MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017569	ACA	2	6	634651	634656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320991
14003	NC_017569	TGA	2	6	634675	634680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320991
14004	NC_017569	AGT	2	6	634753	634758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320991
14005	NC_017569	TAC	2	6	634794	634799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320991
14006	NC_017569	AAG	2	6	634878	634883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320991
14007	NC_017569	TAG	2	6	634884	634889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320991
14008	NC_017569	TGA	2	6	634918	634923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320991
14009	NC_017569	ACA	2	6	634956	634961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320991
14010	NC_017569	AGA	2	6	634967	634972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320991
14011	NC_017569	AAGAA	2	10	635020	635029	80 %	0 %	20 %	0 %	386320991
14012	NC_017569	ATC	2	6	635046	635051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_017569	TAT	2	6	635079	635084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017569	T	7	7	635102	635108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017569	TA	3	6	635230	635235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017569	A	6	6	635266	635271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_017569	TTAA	2	8	635273	635280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_017569	T	6	6	635296	635301	0 %	100 %	0 %	0 %	386320992
14019	NC_017569	CAT	2	6	635414	635419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320992
14020	NC_017569	TTA	2	6	635472	635477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320992
14021	NC_017569	GGCA	2	8	635555	635562	25 %	0 %	50 %	25 %	386320992
14022	NC_017569	TGA	3	9	635575	635583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320992
14023	NC_017569	T	6	6	635621	635626	0 %	100 %	0 %	0 %	386320992
14024	NC_017569	CTT	2	6	635689	635694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320992
14025	NC_017569	GCG	2	6	635703	635708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320992
14026	NC_017569	AG	3	6	635739	635744	50 %	0 %	50 %	0 %	386320992
14027	NC_017569	AGA	2	6	635747	635752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320992
14028	NC_017569	ACA	2	6	635773	635778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320992
14029	NC_017569	AAC	2	6	635838	635843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320992
14030	NC_017569	GAA	2	6	635943	635948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320992
14031	NC_017569	TGG	2	6	635978	635983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320992
14032	NC_017569	CATG	2	8	636000	636007	25 %	25 %	25 %	25 %	386320992
14033	NC_017569	AT	3	6	636066	636071	50 %	50 %	0 %	0 %	386320992
14034	NC_017569	AAT	2	6	636089	636094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320992
14035	NC_017569	CAA	2	6	636126	636131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320992
14036	NC_017569	ACTAC	3	15	636186	636200	40 %	20 %	0 %	40 %	386320992
14037	NC_017569	AGACA	2	10	636231	636240	60 %	0 %	20 %	20 %	386320992
14038	NC_017569	TCA	2	6	636307	636312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320992
14039	NC_017569	A	7	7	636314	636320	100 %	0 %	0 %	0 %	386320992
14040	NC_017569	TAC	2	6	636411	636416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320992
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14042	NC_017569	AGA	2	6	636608	636613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320992
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14044	NC_017569	TTC	2	6	636642	636647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320992
14045	NC_017569	TTTC	2	8	636693	636700	0 %	75 %	0 %	25 %	386320992
14046	NC_017569	AG	3	6	636717	636722	50 %	0 %	50 %	0 %	386320992
14047	NC_017569	AAT	2	6	636744	636749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320992
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14049	NC_017569	CTA	2	6	636833	636838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320992
14050	NC_017569	TCA	2	6	636874	636879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320992
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14052	NC_017569	AGT	2	6	637046	637051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320992
14053	NC_017569	TC	3	6	637075	637080	0 %	50 %	0 %	50 %	386320992
14054	NC_017569	TAG	2	6	637132	637137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320992
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14056	NC_017569	TA	3	6	637152	637157	50 %	50 %	0 %	0 %	386320992
14057	NC_017569	ATA	2	6	637174	637179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320992
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14059	NC_017569	ATGTAA	2	12	637222	637233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386320992
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14061	NC_017569	ATT	2	6	637436	637441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320993
14062	NC_017569	GAGT	2	8	637447	637454	25 %	25 %	50 %	0 %	386320993
14063	NC_017569	T	8	8	637454	637461	0 %	100 %	0 %	0 %	386320993
14064	NC_017569	GGTC	2	8	637498	637505	0 %	25 %	50 %	25 %	386320993
14065	NC_017569	CAA	2	6	637568	637573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320993
14066	NC_017569	ATA	2	6	637602	637607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_017569	TC	3	6	637673	637678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_017569	ACA	2	6	637744	637749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_017569	ACA	2	6	637790	637795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_017569	CTC	2	6	637796	637801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_017569	CAAA	2	8	637816	637823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_017569	A	6	6	637821	637826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_017569	GGC	2	6	637869	637874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_017569	GTA	2	6	637894	637899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_017569	TGG	2	6	637910	637915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14077	NC_017569	TA	3	6	637981	637986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_017569	GT	3	6	637994	637999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_017569	TCA	2	6	638024	638029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_017569	T	6	6	638062	638067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_017569	TAC	2	6	638108	638113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_017569	GGC	2	6	638265	638270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_017569	ACA	2	6	638271	638276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_017569	ATAG	2	8	638350	638357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_017569	ACG	2	6	638373	638378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14087	NC_017569	TTG	2	6	638608	638613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_017569	ACC	2	6	638712	638717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_017569	CAC	2	6	638732	638737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14090	NC_017569	GGT	2	6	638779	638784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_017569	CAA	2	6	638789	638794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_017569	CCA	2	6	638800	638805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14093	NC_017569	TAC	2	6	638934	638939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_017569	GCC	2	6	639049	639054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14095	NC_017569	CCTT	2	8	639097	639104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14096	NC_017569	TCT	2	6	639227	639232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_017569	TC	3	6	639296	639301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_017569	ACA	2	6	639369	639374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_017569	AGTA	2	8	639417	639424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_017569	TCCA	2	8	639478	639485	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14101	NC_017569	G	7	7	639567	639573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_017569	TTTTC	2	10	639606	639615	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14103	NC_017569	ATT	2	6	639719	639724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_017569	GCT	2	6	639778	639783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_017569	AT	3	6	639839	639844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_017569	CTG	2	6	639913	639918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_017569	TTA	2	6	639927	639932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_017569	TAA	2	6	639999	640004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_017569	TCC	2	6	640125	640130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_017569	CTA	2	6	640192	640197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_017569	TCGCTT	2	12	640218	640229	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_017569	GCT	2	6	640315	640320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_017569	GGA	2	6	640437	640442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_017569	C	6	6	640447	640452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14115	NC_017569	ATC	2	6	640493	640498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_017569	AT	3	6	640567	640572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_017569	TCGC	2	8	640595	640602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14118	NC_017569	ACT	2	6	640604	640609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_017569	TCC	2	6	640633	640638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_017569	GT	3	6	640739	640744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_017569	TCG	2	6	640782	640787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_017569	TTTC	2	8	640827	640834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14123	NC_017569	CGCT	2	8	640919	640926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14124	NC_017569	TGT	2	6	640945	640950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_017569	TAAAT	2	10	640973	640982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14127	NC_017569	AGGC	2	8	641035	641042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14365	NC_017569	ATTAT	2	10	651534	651543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14377	NC_017569	TCT	2	6	652077	652082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321008
14378	NC_017569	TCT	2	6	652200	652205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386321008
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