MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47502	NC_017569	TA	3	6	2127311	2127316	50 %	50 %	0 %	0 %	386322333
47503	NC_017569	TCA	2	6	2127390	2127395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322333
47504	NC_017569	CTT	2	6	2127428	2127433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322333
47505	NC_017569	AC	3	6	2127503	2127508	50 %	0 %	0 %	50 %	386322333
47506	NC_017569	TAAA	2	8	2127523	2127530	75 %	25 %	0 %	0 %	386322333
47507	NC_017569	TAT	2	6	2127535	2127540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322333
47508	NC_017569	AAC	2	6	2127590	2127595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47509	NC_017569	AAC	2	6	2127614	2127619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47510	NC_017569	ATA	2	6	2127677	2127682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47511	NC_017569	TAGA	2	8	2127777	2127784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47512	NC_017569	CTT	2	6	2127792	2127797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47513	NC_017569	A	6	6	2127828	2127833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47514	NC_017569	GTAAAT	2	12	2127895	2127906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47515	NC_017569	ACTAA	2	10	2127926	2127935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47516	NC_017569	TGT	2	6	2128133	2128138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47517	NC_017569	AAAT	2	8	2128180	2128187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47518	NC_017569	T	6	6	2128230	2128235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47519	NC_017569	AAT	2	6	2128271	2128276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47520	NC_017569	T	6	6	2128311	2128316	0 %	100 %	0 %	0 %	386322334
47521	NC_017569	CT	3	6	2128354	2128359	0 %	50 %	0 %	50 %	386322334
47522	NC_017569	T	7	7	2128359	2128365	0 %	100 %	0 %	0 %	386322334
47523	NC_017569	T	7	7	2128394	2128400	0 %	100 %	0 %	0 %	386322334
47524	NC_017569	T	6	6	2128417	2128422	0 %	100 %	0 %	0 %	386322334
47525	NC_017569	TA	3	6	2128453	2128458	50 %	50 %	0 %	0 %	386322334
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47528	NC_017569	TAT	2	6	2128669	2128674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322334
47529	NC_017569	T	6	6	2128694	2128699	0 %	100 %	0 %	0 %	386322334
47530	NC_017569	ATC	2	6	2128706	2128711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322334
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47537	NC_017569	CT	3	6	2129042	2129047	0 %	50 %	0 %	50 %	386322334
47538	NC_017569	TAG	2	6	2129096	2129101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322334
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47541	NC_017569	TA	4	8	2129294	2129301	50 %	50 %	0 %	0 %	386322334
47542	NC_017569	GTATT	2	10	2129315	2129324	20 %	60 %	20 %	0 %	386322334
47543	NC_017569	TGT	2	6	2129372	2129377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322334
47544	NC_017569	TTA	2	6	2129470	2129475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47545	NC_017569	GAT	2	6	2129479	2129484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47546	NC_017569	TGA	2	6	2129516	2129521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47547	NC_017569	TCA	2	6	2129538	2129543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322335
47548	NC_017569	TGA	2	6	2129583	2129588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322335
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47550	NC_017569	TC	3	6	2129893	2129898	0 %	50 %	0 %	50 %	386322335
47551	NC_017569	TAT	2	6	2129911	2129916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322335
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47553	NC_017569	TAT	2	6	2129952	2129957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47554	NC_017569	TGGTTA	2	12	2129971	2129982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47555	NC_017569	CGG	2	6	2130045	2130050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47587	NC_017569	TCTT	2	8	2131516	2131523	0 %	75 %	0 %	25 %	386322339
47588	NC_017569	TTG	2	6	2131527	2131532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322339
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47592	NC_017569	TTTAT	2	10	2131665	2131674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47593	NC_017569	AT	3	6	2131682	2131687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47594	NC_017569	TA	3	6	2131699	2131704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47595	NC_017569	ATGTTT	2	12	2131726	2131737	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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47597	NC_017569	T	7	7	2131778	2131784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47598	NC_017569	A	6	6	2131813	2131818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47599	NC_017569	AAG	2	6	2131847	2131852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322340
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47602	NC_017569	TAA	2	6	2131997	2132002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322340
47603	NC_017569	A	6	6	2132065	2132070	100 %	0 %	0 %	0 %	386322340
47604	NC_017569	CTA	2	6	2132081	2132086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47605	NC_017569	A	7	7	2132094	2132100	100 %	0 %	0 %	0 %	386322341
47606	NC_017569	AAT	2	6	2132107	2132112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322341
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47608	NC_017569	TAT	2	6	2132226	2132231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322341
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47610	NC_017569	CTC	2	6	2132281	2132286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322341
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47612	NC_017569	TTG	2	6	2132350	2132355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322341
47613	NC_017569	AAT	3	9	2132357	2132365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322341
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47616	NC_017569	T	6	6	2132594	2132599	0 %	100 %	0 %	0 %	386322341
47617	NC_017569	A	6	6	2132630	2132635	100 %	0 %	0 %	0 %	386322341
47618	NC_017569	CT	3	6	2132644	2132649	0 %	50 %	0 %	50 %	386322341
47619	NC_017569	T	6	6	2132734	2132739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47620	NC_017569	CAA	2	6	2132785	2132790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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