MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017584	GCC	2	6	488424	488429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348439
12502	NC_017584	CGGTG	2	10	488444	488453	0 %	20 %	60 %	20 %	386348439
12503	NC_017584	GTT	2	6	488595	488600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348439
12504	NC_017584	GGCG	2	8	488643	488650	0 %	0 %	75 %	25 %	386348439
12505	NC_017584	CGG	3	9	488666	488674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348439
12506	NC_017584	GCG	2	6	488698	488703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348439
12507	NC_017584	TCC	2	6	488763	488768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_017584	ACC	2	6	488823	488828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_017584	GGC	3	9	488836	488844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017584	GCCG	2	8	488881	488888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_017584	TCG	2	6	488909	488914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348440
12512	NC_017584	TCG	3	9	488921	488929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348440
12513	NC_017584	GGC	2	6	488935	488940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348440
12514	NC_017584	CCT	3	9	488946	488954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348440
12515	NC_017584	GCG	6	18	488999	489016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348440
12516	NC_017584	GCCTCG	2	12	489026	489037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348440
12517	NC_017584	CGA	3	9	489045	489053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348440
12518	NC_017584	GGT	2	6	489123	489128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348440
12519	NC_017584	GAA	2	6	489132	489137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348440
12520	NC_017584	GACGGC	2	12	489268	489279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348440
12521	NC_017584	TTCAGG	2	12	489299	489310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386348440
12522	NC_017584	CTT	2	6	489373	489378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348440
12523	NC_017584	GCA	2	6	489384	489389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348440
12524	NC_017584	CCTTGA	2	12	489411	489422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386348440
12525	NC_017584	CAT	2	6	489475	489480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348440
12526	NC_017584	ATC	2	6	489484	489489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_017584	GCC	2	6	489526	489531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348441
12528	NC_017584	GGCG	2	8	489660	489667	0 %	0 %	75 %	25 %	386348441
12529	NC_017584	TGG	2	6	489720	489725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348441
12530	NC_017584	C	6	6	489752	489757	0 %	0 %	0 %	100 %	386348441
12531	NC_017584	CGC	2	6	489772	489777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348441
12532	NC_017584	CCAG	2	8	489798	489805	25 %	0 %	25 %	50 %	386348441
12533	NC_017584	GGC	2	6	489806	489811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348441
12534	NC_017584	C	7	7	489851	489857	0 %	0 %	0 %	100 %	386348441
12535	NC_017584	CAC	2	6	489869	489874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348441
12536	NC_017584	AGG	2	6	489912	489917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348441
12537	NC_017584	AAGG	2	8	489919	489926	50 %	0 %	50 %	0 %	386348441
12538	NC_017584	AGGT	2	8	489935	489942	25 %	25 %	50 %	0 %	386348441
12539	NC_017584	ACC	2	6	490028	490033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348441
12540	NC_017584	C	6	6	490151	490156	0 %	0 %	0 %	100 %	386348441
12541	NC_017584	GCG	2	6	490160	490165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348441
12542	NC_017584	CCG	2	6	490197	490202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348441
12543	NC_017584	ACC	2	6	490214	490219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348441
12544	NC_017584	GAA	2	6	490230	490235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348441
12545	NC_017584	CGG	2	6	490278	490283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348441
12546	NC_017584	GAA	2	6	490287	490292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348441
12547	NC_017584	GCG	2	6	490329	490334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348441
12548	NC_017584	CAG	2	6	490351	490356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348441
12549	NC_017584	CG	4	8	490555	490562	0 %	0 %	50 %	50 %	386348442
12550	NC_017584	GCT	2	6	490586	490591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348442
12551	NC_017584	CGG	2	6	490604	490609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348442
12552	NC_017584	GCA	3	9	490652	490660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348442
12553	NC_017584	GC	3	6	490688	490693	0 %	0 %	50 %	50 %	386348442
12554	NC_017584	CGA	2	6	490720	490725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348442
12555	NC_017584	GAA	2	6	490728	490733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348442
12556	NC_017584	CGG	2	6	490738	490743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348442
12557	NC_017584	AGC	2	6	490746	490751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348442
12558	NC_017584	CAT	2	6	490752	490757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348442
12559	NC_017584	G	6	6	490792	490797	0 %	0 %	100 %	0 %	386348443
12560	NC_017584	CAC	3	9	490813	490821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348443
12561	NC_017584	CGC	2	6	490885	490890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348443
12562	NC_017584	GCC	2	6	490895	490900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348443
12563	NC_017584	TTC	2	6	490917	490922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348443
12564	NC_017584	CAT	2	6	490925	490930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348443
12565	NC_017584	CTT	2	6	490942	490947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348443
12566	NC_017584	CAGGCG	2	12	490994	491005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348443
12567	NC_017584	CGGC	2	8	491023	491030	0 %	0 %	50 %	50 %	386348443
12568	NC_017584	GAA	2	6	491050	491055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348443
12569	NC_017584	AGG	2	6	491282	491287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017584	CCG	3	9	491405	491413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_017584	GC	3	6	491460	491465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12572	NC_017584	GC	3	6	491469	491474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_017584	GGTCG	2	10	491479	491488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12574	NC_017584	TCC	2	6	491507	491512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_017584	CGG	2	6	491607	491612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12576	NC_017584	AAG	2	6	491628	491633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348444
12577	NC_017584	CGA	2	6	491635	491640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348444
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12579	NC_017584	CGG	2	6	491764	491769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12580	NC_017584	GCC	2	6	491780	491785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12581	NC_017584	GCC	3	9	491834	491842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12582	NC_017584	CCGC	2	8	491865	491872	0 %	0 %	25 %	75 %	386348444
12583	NC_017584	CTG	2	6	491873	491878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348444
12584	NC_017584	GCC	2	6	491933	491938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12585	NC_017584	GCC	2	6	491975	491980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12586	NC_017584	GGC	2	6	491983	491988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12587	NC_017584	GCC	2	6	492008	492013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12588	NC_017584	GGT	2	6	492034	492039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348444
12589	NC_017584	GGCCAA	2	12	492082	492093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348444
12590	NC_017584	GC	3	6	492103	492108	0 %	0 %	50 %	50 %	386348444
12591	NC_017584	GC	3	6	492126	492131	0 %	0 %	50 %	50 %	386348444
12592	NC_017584	CGG	2	6	492156	492161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12593	NC_017584	CGG	2	6	492207	492212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12594	NC_017584	TGG	2	6	492219	492224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348444
12595	NC_017584	CGG	2	6	492240	492245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348444
12596	NC_017584	CCG	2	6	492265	492270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348444
12597	NC_017584	CTG	2	6	492272	492277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348444
12598	NC_017584	GGGC	2	8	492379	492386	0 %	0 %	75 %	25 %	386348444
12599	NC_017584	GCTC	2	8	492416	492423	0 %	25 %	25 %	50 %	386348444
12600	NC_017584	TCA	2	6	492453	492458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348444
12601	NC_017584	G	6	6	492485	492490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017584	CCG	2	6	492497	492502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_017584	TGG	2	6	492621	492626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348445
12604	NC_017584	GGC	2	6	492696	492701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348445
12605	NC_017584	CCG	2	6	492713	492718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348445
12606	NC_017584	CCTGC	2	10	492744	492753	0 %	20 %	20 %	60 %	386348445
12607	NC_017584	CGG	2	6	492791	492796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348445
12608	NC_017584	GCC	2	6	492802	492807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348445
12609	NC_017584	CAA	2	6	492831	492836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348445
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12611	NC_017584	CGG	2	6	492938	492943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348445
12612	NC_017584	ATG	2	6	492952	492957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348445
12613	NC_017584	TCG	2	6	492995	493000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348445
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12615	NC_017584	GGCC	2	8	493044	493051	0 %	0 %	50 %	50 %	386348445
12616	NC_017584	GCC	2	6	493075	493080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348445
12617	NC_017584	GGC	2	6	493086	493091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348445
12618	NC_017584	GC	3	6	493090	493095	0 %	0 %	50 %	50 %	386348445
12619	NC_017584	CCG	2	6	493193	493198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348445
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12621	NC_017584	GCGA	2	8	493246	493253	25 %	0 %	50 %	25 %	386348445
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12986	NC_017584	CCG	2	6	506781	506786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348463
12987	NC_017584	GGC	2	6	506802	506807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348463
12988	NC_017584	AGC	2	6	506855	506860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348463
12989	NC_017584	CGA	2	6	506886	506891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348463
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12991	NC_017584	GTC	2	6	506986	506991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348463
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