MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017584	GCCC	2	8	432646	432653	0 %	0 %	25 %	75 %	386348383
11002	NC_017584	CGC	2	6	432685	432690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348383
11003	NC_017584	GCGG	2	8	432700	432707	0 %	0 %	75 %	25 %	386348383
11004	NC_017584	GGATC	2	10	432722	432731	20 %	20 %	40 %	20 %	386348383
11005	NC_017584	A	6	6	432747	432752	100 %	0 %	0 %	0 %	386348383
11006	NC_017584	GGC	2	6	432802	432807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017584	GGC	2	6	432822	432827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_017584	CGG	2	6	432845	432850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_017584	GGC	3	9	432932	432940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348384
11010	NC_017584	CGG	2	6	432958	432963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348384
11011	NC_017584	ATC	2	6	432984	432989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348384
11012	NC_017584	CGCC	2	8	432998	433005	0 %	0 %	25 %	75 %	386348384
11013	NC_017584	CG	3	6	433027	433032	0 %	0 %	50 %	50 %	386348384
11014	NC_017584	CGC	2	6	433049	433054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348384
11015	NC_017584	ATC	2	6	433067	433072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348384
11016	NC_017584	GCCG	2	8	433214	433221	0 %	0 %	50 %	50 %	386348384
11017	NC_017584	GC	3	6	433266	433271	0 %	0 %	50 %	50 %	386348384
11018	NC_017584	CGG	2	6	433300	433305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348384
11019	NC_017584	GCC	2	6	433326	433331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348384
11020	NC_017584	AGC	2	6	433356	433361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348384
11021	NC_017584	GGCCTC	2	12	433370	433381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348384
11022	NC_017584	CCG	2	6	433468	433473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348384
11023	NC_017584	GGC	2	6	433491	433496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348384
11024	NC_017584	GACG	2	8	433505	433512	25 %	0 %	50 %	25 %	386348384
11025	NC_017584	GGCG	2	8	433579	433586	0 %	0 %	75 %	25 %	386348385
11026	NC_017584	GGGAG	2	10	433587	433596	20 %	0 %	80 %	0 %	386348385
11027	NC_017584	TCG	2	6	433646	433651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348385
11028	NC_017584	GCAG	2	8	433680	433687	25 %	0 %	50 %	25 %	386348385
11029	NC_017584	CCTCGA	2	12	433710	433721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348385
11030	NC_017584	GGC	2	6	433735	433740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348385
11031	NC_017584	GCAG	2	8	433782	433789	25 %	0 %	50 %	25 %	386348385
11032	NC_017584	CGC	2	6	433807	433812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348385
11033	NC_017584	CGG	2	6	433833	433838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348385
11034	NC_017584	GCC	2	6	433876	433881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348385
11035	NC_017584	CCA	2	6	433890	433895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348385
11036	NC_017584	GCC	2	6	433917	433922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348385
11037	NC_017584	GAC	2	6	433963	433968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348385
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11039	NC_017584	CAG	2	6	434119	434124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348385
11040	NC_017584	CCG	2	6	434154	434159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348385
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11042	NC_017584	GTC	2	6	434180	434185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348385
11043	NC_017584	GGC	2	6	434194	434199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348385
11044	NC_017584	CGG	2	6	434255	434260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348386
11045	NC_017584	CGC	3	9	434262	434270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348386
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11047	NC_017584	GCCG	2	8	434289	434296	0 %	0 %	50 %	50 %	386348386
11048	NC_017584	GGGC	2	8	434303	434310	0 %	0 %	75 %	25 %	386348386
11049	NC_017584	CGG	2	6	434339	434344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348386
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11051	NC_017584	CGC	2	6	434360	434365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348386
11052	NC_017584	GGC	2	6	434421	434426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348386
11053	NC_017584	GCG	2	6	434470	434475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348386
11054	NC_017584	CGG	2	6	434501	434506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348386
11055	NC_017584	GCT	2	6	434513	434518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348386
11056	NC_017584	CGT	2	6	434540	434545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348386
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11058	NC_017584	GTG	2	6	434662	434667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348386
11059	NC_017584	CGGT	2	8	434668	434675	0 %	25 %	50 %	25 %	386348386
11060	NC_017584	CGA	2	6	434678	434683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348386
11061	NC_017584	TGC	2	6	434704	434709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348386
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11063	NC_017584	TCG	2	6	434812	434817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348386
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11069	NC_017584	GCC	2	6	435088	435093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348386
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11071	NC_017584	TCG	2	6	435184	435189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348386
11072	NC_017584	GAT	2	6	435345	435350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348386
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11074	NC_017584	GGCC	2	8	435372	435379	0 %	0 %	50 %	50 %	386348386
11075	NC_017584	ATC	2	6	435420	435425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11077	NC_017584	GCG	2	6	435510	435515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348387
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11080	NC_017584	ACC	2	6	435652	435657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348387
11081	NC_017584	CAG	2	6	435691	435696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348387
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11083	NC_017584	CCAG	2	8	435917	435924	25 %	0 %	25 %	50 %	386348387
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11085	NC_017584	CGG	2	6	436064	436069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348387
11086	NC_017584	CGCC	2	8	436091	436098	0 %	0 %	25 %	75 %	386348387
11087	NC_017584	CCG	2	6	436297	436302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348387
11088	NC_017584	CTGG	2	8	436355	436362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11089	NC_017584	GC	3	6	436391	436396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11091	NC_017584	CCA	2	6	436416	436421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_017584	GCG	2	6	436449	436454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_017584	A	6	6	436458	436463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017584	GCC	2	6	436466	436471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_017584	CGG	2	6	436481	436486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11102	NC_017584	GTC	2	6	436719	436724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348388
11103	NC_017584	GCG	3	9	436730	436738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348388
11104	NC_017584	AGT	2	6	436763	436768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348388
11105	NC_017584	CTG	3	9	436815	436823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348388
11106	NC_017584	CGGC	2	8	436838	436845	0 %	0 %	50 %	50 %	386348388
11107	NC_017584	CCG	2	6	436900	436905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348388
11108	NC_017584	GGGC	2	8	436906	436913	0 %	0 %	75 %	25 %	386348388
11109	NC_017584	AGC	2	6	436921	436926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348388
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11111	NC_017584	CCGCC	2	10	436943	436952	0 %	0 %	20 %	80 %	386348388
11112	NC_017584	CGG	3	9	436961	436969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348388
11113	NC_017584	GTC	2	6	437040	437045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348388
11114	NC_017584	CCGG	2	8	437050	437057	0 %	0 %	50 %	50 %	386348388
11115	NC_017584	CGG	2	6	437069	437074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348388
11116	NC_017584	TGC	2	6	437153	437158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348388
11117	NC_017584	GCCGC	2	10	437275	437284	0 %	0 %	40 %	60 %	386348388
11118	NC_017584	CGG	2	6	437303	437308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348388
11119	NC_017584	TC	3	6	437339	437344	0 %	50 %	0 %	50 %	386348388
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11121	NC_017584	GTC	2	6	437376	437381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348389
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11242	NC_017584	TCA	2	6	441814	441819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348394
11243	NC_017584	GCC	2	6	441825	441830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348394
11244	NC_017584	CGC	2	6	441879	441884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348394
11245	NC_017584	CGG	2	6	441909	441914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348394
11246	NC_017584	CCTCGA	2	12	441961	441972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348394
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11248	NC_017584	GAC	2	6	442004	442009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348394
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11250	NC_017584	GCTC	2	8	442150	442157	0 %	25 %	25 %	50 %	386348394
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11255	NC_017584	G	7	7	442286	442292	0 %	0 %	100 %	0 %	386348394
11256	NC_017584	GCC	2	6	442316	442321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348394
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11263	NC_017584	CCGC	2	8	442638	442645	0 %	0 %	25 %	75 %	386348395
11264	NC_017584	CGC	2	6	442695	442700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348395
11265	NC_017584	GAT	2	6	442728	442733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348395
11266	NC_017584	CCTCGA	2	12	442836	442847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348395
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11268	NC_017584	CGC	2	6	442998	443003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348395
11269	NC_017584	GCCG	2	8	443044	443051	0 %	0 %	50 %	50 %	386348395
11270	NC_017584	GTG	2	6	443087	443092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348395
11271	NC_017584	CCG	2	6	443177	443182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11272	NC_017584	AGG	2	6	443234	443239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348396
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11274	NC_017584	CCG	2	6	443246	443251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348396
11275	NC_017584	AGG	2	6	443273	443278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348396
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11278	NC_017584	CGG	2	6	443471	443476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348396
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11280	NC_017584	AATC	2	8	443538	443545	50 %	25 %	0 %	25 %	386348396
11281	NC_017584	C	6	6	443552	443557	0 %	0 %	0 %	100 %	386348396
11282	NC_017584	CTG	2	6	443572	443577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348396
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11304	NC_017584	GCCGG	2	10	444324	444333	0 %	0 %	60 %	40 %	386348397
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11313	NC_017584	GGC	2	6	444576	444581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348397
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11315	NC_017584	CGGC	2	8	444627	444634	0 %	0 %	50 %	50 %	386348397
11316	NC_017584	GCG	3	9	444669	444677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348397
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11321	NC_017584	TCT	2	6	444824	444829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348397
11322	NC_017584	GCT	2	6	444908	444913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348397
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11343	NC_017584	CGG	2	6	445506	445511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348398
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11349	NC_017584	ACCG	2	8	445607	445614	25 %	0 %	25 %	50 %	386348398
11350	NC_017584	CGC	3	9	445618	445626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348398
11351	NC_017584	ACG	2	6	445680	445685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348398
11352	NC_017584	C	8	8	445701	445708	0 %	0 %	0 %	100 %	386348398
11353	NC_017584	GCC	2	6	445723	445728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348398
11354	NC_017584	CCG	2	6	445800	445805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348398
11355	NC_017584	C	6	6	445827	445832	0 %	0 %	0 %	100 %	386348398
11356	NC_017584	CCG	2	6	445844	445849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348398
11357	NC_017584	CCCTGA	2	12	445872	445883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348398
11358	NC_017584	G	7	7	445893	445899	0 %	0 %	100 %	0 %	386348398
11359	NC_017584	CGGCC	2	10	445909	445918	0 %	0 %	40 %	60 %	386348398
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11483	NC_017584	GGA	2	6	449822	449827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348399
11484	NC_017584	GC	3	6	449894	449899	0 %	0 %	50 %	50 %	386348399
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11491	NC_017584	ACC	2	6	450138	450143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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