MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017569	TCA	2	6	657846	657851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321014
14502	NC_017569	TCC	2	6	657869	657874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321014
14503	NC_017569	CAC	2	6	657904	657909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321014
14504	NC_017569	TTTA	2	8	657919	657926	25 %	75 %	0 %	0 %	386321014
14505	NC_017569	AAT	2	6	657964	657969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321014
14506	NC_017569	CAA	2	6	658005	658010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386321014
14507	NC_017569	CAG	2	6	658092	658097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386321014
14508	NC_017569	ATTC	2	8	658105	658112	25 %	50 %	0 %	25 %	386321014
14509	NC_017569	AAATTG	2	12	658119	658130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_017569	A	7	7	658147	658153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_017569	ATA	2	6	658195	658200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_017569	CTA	2	6	658210	658215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321015
14513	NC_017569	GAA	2	6	658243	658248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321015
14514	NC_017569	ATT	2	6	658372	658377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14515	NC_017569	TGA	2	6	658445	658450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321015
14516	NC_017569	AAT	2	6	658500	658505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14517	NC_017569	ACC	2	6	658583	658588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321015
14518	NC_017569	AAT	2	6	658599	658604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14519	NC_017569	TTTA	2	8	658672	658679	25 %	75 %	0 %	0 %	386321015
14520	NC_017569	ATT	2	6	658684	658689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14521	NC_017569	TTAAA	2	10	658986	658995	60 %	40 %	0 %	0 %	386321015
14522	NC_017569	T	8	8	659011	659018	0 %	100 %	0 %	0 %	386321015
14523	NC_017569	T	6	6	659056	659061	0 %	100 %	0 %	0 %	386321015
14524	NC_017569	TTGT	2	8	659074	659081	0 %	75 %	25 %	0 %	386321015
14525	NC_017569	TAA	2	6	659089	659094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14526	NC_017569	CAA	2	6	659107	659112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386321015
14527	NC_017569	TTA	2	6	659135	659140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14528	NC_017569	AGA	2	6	659156	659161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321015
14529	NC_017569	AATTAT	2	12	659211	659222	50 %	50 %	0 %	0 %	386321015
14530	NC_017569	CATTT	2	10	659347	659356	20 %	60 %	0 %	20 %	386321015
14531	NC_017569	GTT	2	6	659415	659420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321015
14532	NC_017569	ATG	2	6	659464	659469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321015
14533	NC_017569	AAT	2	6	659474	659479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14534	NC_017569	TAT	2	6	659484	659489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14535	NC_017569	GATT	2	8	659502	659509	25 %	50 %	25 %	0 %	386321015
14536	NC_017569	TGC	2	6	659554	659559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321015
14537	NC_017569	T	6	6	659561	659566	0 %	100 %	0 %	0 %	386321015
14538	NC_017569	CAT	2	6	659598	659603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321015
14539	NC_017569	AAT	2	6	659604	659609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14540	NC_017569	ATT	2	6	659647	659652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14541	NC_017569	ATA	2	6	659780	659785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14542	NC_017569	AAAC	2	8	659827	659834	75 %	0 %	0 %	25 %	386321015
14543	NC_017569	T	6	6	659875	659880	0 %	100 %	0 %	0 %	386321015
14544	NC_017569	CCA	2	6	659924	659929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321015
14545	NC_017569	ATT	2	6	659965	659970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14546	NC_017569	TCT	2	6	659990	659995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321015
14547	NC_017569	TCC	2	6	660106	660111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321015
14548	NC_017569	T	6	6	660123	660128	0 %	100 %	0 %	0 %	386321015
14549	NC_017569	ATT	2	6	660178	660183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321015
14550	NC_017569	CTTT	2	8	660241	660248	0 %	75 %	0 %	25 %	386321015
14551	NC_017569	ACA	2	6	660278	660283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386321015
14552	NC_017569	CTTTT	2	10	660295	660304	0 %	80 %	0 %	20 %	386321015
14553	NC_017569	TAA	2	6	660334	660339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321015
14554	NC_017569	A	6	6	660338	660343	100 %	0 %	0 %	0 %	386321015
14555	NC_017569	TCAA	2	8	660381	660388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14556	NC_017569	A	6	6	660387	660392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_017569	ATT	2	6	660424	660429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_017569	TTA	2	6	660444	660449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321016
14559	NC_017569	TAT	2	6	660461	660466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386321016
14560	NC_017569	TTG	2	6	660603	660608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321016
14561	NC_017569	TGAA	2	8	660625	660632	50 %	25 %	25 %	0 %	386321016
14562	NC_017569	AAAC	2	8	660638	660645	75 %	0 %	0 %	25 %	386321016
14563	NC_017569	GCT	2	6	660691	660696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321016
14564	NC_017569	ATGTTG	2	12	660715	660726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386321016
14565	NC_017569	TTG	2	6	660745	660750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386321016
14566	NC_017569	ATT	3	9	660759	660767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_017569	TTA	2	6	660771	660776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_017569	ATA	2	6	660798	660803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_017569	TCT	2	6	660808	660813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_017569	T	8	8	660827	660834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_017569	GCT	2	6	660977	660982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321017
14572	NC_017569	TAG	2	6	660996	661001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321017
14573	NC_017569	GCTGTA	2	12	661079	661090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386321017
14574	NC_017569	TCT	2	6	661121	661126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14575	NC_017569	CT	3	6	661125	661130	0 %	50 %	0 %	50 %	386321017
14576	NC_017569	CT	3	6	661156	661161	0 %	50 %	0 %	50 %	386321017
14577	NC_017569	ATC	2	6	661169	661174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14578	NC_017569	ACC	2	6	661214	661219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14579	NC_017569	CCA	2	6	661298	661303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14580	NC_017569	TCA	2	6	661323	661328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14581	NC_017569	GAT	2	6	661339	661344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321017
14582	NC_017569	TCA	2	6	661358	661363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14583	NC_017569	CT	3	6	661593	661598	0 %	50 %	0 %	50 %	386321017
14584	NC_017569	TAC	2	6	661615	661620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14585	NC_017569	TAC	2	6	661636	661641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14586	NC_017569	TTAA	2	8	661736	661743	50 %	50 %	0 %	0 %	386321017
14587	NC_017569	TCT	2	6	661761	661766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14588	NC_017569	T	6	6	661861	661866	0 %	100 %	0 %	0 %	386321017
14589	NC_017569	TTC	2	6	661891	661896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14590	NC_017569	CTGT	2	8	661902	661909	0 %	50 %	25 %	25 %	386321017
14591	NC_017569	ATA	2	6	661943	661948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386321017
14592	NC_017569	TTC	2	6	662027	662032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14593	NC_017569	GTAAG	2	10	662068	662077	40 %	20 %	40 %	0 %	386321017
14594	NC_017569	CCA	2	6	662082	662087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14595	NC_017569	CAC	2	6	662143	662148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14596	NC_017569	CTT	2	6	662166	662171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14597	NC_017569	TC	3	6	662219	662224	0 %	50 %	0 %	50 %	386321017
14598	NC_017569	TGG	2	6	662273	662278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386321017
14599	NC_017569	TGC	2	6	662323	662328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386321017
14600	NC_017569	ATC	2	6	662357	662362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14601	NC_017569	CT	3	6	662406	662411	0 %	50 %	0 %	50 %	386321017
14602	NC_017569	GAAC	2	8	662432	662439	50 %	0 %	25 %	25 %	386321017
14603	NC_017569	TCT	2	6	662469	662474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14604	NC_017569	TTC	2	6	662482	662487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14605	NC_017569	AT	4	8	662536	662543	50 %	50 %	0 %	0 %	386321017
14606	NC_017569	CTA	2	6	662586	662591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14607	NC_017569	GTG	2	6	662610	662615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386321017
14608	NC_017569	TCT	2	6	662686	662691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14609	NC_017569	CCG	2	6	662709	662714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386321017
14610	NC_017569	CAT	2	6	662926	662931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14611	NC_017569	AT	3	6	662930	662935	50 %	50 %	0 %	0 %	386321017
14612	NC_017569	ACC	2	6	662947	662952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14613	NC_017569	GGTC	2	8	662955	662962	0 %	25 %	50 %	25 %	386321017
14614	NC_017569	ATCA	2	8	663016	663023	50 %	25 %	0 %	25 %	386321017
14615	NC_017569	ATC	2	6	663079	663084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321017
14616	NC_017569	CCG	2	6	663096	663101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386321017
14617	NC_017569	TCT	2	6	663117	663122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321017
14618	NC_017569	CAC	2	6	663130	663135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386321017
14619	NC_017569	CCT	2	6	663161	663166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386321017
14620	NC_017569	GAACT	2	10	663208	663217	40 %	20 %	20 %	20 %	386321017
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14622	NC_017569	TGA	2	6	663291	663296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321017
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14653	NC_017569	T	6	6	664840	664845	0 %	100 %	0 %	0 %	386321017
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14722	NC_017569	GATA	2	8	668020	668027	50 %	25 %	25 %	0 %	386321018
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14724	NC_017569	AAATC	2	10	668143	668152	60 %	20 %	0 %	20 %	386321018
14725	NC_017569	TCTA	2	8	668180	668187	25 %	50 %	0 %	25 %	386321018
14726	NC_017569	TTTC	2	8	668199	668206	0 %	75 %	0 %	25 %	386321018
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14731	NC_017569	TA	3	6	668420	668425	50 %	50 %	0 %	0 %	386321018
14732	NC_017569	GTA	2	6	668451	668456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321018
14733	NC_017569	TCCA	2	8	668460	668467	25 %	25 %	0 %	50 %	386321018
14734	NC_017569	GAA	2	6	668534	668539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386321018
14735	NC_017569	TAC	2	6	668567	668572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321018
14736	NC_017569	TGA	2	6	668590	668595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386321018
14737	NC_017569	GTACC	2	10	668623	668632	20 %	20 %	20 %	40 %	386321018
14738	NC_017569	ATC	2	6	668663	668668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386321018
14739	NC_017569	TAAG	2	8	668721	668728	50 %	25 %	25 %	0 %	386321018
14740	NC_017569	CT	4	8	668731	668738	0 %	50 %	0 %	50 %	386321018
14741	NC_017569	AC	3	6	668739	668744	50 %	0 %	0 %	50 %	386321018
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