MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_017569	GTA	2	6	1948569	1948574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43502	NC_017569	CTC	2	6	1948584	1948589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43503	NC_017569	AG	3	6	1948665	1948670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_017569	AAG	2	6	1948775	1948780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_017569	AGA	2	6	1948929	1948934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43506	NC_017569	A	6	6	1949047	1949052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43507	NC_017569	ACC	2	6	1949126	1949131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43508	NC_017569	ATT	2	6	1949180	1949185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43509	NC_017569	A	6	6	1949246	1949251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_017569	T	6	6	1949274	1949279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43511	NC_017569	TGAA	2	8	1949288	1949295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43512	NC_017569	TA	3	6	1949300	1949305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_017569	TGA	2	6	1949319	1949324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43514	NC_017569	T	6	6	1949363	1949368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_017569	TTAGT	2	10	1949381	1949390	20 %	60 %	20 %	0 %	386322185
43516	NC_017569	T	6	6	1949531	1949536	0 %	100 %	0 %	0 %	386322185
43517	NC_017569	T	6	6	1949695	1949700	0 %	100 %	0 %	0 %	386322185
43518	NC_017569	AAT	2	6	1949726	1949731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322185
43519	NC_017569	TCAC	2	8	1949733	1949740	25 %	25 %	0 %	50 %	386322185
43520	NC_017569	TCTG	2	8	1949753	1949760	0 %	50 %	25 %	25 %	386322185
43521	NC_017569	AAT	2	6	1949768	1949773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322185
43522	NC_017569	AAT	2	6	1949802	1949807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322185
43523	NC_017569	ATTT	2	8	1949816	1949823	25 %	75 %	0 %	0 %	386322185
43524	NC_017569	T	6	6	1949838	1949843	0 %	100 %	0 %	0 %	386322185
43525	NC_017569	TTTCC	2	10	1949904	1949913	0 %	60 %	0 %	40 %	386322185
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43527	NC_017569	CAAT	2	8	1950055	1950062	50 %	25 %	0 %	25 %	386322185
43528	NC_017569	AGT	2	6	1950082	1950087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322185
43529	NC_017569	T	6	6	1950181	1950186	0 %	100 %	0 %	0 %	386322185
43530	NC_017569	T	8	8	1950227	1950234	0 %	100 %	0 %	0 %	386322185
43531	NC_017569	GGTCA	2	10	1950242	1950251	20 %	20 %	40 %	20 %	386322185
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43538	NC_017569	AT	3	6	1950586	1950591	50 %	50 %	0 %	0 %	386322186
43539	NC_017569	T	6	6	1950591	1950596	0 %	100 %	0 %	0 %	386322186
43540	NC_017569	GAA	2	6	1950610	1950615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322186
43541	NC_017569	TTA	2	6	1950641	1950646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322186
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43544	NC_017569	T	6	6	1950826	1950831	0 %	100 %	0 %	0 %	386322186
43545	NC_017569	AATAA	2	10	1950873	1950882	80 %	20 %	0 %	0 %	386322186
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43547	NC_017569	CTT	2	6	1950968	1950973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322186
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43549	NC_017569	A	6	6	1951130	1951135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43550	NC_017569	T	7	7	1951187	1951193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_017569	ATT	2	6	1951195	1951200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43552	NC_017569	AT	4	8	1951223	1951230	50 %	50 %	0 %	0 %	386322187
43553	NC_017569	T	6	6	1951240	1951245	0 %	100 %	0 %	0 %	386322187
43554	NC_017569	AAT	2	6	1951267	1951272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322187
43555	NC_017569	T	7	7	1951287	1951293	0 %	100 %	0 %	0 %	386322187
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43557	NC_017569	T	7	7	1951339	1951345	0 %	100 %	0 %	0 %	386322187
43558	NC_017569	ACAT	2	8	1951351	1951358	50 %	25 %	0 %	25 %	386322187
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43563	NC_017569	ATTA	2	8	1951650	1951657	50 %	50 %	0 %	0 %	386322187
43564	NC_017569	TA	3	6	1951700	1951705	50 %	50 %	0 %	0 %	386322187
43565	NC_017569	ATTT	2	8	1951716	1951723	25 %	75 %	0 %	0 %	386322187
43566	NC_017569	T	6	6	1951721	1951726	0 %	100 %	0 %	0 %	386322187
43567	NC_017569	T	7	7	1951775	1951781	0 %	100 %	0 %	0 %	386322187
43568	NC_017569	TTA	2	6	1951793	1951798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43572	NC_017569	TCT	2	6	1951978	1951983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322188
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43575	NC_017569	TCA	2	6	1952162	1952167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322188
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43589	NC_017569	TCTT	2	8	1952790	1952797	0 %	75 %	0 %	25 %	386322188
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43593	NC_017569	ATT	2	6	1953060	1953065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322188
43594	NC_017569	TAA	2	6	1953068	1953073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322188
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43605	NC_017569	TCT	2	6	1953546	1953551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322188
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