MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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109002	NC_017584	CCTCAA	2	12	4266553	4266564	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386351810
109003	NC_017584	CGG	2	6	4266579	4266584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351810
109004	NC_017584	GCG	2	6	4266585	4266590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351810
109005	NC_017584	CGC	2	6	4266617	4266622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351810
109006	NC_017584	TAC	2	6	4266623	4266628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386351810
109007	NC_017584	CGG	2	6	4266659	4266664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109008	NC_017584	CCG	2	6	4266683	4266688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351811
109009	NC_017584	GTT	2	6	4266693	4266698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386351811
109010	NC_017584	CGG	2	6	4266734	4266739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109011	NC_017584	GC	3	6	4266751	4266756	0 %	0 %	50 %	50 %	386351811
109012	NC_017584	TGA	2	6	4266855	4266860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386351811
109013	NC_017584	TGC	2	6	4266872	4266877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109014	NC_017584	CCG	2	6	4266902	4266907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351811
109015	NC_017584	GGT	2	6	4266909	4266914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386351811
109016	NC_017584	GAC	2	6	4266942	4266947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109017	NC_017584	GGC	2	6	4266963	4266968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109018	NC_017584	TGC	2	6	4266977	4266982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109019	NC_017584	GGC	2	6	4267014	4267019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109020	NC_017584	CAT	2	6	4267089	4267094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386351811
109021	NC_017584	CGG	2	6	4267113	4267118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109022	NC_017584	CGA	2	6	4267125	4267130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109023	NC_017584	GCT	2	6	4267134	4267139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109024	NC_017584	CAA	2	6	4267173	4267178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386351811
109025	NC_017584	TGC	2	6	4267184	4267189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109026	NC_017584	GGC	2	6	4267219	4267224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351811
109027	NC_017584	CCG	2	6	4267238	4267243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351811
109028	NC_017584	GAC	2	6	4267373	4267378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386351811
109029	NC_017584	GCC	2	6	4267403	4267408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109030	NC_017584	GGC	4	12	4267457	4267468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351812
109031	NC_017584	GCC	2	6	4267473	4267478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
109032	NC_017584	GCC	2	6	4267491	4267496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
109033	NC_017584	GTC	2	6	4267530	4267535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351812
109034	NC_017584	GGC	2	6	4267613	4267618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351812
109035	NC_017584	GGC	2	6	4267635	4267640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351812
109036	NC_017584	TGT	2	6	4267681	4267686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386351812
109037	NC_017584	TCA	2	6	4267696	4267701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386351812
109038	NC_017584	CCG	2	6	4267702	4267707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
109039	NC_017584	TGG	2	6	4267717	4267722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386351812
109040	NC_017584	CGG	2	6	4267727	4267732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351812
109041	NC_017584	CCG	2	6	4267735	4267740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
109042	NC_017584	GC	3	6	4267757	4267762	0 %	0 %	50 %	50 %	386351812
109043	NC_017584	CCGC	2	8	4267793	4267800	0 %	0 %	25 %	75 %	386351812
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109045	NC_017584	CGC	2	6	4267853	4267858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
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109047	NC_017584	TCT	2	6	4267876	4267881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386351812
109048	NC_017584	CGG	2	6	4267964	4267969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351812
109049	NC_017584	TTG	2	6	4267974	4267979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386351812
109050	NC_017584	GGTCA	2	10	4267989	4267998	20 %	20 %	40 %	20 %	386351812
109051	NC_017584	GC	4	8	4268000	4268007	0 %	0 %	50 %	50 %	386351812
109052	NC_017584	CG	3	6	4268062	4268067	0 %	0 %	50 %	50 %	386351812
109053	NC_017584	CCG	2	6	4268075	4268080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386351812
109054	NC_017584	TCG	2	6	4268086	4268091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351812
109055	NC_017584	GCG	2	6	4268157	4268162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351813
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109057	NC_017584	GGCG	2	8	4268188	4268195	0 %	0 %	75 %	25 %	386351813
109058	NC_017584	CTG	2	6	4268417	4268422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351813
109059	NC_017584	GAT	2	6	4268518	4268523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386351813
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109061	NC_017584	CGT	2	6	4268539	4268544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351813
109062	NC_017584	CGA	2	6	4268556	4268561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386351813
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109064	NC_017584	GC	3	6	4268641	4268646	0 %	0 %	50 %	50 %	386351813
109065	NC_017584	TCTTGG	2	12	4268653	4268664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386351813
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109067	NC_017584	TTA	2	6	4268810	4268815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386351813
109068	NC_017584	TTTC	2	8	4268834	4268841	0 %	75 %	0 %	25 %	386351813
109069	NC_017584	CTGGAT	2	12	4268854	4268865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386351813
109070	NC_017584	ACG	2	6	4268918	4268923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386351813
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109072	NC_017584	GTC	3	9	4268939	4268947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351813
109073	NC_017584	TGC	2	6	4268958	4268963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351813
109074	NC_017584	G	8	8	4269025	4269032	0 %	0 %	100 %	0 %	386351813
109075	NC_017584	TGC	2	6	4269039	4269044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351813
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109081	NC_017584	TCGCC	2	10	4269150	4269159	0 %	20 %	20 %	60 %	386351813
109082	NC_017584	TTGGC	2	10	4269259	4269268	0 %	40 %	40 %	20 %	386351813
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109086	NC_017584	GGC	2	6	4269518	4269523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351813
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109094	NC_017584	GACGC	2	10	4269903	4269912	20 %	0 %	40 %	40 %	386351814
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109104	NC_017584	C	8	8	4270438	4270445	0 %	0 %	0 %	100 %	386351815
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109108	NC_017584	GGCGCC	2	12	4270501	4270512	0 %	0 %	50 %	50 %	386351815
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109114	NC_017584	CGG	2	6	4270705	4270710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386351815
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109119	NC_017584	TCG	2	6	4270766	4270771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351815
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109229	NC_017584	GAT	2	6	4274745	4274750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386351818
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109232	NC_017584	TGC	2	6	4274882	4274887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386351818
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