MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017584	ACA	2	6	19882	19887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348039
502	NC_017584	CCG	2	6	19909	19914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
503	NC_017584	GCC	2	6	19918	19923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
504	NC_017584	GAA	2	6	19926	19931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348039
505	NC_017584	TCA	2	6	20071	20076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348039
506	NC_017584	CAT	2	6	20147	20152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348039
507	NC_017584	CGG	3	9	20153	20161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
508	NC_017584	CGG	2	6	20164	20169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
509	NC_017584	AGC	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348039
510	NC_017584	GC	3	6	20192	20197	0 %	0 %	50 %	50 %	386348039
511	NC_017584	CGG	2	6	20240	20245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
512	NC_017584	CTG	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348039
513	NC_017584	CGT	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348039
514	NC_017584	CTG	2	6	20310	20315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348039
515	NC_017584	GC	3	6	20316	20321	0 %	0 %	50 %	50 %	386348039
516	NC_017584	CCT	2	6	20365	20370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348039
517	NC_017584	ACG	2	6	20392	20397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348039
518	NC_017584	GC	3	6	20427	20432	0 %	0 %	50 %	50 %	386348039
519	NC_017584	GCG	2	6	20461	20466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
520	NC_017584	GGT	3	9	20567	20575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348039
521	NC_017584	CGG	3	9	20579	20587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
522	NC_017584	GC	4	8	20629	20636	0 %	0 %	50 %	50 %	386348039
523	NC_017584	CGC	2	6	20655	20660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
524	NC_017584	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	386348039
525	NC_017584	GCAT	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	386348039
526	NC_017584	GCC	2	6	20821	20826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
527	NC_017584	GATC	2	8	20966	20973	25 %	25 %	25 %	25 %	386348039
528	NC_017584	CGC	2	6	21008	21013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
529	NC_017584	GCG	2	6	21028	21033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348039
530	NC_017584	TGG	2	6	21040	21045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348039
531	NC_017584	CGC	2	6	21071	21076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
532	NC_017584	CCG	2	6	21086	21091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
533	NC_017584	GCC	3	9	21108	21116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
534	NC_017584	GCC	2	6	21129	21134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348039
535	NC_017584	C	6	6	21133	21138	0 %	0 %	0 %	100 %	386348039
536	NC_017584	GA	3	6	21151	21156	50 %	0 %	50 %	0 %	386348039
537	NC_017584	CCG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017584	TCG	2	6	21231	21236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
539	NC_017584	CGC	2	6	21253	21258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
540	NC_017584	GCC	2	6	21269	21274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
541	NC_017584	CGG	2	6	21347	21352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
542	NC_017584	GGT	2	6	21355	21360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
543	NC_017584	TTC	2	6	21467	21472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348040
544	NC_017584	CCG	2	6	21484	21489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
545	NC_017584	CAC	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
546	NC_017584	CG	3	6	21504	21509	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
547	NC_017584	CCGG	2	8	21510	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
548	NC_017584	AGG	2	6	21564	21569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348040
549	NC_017584	TGGC	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
550	NC_017584	GCG	2	6	21720	21725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
551	NC_017584	CCG	2	6	21760	21765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
552	NC_017584	ATC	2	6	21836	21841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348040
553	NC_017584	CGA	2	6	21895	21900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
554	NC_017584	ACC	2	6	21927	21932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
555	NC_017584	TTC	2	6	22070	22075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348040
556	NC_017584	GGT	2	6	22102	22107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
557	NC_017584	CGG	2	6	22114	22119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
558	NC_017584	GCC	2	6	22130	22135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
559	NC_017584	GCT	2	6	22153	22158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
560	NC_017584	GCCGG	2	10	22161	22170	0 %	0 %	60 %	40 %	386348040
561	NC_017584	CCGG	3	12	22167	22178	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
562	NC_017584	CAC	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
563	NC_017584	CGG	2	6	22296	22301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
564	NC_017584	CGC	2	6	22306	22311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
565	NC_017584	GGT	2	6	22327	22332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
566	NC_017584	TCACCA	2	12	22371	22382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386348040
567	NC_017584	CTG	2	6	22391	22396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
568	NC_017584	TCG	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
569	NC_017584	CGG	2	6	22468	22473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
570	NC_017584	GGC	2	6	22500	22505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
571	NC_017584	CGC	2	6	22537	22542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
572	NC_017584	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	386348040
573	NC_017584	GTC	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
574	NC_017584	GGA	2	6	22675	22680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348040
575	NC_017584	GAC	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
576	NC_017584	GTC	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
577	NC_017584	CAC	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
578	NC_017584	TTC	2	6	22793	22798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348040
579	NC_017584	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
580	NC_017584	CCG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
581	NC_017584	TGA	2	6	22857	22862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
582	NC_017584	CGA	2	6	22900	22905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
583	NC_017584	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
584	NC_017584	ACC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
585	NC_017584	GCA	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
586	NC_017584	GAG	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348040
587	NC_017584	GCG	2	6	23094	23099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
588	NC_017584	GAT	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
589	NC_017584	GCC	2	6	23168	23173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
590	NC_017584	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	386348040
591	NC_017584	CCA	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
592	NC_017584	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
593	NC_017584	CGA	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
594	NC_017584	GGC	2	6	23374	23379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
595	NC_017584	AAG	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348040
596	NC_017584	CGG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
597	NC_017584	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
598	NC_017584	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
599	NC_017584	AGA	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348040
600	NC_017584	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	386348040
601	NC_017584	GTG	2	6	23615	23620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
602	NC_017584	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
603	NC_017584	GCG	2	6	23658	23663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
604	NC_017584	GCA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
605	NC_017584	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
606	NC_017584	CCG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
607	NC_017584	GCC	2	6	23767	23772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
608	NC_017584	CAC	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
609	NC_017584	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
610	NC_017584	CCG	3	9	23854	23862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
611	NC_017584	GCG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
612	NC_017584	GCG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
613	NC_017584	CGC	2	6	23995	24000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
614	NC_017584	CCG	2	6	24060	24065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
615	NC_017584	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	386348040
616	NC_017584	GAT	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
617	NC_017584	CCG	2	6	24209	24214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
618	NC_017584	CAC	2	6	24218	24223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
619	NC_017584	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
620	NC_017584	CG	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
621	NC_017584	CGC	2	6	24334	24339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
622	NC_017584	TGATCT	2	12	24366	24377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386348040
623	NC_017584	GGC	2	6	24389	24394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
624	NC_017584	CGG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
625	NC_017584	GTG	2	6	24542	24547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
626	NC_017584	CGC	2	6	24550	24555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
627	NC_017584	CAC	2	6	24586	24591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
628	NC_017584	TGG	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
629	NC_017584	CAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348040
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632	NC_017584	CCG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
633	NC_017584	GGT	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
634	NC_017584	GCTC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
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649	NC_017584	CCT	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
650	NC_017584	CGT	2	6	25809	25814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_017584	GC	3	6	25898	25903	0 %	0 %	50 %	50 %	386348041
653	NC_017584	CAG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348041
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662	NC_017584	GC	3	6	26499	26504	0 %	0 %	50 %	50 %	386348042
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692	NC_017584	GGA	2	6	27923	27928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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704	NC_017584	GCC	2	6	28347	28352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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730	NC_017584	GGC	2	6	29380	29385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348045
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752	NC_017584	GAG	2	6	30157	30162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348046
753	NC_017584	GCC	2	6	30184	30189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348046
754	NC_017584	GC	3	6	30216	30221	0 %	0 %	50 %	50 %	386348046
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756	NC_017584	C	8	8	30316	30323	0 %	0 %	0 %	100 %	386348047
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