MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_017569	TCA	2	6	1659219	1659224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321915
37003	NC_017569	A	6	6	1659311	1659316	100 %	0 %	0 %	0 %	386321915
37004	NC_017569	TTTGG	2	10	1659325	1659334	0 %	60 %	40 %	0 %	386321915
37005	NC_017569	ACA	2	6	1659349	1659354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386321915
37006	NC_017569	A	6	6	1659367	1659372	100 %	0 %	0 %	0 %	386321915
37007	NC_017569	CTT	2	6	1659379	1659384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321915
37008	NC_017569	TAA	2	6	1659459	1659464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321915
37009	NC_017569	TTTAG	2	10	1659473	1659482	20 %	60 %	20 %	0 %	386321915
37010	NC_017569	TCT	2	6	1659497	1659502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321915
37011	NC_017569	TAA	2	6	1659529	1659534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321915
37012	NC_017569	TCT	2	6	1659680	1659685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321915
37013	NC_017569	TCA	2	6	1659798	1659803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321915
37014	NC_017569	TAGTTT	2	12	1659823	1659834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386321915
37015	NC_017569	GATTT	2	10	1660020	1660029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37016	NC_017569	ACTT	2	8	1660041	1660048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37017	NC_017569	AAG	2	6	1660227	1660232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321916
37018	NC_017569	TAG	2	6	1660315	1660320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321916
37019	NC_017569	GAA	2	6	1660367	1660372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321916
37020	NC_017569	AGT	2	6	1660373	1660378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321916
37021	NC_017569	GTA	2	6	1660443	1660448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321916
37022	NC_017569	T	6	6	1660784	1660789	0 %	100 %	0 %	0 %	386321916
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37027	NC_017569	GGA	2	6	1660985	1660990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386321916
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37031	NC_017569	ATA	2	6	1661055	1661060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321917
37032	NC_017569	TAA	2	6	1661093	1661098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321917
37033	NC_017569	GGTT	2	8	1661109	1661116	0 %	50 %	50 %	0 %	386321917
37034	NC_017569	TGC	2	6	1661123	1661128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321917
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37039	NC_017569	T	6	6	1661429	1661434	0 %	100 %	0 %	0 %	386321917
37040	NC_017569	TA	3	6	1661439	1661444	50 %	50 %	0 %	0 %	386321917
37041	NC_017569	TAATT	2	10	1661468	1661477	40 %	60 %	0 %	0 %	386321917
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37047	NC_017569	GTG	2	6	1661651	1661656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386321917
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37049	NC_017569	TAAAA	2	10	1661803	1661812	80 %	20 %	0 %	0 %	386321917
37050	NC_017569	A	7	7	1661817	1661823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37051	NC_017569	TTA	2	6	1661830	1661835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37052	NC_017569	T	6	6	1661852	1661857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37053	NC_017569	TTAA	2	8	1661872	1661879	50 %	50 %	0 %	0 %	386321918
37054	NC_017569	TCGTCT	2	12	1661883	1661894	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386321918
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37056	NC_017569	GGTT	2	8	1662037	1662044	0 %	50 %	50 %	0 %	386321918
37057	NC_017569	ATT	2	6	1662095	1662100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321918
37058	NC_017569	TTTC	2	8	1662125	1662132	0 %	75 %	0 %	25 %	386321918
37059	NC_017569	GTA	2	6	1662149	1662154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321918
37060	NC_017569	TCA	2	6	1662177	1662182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321918
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37064	NC_017569	TAA	2	6	1662325	1662330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37065	NC_017569	AAT	2	6	1662360	1662365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37066	NC_017569	TTTA	2	8	1662376	1662383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37067	NC_017569	A	6	6	1662415	1662420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37068	NC_017569	ATT	2	6	1662436	1662441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37069	NC_017569	TAA	2	6	1662443	1662448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37070	NC_017569	A	6	6	1662502	1662507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37071	NC_017569	TA	3	6	1662516	1662521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37072	NC_017569	ATC	2	6	1662586	1662591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321919
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37087	NC_017569	T	6	6	1663291	1663296	0 %	100 %	0 %	0 %	386321919
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37092	NC_017569	AG	3	6	1663400	1663405	50 %	0 %	50 %	0 %	386321919
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37102	NC_017569	ATG	2	6	1663911	1663916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37103	NC_017569	ATA	2	6	1663923	1663928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37104	NC_017569	A	6	6	1663958	1663963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37105	NC_017569	AAAT	2	8	1664012	1664019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37106	NC_017569	A	6	6	1664034	1664039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37107	NC_017569	ATC	2	6	1664118	1664123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321920
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37110	NC_017569	T	6	6	1664264	1664269	0 %	100 %	0 %	0 %	386321920
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37114	NC_017569	TAC	2	6	1664438	1664443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321920
37115	NC_017569	TTG	2	6	1664512	1664517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321920
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37118	NC_017569	CCA	2	6	1664650	1664655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321920
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