	614970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348554
15588	NC_017584	GAAG	2	8	614980	614987	50 %	0 %	50 %	0 %	386348554
15589	NC_017584	TGA	2	6	615039	615044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348554
15590	NC_017584	CGA	2	6	615103	615108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348554
15591	NC_017584	TCG	2	6	615117	615122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348554
15592	NC_017584	CGC	2	6	615123	615128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
15593	NC_017584	CAC	2	6	615148	615153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348554
15594	NC_017584	TGA	2	6	615171	615176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348554
15595	NC_017584	TCGA	2	8	615239	615246	25 %	25 %	25 %	25 %	386348554
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15599	NC_017584	GCGG	2	8	615382	615389	0 %	0 %	75 %	25 %	386348554
15600	NC_017584	CGG	3	9	615387	615395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348554
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15603	NC_017584	GAT	2	6	615467	615472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348554
15604	NC_017584	CAG	2	6	615560	615565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348554
15605	NC_017584	CCG	2	6	615600	615605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348554
15606	NC_017584	CGG	2	6	615673	615678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348554
15607	NC_017584	TCA	2	6	615723	615728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348554
15608	NC_017584	TCG	2	6	615765	615770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348554
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15612	NC_017584	TCAG	2	8	616011	616018	25 %	25 %	25 %	25 %	386348554
15613	NC_017584	CAT	2	6	616039	616044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348554
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15618	NC_017584	GCT	2	6	616273	616278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348554
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15620	NC_017584	GGT	2	6	616384	616389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348554
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15862	NC_017584	CGC	2	6	625907	625912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348564
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15924	NC_017584	GCT	2	6	627183	627188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348564
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15927	NC_017584	G	6	6	627242	627247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15928	NC_017584	CGCGG	2	10	627248	627257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15929	NC_017584	GCA	2	6	627292	627297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348565
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15970	NC_017584	GCG	2	6	628997	629002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348566
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15974	NC_017584	GGTC	2	8	629278	629285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15975	NC_017584	AT	3	6	629357	629362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15976	NC_017584	CGG	2	6	629388	629393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15977	NC_017584	AGC	2	6	629399	629404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15982	NC_017584	CTG	2	6	629601	629606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348567
15983	NC_017584	CGC	3	9	629634	629642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348567
15984	NC_017584	CGTGGT	2	12	629694	629705	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386348567
15985	NC_017584	GCC	2	6	629770	629775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348567
15986	NC_017584	C	6	6	629774	629779	0 %	0 %	0 %	100 %	386348567
15987	NC_017584	GGT	2	6	629784	629789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348567
15988	NC_017584	GGT	2	6	629796	629801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348567
15989	NC_017584	GC	3	6	629839	629844	0 %	0 %	50 %	50 %	386348567
15990	NC_017584	CGT	2	6	629858	629863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348567
15991	NC_017584	G	6	6	629898	629903	0 %	0 %	100 %	0 %	386348567
15992	NC_017584	GGC	2	6	629994	629999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15993	NC_017584	C	7	7	630003	630009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15994	NC_017584	CGC	2	6	630045	630050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15995	NC_017584	GCG	2	6	630054	630059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15996	NC_017584	CGC	3	9	630071	630079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348568
15997	NC_017584	GCG	2	6	630080	630085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348568
15998	NC_017584	GCGG	2	8	630089	630096	0 %	0 %	75 %	25 %	386348568
15999	NC_017584	GGCG	2	8	630100	630107	0 %	0 %	75 %	25 %	386348568
16000	NC_017584	CCA	2	6	630202	630207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348568

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