MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017584	TTC	2	6	293904	293909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348258
7502	NC_017584	CG	4	8	293979	293986	0 %	0 %	50 %	50 %	386348258
7503	NC_017584	GCC	2	6	294005	294010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7504	NC_017584	ATGG	2	8	294092	294099	25 %	25 %	50 %	0 %	386348259
7505	NC_017584	GCT	2	6	294157	294162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348259
7506	NC_017584	AGG	2	6	294180	294185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348259
7507	NC_017584	CCA	2	6	294219	294224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348259
7508	NC_017584	GCC	3	9	294230	294238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348259
7509	NC_017584	CGG	3	9	294344	294352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348260
7510	NC_017584	CCGC	2	8	294408	294415	0 %	0 %	25 %	75 %	386348260
7511	NC_017584	CGT	2	6	294431	294436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348260
7512	NC_017584	CGA	2	6	294473	294478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348260
7513	NC_017584	GCC	2	6	294508	294513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348260
7514	NC_017584	CGCGC	2	10	294527	294536	0 %	0 %	40 %	60 %	386348260
7515	NC_017584	CGT	2	6	294551	294556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348260
7516	NC_017584	GAGG	2	8	294562	294569	25 %	0 %	75 %	0 %	386348260
7517	NC_017584	GGT	2	6	294570	294575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_017584	C	7	7	294608	294614	0 %	0 %	0 %	100 %	386348261
7519	NC_017584	CGA	2	6	294641	294646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348261
7520	NC_017584	ATC	2	6	294702	294707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348261
7521	NC_017584	TGC	2	6	294739	294744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348261
7522	NC_017584	CG	3	6	294766	294771	0 %	0 %	50 %	50 %	386348261
7523	NC_017584	CCG	2	6	294790	294795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348261
7524	NC_017584	ACC	2	6	294816	294821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348261
7525	NC_017584	GCG	2	6	294831	294836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348261
7526	NC_017584	CG	3	6	294835	294840	0 %	0 %	50 %	50 %	386348261
7527	NC_017584	GGA	2	6	294848	294853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348261
7528	NC_017584	GCT	2	6	294881	294886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348261
7529	NC_017584	TCAG	2	8	294910	294917	25 %	25 %	25 %	25 %	386348261
7530	NC_017584	CCA	2	6	294937	294942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348261
7531	NC_017584	GTG	2	6	295069	295074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348261
7532	NC_017584	CGA	3	9	295159	295167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_017584	TCA	2	6	295244	295249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348262
7534	NC_017584	TGAT	2	8	295264	295271	25 %	50 %	25 %	0 %	386348262
7535	NC_017584	CCGG	2	8	295287	295294	0 %	0 %	50 %	50 %	386348262
7536	NC_017584	CGAT	2	8	295351	295358	25 %	25 %	25 %	25 %	386348262
7537	NC_017584	GGT	2	6	295371	295376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348262
7538	NC_017584	GTC	2	6	295395	295400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348262
7539	NC_017584	GAA	2	6	295428	295433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348262
7540	NC_017584	TTC	2	6	295437	295442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348262
7541	NC_017584	GCC	2	6	295485	295490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348262
7542	NC_017584	GTC	2	6	295554	295559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348262
7543	NC_017584	TGA	3	9	295565	295573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348262
7544	NC_017584	ACG	2	6	295597	295602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348262
7545	NC_017584	CGC	2	6	295634	295639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348262
7546	NC_017584	CGG	2	6	295703	295708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7547	NC_017584	GCC	2	6	295774	295779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348262
7548	NC_017584	CGG	2	6	295832	295837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7549	NC_017584	CCCT	2	8	295852	295859	0 %	25 %	0 %	75 %	386348262
7550	NC_017584	TCT	2	6	295924	295929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348262
7551	NC_017584	CTG	2	6	295938	295943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348262
7552	NC_017584	CGG	2	6	295949	295954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7553	NC_017584	GCC	2	6	296026	296031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348262
7554	NC_017584	GGC	2	6	296175	296180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7555	NC_017584	GCC	2	6	296204	296209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348262
7556	NC_017584	CCA	2	6	296223	296228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348262
7557	NC_017584	GGC	2	6	296247	296252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7558	NC_017584	GGC	2	6	296313	296318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348262
7559	NC_017584	CCT	2	6	296495	296500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348262
7560	NC_017584	GCG	2	6	296610	296615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_017584	CAA	2	6	296630	296635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_017584	TGATCC	2	12	296643	296654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_017584	TGT	2	6	296718	296723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_017584	GCC	2	6	296769	296774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7565	NC_017584	ATC	2	6	296778	296783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_017584	ATC	2	6	296814	296819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_017584	GTTT	2	8	296898	296905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_017584	GGCTT	2	10	296921	296930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7569	NC_017584	ATT	2	6	296947	296952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_017584	CGC	2	6	296967	296972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_017584	TAGA	2	8	297056	297063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_017584	TTC	2	6	297066	297071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_017584	AGCC	2	8	297128	297135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7574	NC_017584	TTTC	2	8	297143	297150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7575	NC_017584	AT	3	6	297175	297180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_017584	CAA	2	6	297212	297217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7577	NC_017584	CCA	2	6	297244	297249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7578	NC_017584	TCG	2	6	297257	297262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_017584	GA	3	6	297269	297274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_017584	TCG	2	6	297331	297336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348263
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7583	NC_017584	TGCAC	2	10	297572	297581	20 %	20 %	20 %	40 %	386348263
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7602	NC_017584	CGGTGG	2	12	298504	298515	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386348264
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7609	NC_017584	GTG	2	6	298860	298865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348264
7610	NC_017584	CCAA	2	8	298875	298882	50 %	0 %	0 %	50 %	386348264
7611	NC_017584	GGA	2	6	299043	299048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348264
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7623	NC_017584	C	6	6	299574	299579	0 %	0 %	0 %	100 %	386348264
7624	NC_017584	GATGTG	2	12	299619	299630	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386348264
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7653	NC_017584	TGC	2	6	300825	300830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348264
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7993	NC_017584	AGC	2	6	313662	313667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348274
7994	NC_017584	GGTCC	2	10	313673	313682	0 %	20 %	40 %	40 %	386348274
7995	NC_017584	CGA	2	6	313774	313779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348274
7996	NC_017584	GCC	2	6	313790	313795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348274
7997	NC_017584	GATC	2	8	313807	313814	25 %	25 %	25 %	25 %	386348274
7998	NC_017584	TGC	2	6	313834	313839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348274
7999	NC_017584	GAA	2	6	313850	313855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348274
8000	NC_017584	CGC	2	6	313883	313888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348274

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