MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017584	GC	3	6	547102	547107	0 %	0 %	50 %	50 %	386348498
14002	NC_017584	GCGG	2	8	547134	547141	0 %	0 %	75 %	25 %	386348498
14003	NC_017584	GCG	2	6	547172	547177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348498
14004	NC_017584	GGTC	2	8	547179	547186	0 %	25 %	50 %	25 %	386348498
14005	NC_017584	CCCT	2	8	547387	547394	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14006	NC_017584	TGGA	2	8	547403	547410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_017584	G	6	6	547451	547456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_017584	G	6	6	547461	547466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_017584	CAG	2	6	547505	547510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14010	NC_017584	GCG	2	6	547581	547586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348499
14011	NC_017584	GCC	2	6	547658	547663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348499
14012	NC_017584	CGC	2	6	547669	547674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348499
14013	NC_017584	CCA	2	6	547737	547742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348499
14014	NC_017584	ATTCC	2	10	547776	547785	20 %	40 %	0 %	40 %	386348499
14015	NC_017584	AGG	2	6	547842	547847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348499
14016	NC_017584	ACC	2	6	547853	547858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348499
14017	NC_017584	CGGC	2	8	547954	547961	0 %	0 %	50 %	50 %	386348499
14018	NC_017584	GGT	2	6	547969	547974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348499
14019	NC_017584	ATC	2	6	548099	548104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348499
14020	NC_017584	GCCAAG	2	12	548105	548116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14021	NC_017584	GCG	4	12	548133	548144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348499
14022	NC_017584	GCCA	2	8	548165	548172	25 %	0 %	25 %	50 %	386348499
14023	NC_017584	ACCCTG	2	12	548213	548224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348499
14024	NC_017584	GCAT	2	8	548277	548284	25 %	25 %	25 %	25 %	386348499
14025	NC_017584	CATG	2	8	548308	548315	25 %	25 %	25 %	25 %	386348499
14026	NC_017584	TGG	2	6	548328	548333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348499
14027	NC_017584	CGA	2	6	548350	548355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14028	NC_017584	CCGG	2	8	548364	548371	0 %	0 %	50 %	50 %	386348499
14029	NC_017584	CAA	2	6	548431	548436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348499
14030	NC_017584	TCG	2	6	548460	548465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14031	NC_017584	CGC	2	6	548533	548538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348499
14032	NC_017584	TGG	2	6	548549	548554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348499
14033	NC_017584	CTGC	2	8	548584	548591	0 %	25 %	25 %	50 %	386348499
14034	NC_017584	CGA	2	6	548605	548610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14035	NC_017584	TCA	2	6	548673	548678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348499
14036	NC_017584	GGC	2	6	548707	548712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348499
14037	NC_017584	CGGG	2	8	548754	548761	0 %	0 %	75 %	25 %	386348499
14038	NC_017584	CGG	2	6	548787	548792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348499
14039	NC_017584	GTC	2	6	548828	548833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14040	NC_017584	CGT	2	6	548850	548855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14041	NC_017584	ATG	2	6	548858	548863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348499
14042	NC_017584	GGCG	2	8	548972	548979	0 %	0 %	75 %	25 %	386348499
14043	NC_017584	TGCC	2	8	549002	549009	0 %	25 %	25 %	50 %	386348499
14044	NC_017584	CCG	2	6	549066	549071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348499
14045	NC_017584	TGA	2	6	549076	549081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348499
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14047	NC_017584	GAT	2	6	549160	549165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348499
14048	NC_017584	GC	3	6	549174	549179	0 %	0 %	50 %	50 %	386348499
14049	NC_017584	TGC	2	6	549192	549197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348499
14050	NC_017584	AGG	2	6	549234	549239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348499
14051	NC_017584	GTC	2	6	549281	549286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_017584	C	6	6	549319	549324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14053	NC_017584	CGG	3	9	549338	549346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_017584	CGA	2	6	549539	549544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348500
14055	NC_017584	GAT	2	6	549584	549589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348500
14056	NC_017584	CG	3	6	549673	549678	0 %	0 %	50 %	50 %	386348500
14057	NC_017584	TCGT	2	8	549780	549787	0 %	50 %	25 %	25 %	386348500
14058	NC_017584	TCG	2	6	549796	549801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348500
14059	NC_017584	CG	3	6	549863	549868	0 %	0 %	50 %	50 %	386348500
14060	NC_017584	GCC	2	6	549879	549884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348500
14061	NC_017584	CGG	2	6	549893	549898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348500
14062	NC_017584	GGC	2	6	549988	549993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_017584	TTA	2	6	550046	550051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348501
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14066	NC_017584	TCG	2	6	550222	550227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348501
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14080	NC_017584	CGT	2	6	550936	550941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348501
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14084	NC_017584	ATG	2	6	551007	551012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348501
14085	NC_017584	CGC	2	6	551021	551026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348501
14086	NC_017584	GACAAG	2	12	551040	551051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386348501
14087	NC_017584	TGAT	2	8	551130	551137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_017584	ACCC	2	8	551156	551163	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14089	NC_017584	G	7	7	551183	551189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_017584	GTT	2	6	551224	551229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_017584	GGC	2	6	551250	551255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_017584	TC	3	6	551261	551266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_017584	CG	3	6	551311	551316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14094	NC_017584	GCA	2	6	551320	551325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_017584	CCTC	2	8	551359	551366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14096	NC_017584	CTC	2	6	551374	551379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14097	NC_017584	CGA	2	6	551457	551462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_017584	TGG	2	6	551524	551529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_017584	CGT	2	6	551537	551542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_017584	CGG	2	6	551586	551591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_017584	GGGAA	2	10	551597	551606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_017584	CG	4	8	551641	551648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_017584	A	6	6	551679	551684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_017584	ACG	2	6	551744	551749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_017584	GCGCC	2	10	551758	551767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14106	NC_017584	GCGA	2	8	551813	551820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14107	NC_017584	CAA	2	6	551822	551827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348502
14108	NC_017584	CGG	2	6	551855	551860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348502
14109	NC_017584	CCGT	2	8	551932	551939	0 %	25 %	25 %	50 %	386348502
14110	NC_017584	TGA	2	6	551988	551993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348502
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14112	NC_017584	ATC	2	6	552148	552153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348502
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14117	NC_017584	ACCGA	2	10	552283	552292	40 %	0 %	20 %	40 %	386348502
14118	NC_017584	GTC	2	6	552304	552309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348502
14119	NC_017584	CGG	3	9	552315	552323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348502
14120	NC_017584	CAC	2	6	552324	552329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348502
14121	NC_017584	GGC	2	6	552352	552357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348502
14122	NC_017584	CGG	2	6	552384	552389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348502
14123	NC_017584	ATC	2	6	552409	552414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348502
14124	NC_017584	CTG	2	6	552439	552444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348502
14125	NC_017584	A	6	6	552472	552477	100 %	0 %	0 %	0 %	386348502
14126	NC_017584	TGA	2	6	552545	552550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348502
14127	NC_017584	GCC	2	6	552670	552675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348502
14128	NC_017584	TCG	2	6	552680	552685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348502
14129	NC_017584	CGG	3	9	552705	552713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348502
14130	NC_017584	GC	3	6	552744	552749	0 %	0 %	50 %	50 %	386348502
14131	NC_017584	GAT	2	6	552778	552783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348502
14132	NC_017584	GGGC	2	8	552910	552917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14133	NC_017584	CCG	2	6	552965	552970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14134	NC_017584	AGGG	2	8	553000	553007	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_017584	CG	3	6	553042	553047	0 %	0 %	50 %	50 %	386348503
14136	NC_017584	GGCT	2	8	553101	553108	0 %	25 %	50 %	25 %	386348503
14137	NC_017584	TGC	2	6	553119	553124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348503
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14143	NC_017584	CGG	2	6	553426	553431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348503
14144	NC_017584	CCAT	2	8	553467	553474	25 %	25 %	0 %	50 %	386348503
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14147	NC_017584	GTC	2	6	553546	553551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348503
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14152	NC_017584	GTG	2	6	553820	553825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348503
14153	NC_017584	G	6	6	553896	553901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14154	NC_017584	GC	3	6	553948	553953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14155	NC_017584	GC	3	6	553974	553979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14156	NC_017584	GC	3	6	554000	554005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14157	NC_017584	GC	3	6	554026	554031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14158	NC_017584	CGGCG	2	10	554075	554084	0 %	0 %	60 %	40 %	386348504
14159	NC_017584	TGC	2	6	554181	554186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348504
14160	NC_017584	TGA	2	6	554187	554192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348504
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14164	NC_017584	TGC	2	6	554370	554375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348504
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14167	NC_017584	TGG	2	6	554438	554443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348504
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14179	NC_017584	TCG	2	6	554819	554824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348505
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14196	NC_017584	TGG	3	9	555626	555634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348505
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14200	NC_017584	ATCG	2	8	555820	555827	25 %	25 %	25 %	25 %	386348505
14201	NC_017584	GCC	2	6	555925	555930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348505
14202	NC_017584	CTG	2	6	555964	555969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348505
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14209	NC_017584	GGC	2	6	556227	556232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348505
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14212	NC_017584	CCG	2	6	556323	556328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348505
14213	NC_017584	CGCGC	2	10	556392	556401	0 %	0 %	40 %	60 %	386348505
14214	NC_017584	GGC	3	9	556429	556437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348505
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14216	NC_017584	CG	4	8	556461	556468	0 %	0 %	50 %	50 %	386348505
14217	NC_017584	GC	3	6	556501	556506	0 %	0 %	50 %	50 %	386348505
14218	NC_017584	GCC	2	6	556542	556547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348505
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14220	NC_017584	CGC	2	6	556601	556606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348505
14221	NC_017584	C	7	7	556608	556614	0 %	0 %	0 %	100 %	386348505
14222	NC_017584	GAG	2	6	556654	556659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348505
14223	NC_017584	G	6	6	556671	556676	0 %	0 %	100 %	0 %	386348505
14224	NC_017584	TCGC	2	8	556689	556696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14225	NC_017584	CCCG	2	8	556700	556707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14226	NC_017584	CGA	2	6	556723	556728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348506
14227	NC_017584	GCC	2	6	556745	556750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348506
14228	NC_017584	TGA	2	6	556762	556767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348506
14229	NC_017584	GGC	2	6	556769	556774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348506
14230	NC_017584	CG	4	8	556807	556814	0 %	0 %	50 %	50 %	386348506
14231	NC_017584	GCCA	2	8	556830	556837	25 %	0 %	25 %	50 %	386348506
14232	NC_017584	GAT	2	6	556886	556891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348506
14233	NC_017584	CCG	2	6	556910	556915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348506
14234	NC_017584	GTCCG	2	10	556958	556967	0 %	20 %	40 %	40 %	386348506
14235	NC_017584	GCA	2	6	557029	557034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348506
14236	NC_017584	GTG	2	6	557126	557131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348506
14237	NC_017584	CAC	2	6	557185	557190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348506
14238	NC_017584	ACC	2	6	557202	557207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348506
14239	NC_017584	GAC	2	6	557234	557239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348506
14240	NC_017584	GCC	3	9	557262	557270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348506
14241	NC_017584	ACG	3	9	557271	557279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348506
14242	NC_017584	CCAGGG	2	12	557353	557364	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348506
14243	NC_017584	GCC	2	6	557504	557509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348506
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14322	NC_017584	T	6	6	560649	560654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14323	NC_017584	TAA	2	6	560657	560662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14350	NC_017584	GATC	2	8	561968	561975	25 %	25 %	25 %	25 %	386348510
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14355	NC_017584	TCA	2	6	562141	562146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14356	NC_017584	CGGG	2	8	562183	562190	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14357	NC_017584	CGTT	2	8	562214	562221	0 %	50 %	25 %	25 %	386348511
14358	NC_017584	GCG	2	6	562233	562238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
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14361	NC_017584	CAT	2	6	562375	562380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348511
14362	NC_017584	CGA	2	6	562428	562433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348511
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14365	NC_017584	CGG	2	6	562554	562559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
14366	NC_017584	CGG	2	6	562578	562583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348511
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14488	NC_017584	CGT	2	6	568381	568386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348516
14489	NC_017584	AGC	2	6	568416	568421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348516
14490	NC_017584	GGCC	2	8	568454	568461	0 %	0 %	50 %	50 %	386348516
14491	NC_017584	GC	3	6	568522	568527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14492	NC_017584	TGG	2	6	568583	568588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_017584	A	7	7	568635	568641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_017584	GGCG	2	8	568642	568649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14495	NC_017584	TCG	2	6	568682	568687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14496	NC_017584	CG	3	6	568696	568701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14497	NC_017584	TCGG	2	8	568775	568782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14498	NC_017584	CGC	2	6	568844	568849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14499	NC_017584	GCC	2	6	568850	568855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_017584	GATC	2	8	568895	568902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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