MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_017569	CTA	2	6	2038266	2038271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322265
45502	NC_017569	CTT	2	6	2038280	2038285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322265
45503	NC_017569	CAATA	2	10	2038312	2038321	60 %	20 %	0 %	20 %	386322265
45504	NC_017569	TGC	2	6	2038325	2038330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322265
45505	NC_017569	TA	3	6	2038443	2038448	50 %	50 %	0 %	0 %	386322265
45506	NC_017569	AT	3	6	2038527	2038532	50 %	50 %	0 %	0 %	386322265
45507	NC_017569	T	6	6	2038532	2038537	0 %	100 %	0 %	0 %	386322265
45508	NC_017569	T	6	6	2038581	2038586	0 %	100 %	0 %	0 %	386322265
45509	NC_017569	ATT	2	6	2038607	2038612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322265
45510	NC_017569	T	6	6	2038616	2038621	0 %	100 %	0 %	0 %	386322265
45511	NC_017569	T	6	6	2038630	2038635	0 %	100 %	0 %	0 %	386322265
45512	NC_017569	T	6	6	2038706	2038711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45513	NC_017569	A	6	6	2038715	2038720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45514	NC_017569	ACA	2	6	2038722	2038727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45515	NC_017569	A	6	6	2038727	2038732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45516	NC_017569	CTA	2	6	2038737	2038742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45517	NC_017569	TAA	2	6	2038768	2038773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45518	NC_017569	TCA	2	6	2038806	2038811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322266
45519	NC_017569	CAC	2	6	2038833	2038838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322266
45520	NC_017569	TAG	2	6	2038861	2038866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322266
45521	NC_017569	TCA	2	6	2038887	2038892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322266
45522	NC_017569	ATC	2	6	2038904	2038909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322266
45523	NC_017569	CTT	2	6	2038921	2038926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322266
45524	NC_017569	GAAT	2	8	2038942	2038949	50 %	25 %	25 %	0 %	386322266
45525	NC_017569	TCT	2	6	2038980	2038985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322266
45526	NC_017569	TGT	2	6	2038996	2039001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322266
45527	NC_017569	TAA	2	6	2039006	2039011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322266
45528	NC_017569	ATT	2	6	2039085	2039090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45529	NC_017569	CAT	2	6	2039264	2039269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322267
45530	NC_017569	AAAC	2	8	2039290	2039297	75 %	0 %	0 %	25 %	386322267
45531	NC_017569	TCA	2	6	2039357	2039362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322267
45532	NC_017569	TCT	2	6	2039374	2039379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322267
45533	NC_017569	ATT	2	6	2039391	2039396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322267
45534	NC_017569	CTA	2	6	2039558	2039563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322267
45535	NC_017569	ATA	2	6	2039569	2039574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322267
45536	NC_017569	GAT	2	6	2039653	2039658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322267
45537	NC_017569	AATGC	2	10	2039673	2039682	40 %	20 %	20 %	20 %	386322267
45538	NC_017569	AATCA	2	10	2039754	2039763	60 %	20 %	0 %	20 %	386322267
45539	NC_017569	TCT	2	6	2039818	2039823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322267
45540	NC_017569	TCTA	2	8	2039859	2039866	25 %	50 %	0 %	25 %	386322267
45541	NC_017569	CTA	2	6	2039918	2039923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322267
45542	NC_017569	TAC	2	6	2039991	2039996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322267
45543	NC_017569	ATA	2	6	2040041	2040046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45544	NC_017569	TAA	2	6	2040055	2040060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45545	NC_017569	A	6	6	2040069	2040074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45546	NC_017569	A	7	7	2040112	2040118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45547	NC_017569	ATTT	2	8	2040125	2040132	25 %	75 %	0 %	0 %	386322268
45548	NC_017569	ACA	2	6	2040143	2040148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322268
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45550	NC_017569	TGT	2	6	2040210	2040215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322268
45551	NC_017569	TTTCT	2	10	2040305	2040314	0 %	80 %	0 %	20 %	386322268
45552	NC_017569	ATTGC	2	10	2040339	2040348	20 %	40 %	20 %	20 %	386322268
45553	NC_017569	T	6	6	2040383	2040388	0 %	100 %	0 %	0 %	386322268
45554	NC_017569	A	6	6	2040398	2040403	100 %	0 %	0 %	0 %	386322268
45555	NC_017569	T	7	7	2040424	2040430	0 %	100 %	0 %	0 %	386322268
45556	NC_017569	TAA	2	6	2040476	2040481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45557	NC_017569	T	7	7	2040486	2040492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45558	NC_017569	T	6	6	2040554	2040559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45559	NC_017569	ACT	2	6	2040594	2040599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322269
45560	NC_017569	ATGA	2	8	2040636	2040643	50 %	25 %	25 %	0 %	386322269
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45564	NC_017569	CTT	2	6	2040757	2040762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322269
45565	NC_017569	T	7	7	2040792	2040798	0 %	100 %	0 %	0 %	386322269
45566	NC_017569	T	6	6	2040801	2040806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45567	NC_017569	TTGTT	2	10	2040808	2040817	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45568	NC_017569	AT	4	8	2040822	2040829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45569	NC_017569	CTT	2	6	2040841	2040846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322270
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45572	NC_017569	GAA	2	6	2040937	2040942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322270
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45574	NC_017569	AGT	2	6	2041050	2041055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322270
45575	NC_017569	CT	3	6	2041067	2041072	0 %	50 %	0 %	50 %	386322270
45576	NC_017569	TA	3	6	2041225	2041230	50 %	50 %	0 %	0 %	386322270
45577	NC_017569	CCA	2	6	2041235	2041240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322270
45578	NC_017569	T	7	7	2041258	2041264	0 %	100 %	0 %	0 %	386322270
45579	NC_017569	TCT	2	6	2041268	2041273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322270
45580	NC_017569	T	7	7	2041288	2041294	0 %	100 %	0 %	0 %	386322270
45581	NC_017569	CTTT	2	8	2041365	2041372	0 %	75 %	0 %	25 %	386322270
45582	NC_017569	TAC	2	6	2041374	2041379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322270
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45584	NC_017569	CCAT	2	8	2041400	2041407	25 %	25 %	0 %	50 %	386322270
45585	NC_017569	AT	3	6	2041406	2041411	50 %	50 %	0 %	0 %	386322270
45586	NC_017569	A	7	7	2041416	2041422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45587	NC_017569	TAC	2	6	2041425	2041430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45588	NC_017569	A	7	7	2041448	2041454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45589	NC_017569	ATA	2	6	2041472	2041477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45590	NC_017569	AAT	2	6	2041478	2041483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45591	NC_017569	TCA	3	9	2041505	2041513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322271
45592	NC_017569	TAA	2	6	2041587	2041592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322271
45593	NC_017569	A	6	6	2041635	2041640	100 %	0 %	0 %	0 %	386322271
45594	NC_017569	CTT	2	6	2041664	2041669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322271
45595	NC_017569	T	6	6	2041689	2041694	0 %	100 %	0 %	0 %	386322271
45596	NC_017569	ACT	2	6	2041750	2041755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322271
45597	NC_017569	TCT	3	9	2041787	2041795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322271
45598	NC_017569	ATA	2	6	2041822	2041827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322271
45599	NC_017569	GTTCTT	2	12	2041874	2041885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386322271
45600	NC_017569	AT	3	6	2041914	2041919	50 %	50 %	0 %	0 %	386322271
45601	NC_017569	T	7	7	2041967	2041973	0 %	100 %	0 %	0 %	386322271
45602	NC_017569	TCC	2	6	2041991	2041996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45603	NC_017569	T	8	8	2042025	2042032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45604	NC_017569	TTAT	2	8	2042070	2042077	25 %	75 %	0 %	0 %	386322272
45605	NC_017569	TCTCCT	2	12	2042141	2042152	0 %	50 %	0 %	50 %	386322272
45606	NC_017569	TC	3	6	2042190	2042195	0 %	50 %	0 %	50 %	386322272
45607	NC_017569	TTC	2	6	2042219	2042224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322272
45608	NC_017569	T	6	6	2042241	2042246	0 %	100 %	0 %	0 %	386322273
45609	NC_017569	T	6	6	2042252	2042257	0 %	100 %	0 %	0 %	386322273
45610	NC_017569	TC	3	6	2042262	2042267	0 %	50 %	0 %	50 %	386322273
45611	NC_017569	TAA	2	6	2042298	2042303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322273
45612	NC_017569	T	6	6	2042313	2042318	0 %	100 %	0 %	0 %	386322273
45613	NC_017569	AGT	2	6	2042350	2042355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322273
45614	NC_017569	AT	3	6	2042356	2042361	50 %	50 %	0 %	0 %	386322273
45615	NC_017569	CTG	2	6	2042393	2042398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322273
45616	NC_017569	CTAC	2	8	2042485	2042492	25 %	25 %	0 %	50 %	386322273
45617	NC_017569	ACA	2	6	2042623	2042628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322273
45618	NC_017569	TAA	2	6	2042657	2042662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322273
45619	NC_017569	TACCG	2	10	2042913	2042922	20 %	20 %	20 %	40 %	386322273
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