MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 chromosome

Total Repeats: 93427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017574	GCATC	2	10	123	132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017574	CCA	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017574	CAA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017574	GCC	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017574	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017574	GAC	2	6	338	343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017574	TAACGA	2	12	367	378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386331672
8	NC_017574	GCG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331672
9	NC_017574	GAGC	2	8	416	423	25 %	0 %	50 %	25 %	386331672
10	NC_017574	CAA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331672
11	NC_017574	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
12	NC_017574	TGC	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331672
13	NC_017574	TCGC	2	8	564	571	0 %	25 %	25 %	50 %	386331672
14	NC_017574	CCG	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
15	NC_017574	GCC	2	6	639	644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
16	NC_017574	GCCGAT	2	12	662	673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386331672
17	NC_017574	CGCA	2	8	709	716	25 %	0 %	25 %	50 %	386331672
18	NC_017574	CGG	2	6	733	738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331672
19	NC_017574	CCG	2	6	754	759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
20	NC_017574	GGCCGC	2	12	761	772	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
21	NC_017574	CGG	2	6	778	783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331672
22	NC_017574	GCC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
23	NC_017574	CCCG	2	8	854	861	0 %	0 %	25 %	75 %	386331672
24	NC_017574	ATG	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386331672
25	NC_017574	CGC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
26	NC_017574	CCG	2	6	889	894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
27	NC_017574	GAC	2	6	903	908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331672
28	NC_017574	CG	3	6	987	992	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
29	NC_017574	GCC	2	6	993	998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
30	NC_017574	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331672
31	NC_017574	CG	5	10	1117	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
32	NC_017574	CGA	2	6	1193	1198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331672
33	NC_017574	CTA	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331672
34	NC_017574	CTG	3	9	1227	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331672
35	NC_017574	TTC	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386331672
36	NC_017574	CGCA	2	8	1269	1276	25 %	0 %	25 %	50 %	386331672
37	NC_017574	GAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331672
38	NC_017574	TTC	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386331672
39	NC_017574	CG	3	6	1317	1322	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
40	NC_017574	TCA	3	9	1327	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331672
41	NC_017574	CGA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331672
42	NC_017574	GCC	2	6	1421	1426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331672
43	NC_017574	TGA	2	6	1453	1458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386331672
44	NC_017574	GGA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386331672
45	NC_017574	CTT	2	6	1502	1507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386331672
46	NC_017574	GC	3	6	1549	1554	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
47	NC_017574	CG	3	6	1612	1617	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
48	NC_017574	CTG	2	6	1632	1637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331672
49	NC_017574	AGA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331672
50	NC_017574	ACA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331672
51	NC_017574	AAG	2	6	1725	1730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331672
52	NC_017574	CGGC	2	8	1731	1738	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
53	NC_017574	CG	3	6	1745	1750	0 %	0 %	50 %	50 %	386331672
54	NC_017574	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331672
55	NC_017574	CGG	2	6	1823	1828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331672
56	NC_017574	ACCAC	2	10	1834	1843	40 %	0 %	0 %	60 %	386331672
57	NC_017574	TGC	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331672
58	NC_017574	CGA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331672
59	NC_017574	GCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331672
60	NC_017574	ACC	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331672
61	NC_017574	GCG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017574	GC	3	6	1960	1965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017574	GGC	2	6	1979	1984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017574	ATCCG	2	10	1988	1997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017574	GCC	2	6	2004	2009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017574	ACA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017574	GC	3	6	2183	2188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017574	CTG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
69	NC_017574	GCC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331673
70	NC_017574	CTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
71	NC_017574	TCCT	2	8	2347	2354	0 %	50 %	0 %	50 %	386331673
72	NC_017574	CAC	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331673
73	NC_017574	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331673
74	NC_017574	CCA	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331673
75	NC_017574	CG	3	6	2433	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	386331673
76	NC_017574	GC	3	6	2457	2462	0 %	0 %	50 %	50 %	386331673
77	NC_017574	GCC	2	6	2551	2556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331673
78	NC_017574	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331673
79	NC_017574	GC	4	8	2594	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	386331673
80	NC_017574	AGA	2	6	2615	2620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331673
81	NC_017574	CTG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
82	NC_017574	CAG	2	6	2662	2667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331673
83	NC_017574	CTA	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331673
84	NC_017574	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
85	NC_017574	TGG	3	9	2699	2707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386331673
86	NC_017574	GCG	2	6	2759	2764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331673
87	NC_017574	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331673
88	NC_017574	CCG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331673
89	NC_017574	CGG	2	6	2793	2798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331673
90	NC_017574	TCA	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331673
91	NC_017574	CTG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
92	NC_017574	GCA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331673
93	NC_017574	ACC	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331673
94	NC_017574	CCA	2	6	3113	3118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331673
95	NC_017574	GAA	2	6	3130	3135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331673
96	NC_017574	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331673
97	NC_017574	ACCT	2	8	3196	3203	25 %	25 %	0 %	50 %	386331673
98	NC_017574	GC	3	6	3269	3274	0 %	0 %	50 %	50 %	386331673
99	NC_017574	TCA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331673
100	NC_017574	GAC	3	9	3289	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331673
101	NC_017574	CGT	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331673
102	NC_017574	CAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
103	NC_017574	AGC	3	9	3509	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
104	NC_017574	GCC	2	6	3524	3529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331675
105	NC_017574	CAC	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331675
106	NC_017574	CGA	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
107	NC_017574	CGA	2	6	3757	3762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
108	NC_017574	AGCGC	2	10	3777	3786	20 %	0 %	40 %	40 %	386331675
109	NC_017574	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
110	NC_017574	GGC	2	6	3854	3859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
111	NC_017574	GGCGTG	2	12	3866	3877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386331675
112	NC_017574	CGTG	2	8	3879	3886	0 %	25 %	50 %	25 %	386331675
113	NC_017574	CAC	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331675
114	NC_017574	CG	4	8	3952	3959	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
115	NC_017574	CTG	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
116	NC_017574	CAC	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331675
117	NC_017574	CGA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
118	NC_017574	AAC	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331675
119	NC_017574	GCG	2	6	4224	4229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
120	NC_017574	TCG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
121	NC_017574	CAA	2	6	4252	4257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331675
122	NC_017574	GGCGTG	2	12	4310	4321	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386331675
123	NC_017574	ACG	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
124	NC_017574	CAA	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386331675
125	NC_017574	CGG	2	6	4396	4401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
126	NC_017574	CACC	2	8	4402	4409	25 %	0 %	0 %	75 %	386331675
127	NC_017574	GC	3	6	4420	4425	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
128	NC_017574	TCA	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
129	NC_017574	AAG	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331675
130	NC_017574	CGA	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
131	NC_017574	TCC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386331675
132	NC_017574	GAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386331675
133	NC_017574	CTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
134	NC_017574	ACG	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
135	NC_017574	ATC	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
136	NC_017574	TCG	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
137	NC_017574	CG	3	6	4699	4704	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
138	NC_017574	CG	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
139	NC_017574	CGC	2	6	4742	4747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331675
140	NC_017574	TCG	2	6	4830	4835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
141	NC_017574	GGC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
142	NC_017574	GC	5	10	4927	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
143	NC_017574	CCAG	2	8	4953	4960	25 %	0 %	25 %	50 %	386331675
144	NC_017574	TCA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
145	NC_017574	GAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
146	NC_017574	ACC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331675
147	NC_017574	CAT	4	12	5041	5052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
148	NC_017574	GCT	3	9	5089	5097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
149	NC_017574	TTC	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386331675
150	NC_017574	ATC	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
151	NC_017574	GCC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331675
152	NC_017574	GAC	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
153	NC_017574	GC	3	6	5266	5271	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
154	NC_017574	CG	4	8	5331	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
155	NC_017574	CG	3	6	5355	5360	0 %	0 %	50 %	50 %	386331675
156	NC_017574	GCG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
157	NC_017574	CAG	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
158	NC_017574	GGC	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
159	NC_017574	ACG	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331675
160	NC_017574	GCG	2	6	5566	5571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
161	NC_017574	GCG	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
162	NC_017574	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
163	NC_017574	GCT	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
164	NC_017574	GGCTGA	2	12	5764	5775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386331675
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166	NC_017574	CGT	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
167	NC_017574	CTG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331675
168	NC_017574	GCG	2	6	5897	5902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331675
169	NC_017574	TAC	2	6	5914	5919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386331675
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172	NC_017574	CG	3	6	6095	6100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_017574	CCA	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_017574	TAT	2	6	6147	6152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017574	AT	3	6	6190	6195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017574	CCT	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386331676
177	NC_017574	GAC	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331676
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179	NC_017574	ACC	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386331676
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233	NC_017574	CCG	2	6	9333	9338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331678
234	NC_017574	CGT	2	6	9340	9345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386331678
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248	NC_017574	CGAG	2	8	10090	10097	25 %	0 %	50 %	25 %	386331678
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251	NC_017574	GGTC	2	8	10225	10232	0 %	25 %	50 %	25 %	386331678
252	NC_017574	ACG	2	6	10251	10256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331678
253	NC_017574	CAG	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386331678
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259	NC_017574	TGCT	2	8	10550	10557	0 %	50 %	25 %	25 %	386331678
260	NC_017574	GCC	2	6	10838	10843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331678
261	NC_017574	CGC	2	6	10846	10851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386331678
262	NC_017574	CTT	2	6	10902	10907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017574	GTT	2	6	10932	10937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017574	TGC	2	6	10949	10954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_017574	TGG	2	6	11045	11050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017574	ATGC	2	8	11093	11100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
267	NC_017574	GC	3	6	11128	11133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
268	NC_017574	GCC	2	6	11153	11158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_017574	CA	4	8	11176	11183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_017574	GGGA	2	8	11251	11258	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017574	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_017574	CGG	2	6	11375	11380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_017574	GT	3	6	11430	11435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017574	GCTG	2	8	11658	11665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
275	NC_017574	CGA	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017574	GAGCG	2	10	11692	11701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
277	NC_017574	TCG	2	6	11780	11785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017574	ACT	3	9	11819	11827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017574	CTA	2	6	11883	11888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017574	GTT	2	6	12006	12011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_017574	TGG	2	6	19255	19260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386331684
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432	NC_017574	GTGA	2	8	20643	20650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017574	CGG	3	9	20682	20690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386331686
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498	NC_017574	T	8	8	24008	24015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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