MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017584	GCC	2	6	257397	257402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348226
6502	NC_017584	GC	3	6	257421	257426	0 %	0 %	50 %	50 %	386348226
6503	NC_017584	CAC	2	6	257468	257473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348226
6504	NC_017584	GGC	2	6	257487	257492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
6505	NC_017584	GGC	2	6	257513	257518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
6506	NC_017584	ATC	2	6	257562	257567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348226
6507	NC_017584	GGC	2	6	257590	257595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
6508	NC_017584	CCG	2	6	257600	257605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348226
6509	NC_017584	AAGG	2	8	257625	257632	50 %	0 %	50 %	0 %	386348226
6510	NC_017584	CGGC	2	8	257690	257697	0 %	0 %	50 %	50 %	386348226
6511	NC_017584	CGA	2	6	257744	257749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348226
6512	NC_017584	TCGC	2	8	257822	257829	0 %	25 %	25 %	50 %	386348226
6513	NC_017584	CATCGG	2	12	257846	257857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386348226
6514	NC_017584	TAT	2	6	257874	257879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348226
6515	NC_017584	GCGG	2	8	257882	257889	0 %	0 %	75 %	25 %	386348226
6516	NC_017584	GGC	2	6	257916	257921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
6517	NC_017584	ATG	2	6	257925	257930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348226
6518	NC_017584	CCG	2	6	257972	257977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348226
6519	NC_017584	T	8	8	258012	258019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017584	GCG	2	6	258095	258100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6521	NC_017584	CGGG	2	8	258117	258124	0 %	0 %	75 %	25 %	386348227
6522	NC_017584	CGA	3	9	258147	258155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6523	NC_017584	GCG	2	6	258186	258191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6524	NC_017584	CGC	2	6	258285	258290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6525	NC_017584	TTA	2	6	258295	258300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348227
6526	NC_017584	GGT	2	6	258324	258329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6527	NC_017584	CGGC	2	8	258358	258365	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6528	NC_017584	GGC	2	6	258369	258374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6529	NC_017584	CGC	2	6	258417	258422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6530	NC_017584	GAG	2	6	258436	258441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348227
6531	NC_017584	CCG	2	6	258463	258468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6532	NC_017584	GGC	2	6	258514	258519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6533	NC_017584	CGGGG	2	10	258553	258562	0 %	0 %	80 %	20 %	386348227
6534	NC_017584	G	6	6	258559	258564	0 %	0 %	100 %	0 %	386348227
6535	NC_017584	GCCC	2	8	258679	258686	0 %	0 %	25 %	75 %	386348227
6536	NC_017584	GGC	2	6	258729	258734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6537	NC_017584	GC	3	6	258738	258743	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6538	NC_017584	GGC	2	6	258751	258756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6539	NC_017584	CTG	2	6	258763	258768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6540	NC_017584	GTT	2	6	258792	258797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348227
6541	NC_017584	TGG	2	6	258806	258811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6542	NC_017584	GGC	2	6	258832	258837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6543	NC_017584	GCGCG	2	10	258863	258872	0 %	0 %	60 %	40 %	386348227
6544	NC_017584	GAC	2	6	259072	259077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6545	NC_017584	CCCCCG	2	12	259082	259093	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386348227
6546	NC_017584	CGGAGG	2	12	259118	259129	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386348227
6547	NC_017584	GC	3	6	259140	259145	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6548	NC_017584	GCC	2	6	259158	259163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6549	NC_017584	GACCG	2	10	259191	259200	20 %	0 %	40 %	40 %	386348227
6550	NC_017584	CG	3	6	259230	259235	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6551	NC_017584	GC	3	6	259244	259249	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6552	NC_017584	CCG	2	6	259258	259263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6553	NC_017584	GCC	2	6	259286	259291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6554	NC_017584	CGG	3	9	259307	259315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6555	NC_017584	TGC	2	6	259322	259327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6556	NC_017584	CGAT	2	8	259334	259341	25 %	25 %	25 %	25 %	386348227
6557	NC_017584	C	6	6	259361	259366	0 %	0 %	0 %	100 %	386348227
6558	NC_017584	TCC	2	6	259373	259378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348227
6559	NC_017584	GC	3	6	259392	259397	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6560	NC_017584	GCG	2	6	259412	259417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6561	NC_017584	ACC	2	6	259435	259440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348227
6562	NC_017584	TGG	2	6	259448	259453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6563	NC_017584	CCG	2	6	259490	259495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6564	NC_017584	CGC	2	6	259560	259565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6565	NC_017584	GGC	2	6	259645	259650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6566	NC_017584	CGCCC	2	10	259671	259680	0 %	0 %	20 %	80 %	386348227
6567	NC_017584	GAACGC	2	12	259699	259710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348227
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6569	NC_017584	GTC	2	6	259798	259803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6570	NC_017584	TGG	2	6	259819	259824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6571	NC_017584	GGT	2	6	259825	259830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6572	NC_017584	CGG	2	6	259863	259868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6573	NC_017584	GTCG	2	8	259875	259882	0 %	25 %	50 %	25 %	386348227
6574	NC_017584	CTG	2	6	259918	259923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
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6580	NC_017584	GC	3	6	260085	260090	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6581	NC_017584	CGT	2	6	260166	260171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6582	NC_017584	GC	3	6	260191	260196	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6583	NC_017584	CGCC	2	8	260202	260209	0 %	0 %	25 %	75 %	386348227
6584	NC_017584	CGT	2	6	260217	260222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
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6586	NC_017584	GGTCG	2	10	260259	260268	0 %	20 %	60 %	20 %	386348227
6587	NC_017584	GGC	2	6	260329	260334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
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6589	NC_017584	GGC	2	6	260408	260413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6590	NC_017584	TCG	2	6	260432	260437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6591	NC_017584	GGC	2	6	260462	260467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6592	NC_017584	GGC	2	6	260472	260477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6593	NC_017584	TGG	2	6	260501	260506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
6594	NC_017584	GCGG	2	8	260523	260530	0 %	0 %	75 %	25 %	386348227
6595	NC_017584	GTC	2	6	260563	260568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
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6601	NC_017584	GCT	2	6	260787	260792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6602	NC_017584	CCG	2	6	260811	260816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
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6604	NC_017584	CGC	3	9	260857	260865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6605	NC_017584	GGTGCG	2	12	260874	260885	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386348227
6606	NC_017584	GAT	2	6	260946	260951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348227
6607	NC_017584	CCGT	2	8	260996	261003	0 %	25 %	25 %	50 %	386348227
6608	NC_017584	GCC	2	6	261007	261012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6609	NC_017584	GC	3	6	261052	261057	0 %	0 %	50 %	50 %	386348227
6610	NC_017584	GCC	2	6	261076	261081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
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6613	NC_017584	CCG	2	6	261142	261147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
6614	NC_017584	CGAC	2	8	261162	261169	25 %	0 %	25 %	50 %	386348227
6615	NC_017584	TGC	2	6	261179	261184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348227
6616	NC_017584	CGA	2	6	261195	261200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348227
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6618	NC_017584	GAG	2	6	261253	261258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348227
6619	NC_017584	GCC	3	9	261265	261273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348227
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6621	NC_017584	CGG	2	6	261378	261383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348227
6622	NC_017584	CCTGAC	2	12	261390	261401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348227
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6863	NC_017584	CGG	2	6	270371	270376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348238
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6990	NC_017584	TCAT	3	12	275560	275571	25 %	50 %	0 %	25 %	386348243
6991	NC_017584	GCC	2	6	275572	275577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6992	NC_017584	TCG	2	6	275624	275629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6993	NC_017584	CCG	2	6	275688	275693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6994	NC_017584	GC	3	6	275706	275711	0 %	0 %	50 %	50 %	386348243
6995	NC_017584	CCA	2	6	275729	275734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348243
6996	NC_017584	CCG	2	6	275738	275743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6997	NC_017584	CGA	2	6	275751	275756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6998	NC_017584	CGG	3	9	275768	275776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348243
6999	NC_017584	AAG	2	6	275899	275904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348243
7000	NC_017584	CTG	2	6	275947	275952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243

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