MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017569	AAC	2	6	559326	559331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_017569	TAA	2	6	559340	559345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017569	ATC	4	12	559351	559362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017569	AT	3	6	559397	559402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017569	CAAT	2	8	559447	559454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12506	NC_017569	ACC	2	6	559462	559467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_017569	A	6	6	559483	559488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017569	TAA	2	6	559507	559512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017569	AAAT	2	8	559516	559523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017569	AT	3	6	559522	559527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017569	AAT	3	9	559534	559542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017569	A	6	6	559583	559588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017569	ATA	2	6	559591	559596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017569	TAA	2	6	559609	559614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017569	ATA	2	6	559638	559643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017569	CTG	2	6	559653	559658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12517	NC_017569	ATC	2	6	559765	559770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320939
12518	NC_017569	TTTA	2	8	559771	559778	25 %	75 %	0 %	0 %	386320939
12519	NC_017569	TTTAAA	2	12	559786	559797	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12520	NC_017569	T	6	6	559885	559890	0 %	100 %	0 %	0 %	386320939
12521	NC_017569	AT	3	6	559898	559903	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12522	NC_017569	ATA	2	6	560025	560030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12523	NC_017569	ATA	2	6	560059	560064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12524	NC_017569	ACT	2	6	560125	560130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320939
12525	NC_017569	GTA	3	9	560207	560215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12526	NC_017569	T	6	6	560237	560242	0 %	100 %	0 %	0 %	386320939
12527	NC_017569	TAT	2	6	560259	560264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320939
12528	NC_017569	CCT	2	6	560282	560287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12529	NC_017569	A	6	6	560326	560331	100 %	0 %	0 %	0 %	386320939
12530	NC_017569	TA	3	6	560353	560358	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12531	NC_017569	TA	3	6	560437	560442	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12532	NC_017569	ATT	2	6	560456	560461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320939
12533	NC_017569	CAT	2	6	560511	560516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320939
12534	NC_017569	GTA	3	9	560530	560538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12535	NC_017569	TTC	2	6	560586	560591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320939
12536	NC_017569	ATA	2	6	560613	560618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12537	NC_017569	AT	3	6	560633	560638	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12538	NC_017569	TACTG	2	10	560792	560801	20 %	40 %	20 %	20 %	386320939
12539	NC_017569	CGG	2	6	560836	560841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320939
12540	NC_017569	TGG	2	6	560857	560862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12541	NC_017569	TCC	2	6	561034	561039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12542	NC_017569	TGA	2	6	561059	561064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12543	NC_017569	AAT	2	6	561111	561116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12544	NC_017569	TTA	2	6	561134	561139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320939
12545	NC_017569	CGG	2	6	561192	561197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320939
12546	NC_017569	T	6	6	561219	561224	0 %	100 %	0 %	0 %	386320939
12547	NC_017569	CT	3	6	561227	561232	0 %	50 %	0 %	50 %	386320939
12548	NC_017569	ACT	2	6	561235	561240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320939
12549	NC_017569	TG	3	6	561259	561264	0 %	50 %	50 %	0 %	386320939
12550	NC_017569	TA	3	6	561273	561278	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12551	NC_017569	TTC	2	6	561319	561324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320939
12552	NC_017569	CGT	2	6	561384	561389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12553	NC_017569	TCG	2	6	561626	561631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12554	NC_017569	TGCCGT	2	12	561819	561830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12555	NC_017569	TCG	2	6	561857	561862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12556	NC_017569	TTG	2	6	561868	561873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320939
12557	NC_017569	AGGT	2	8	561878	561885	25 %	25 %	50 %	0 %	386320939
12558	NC_017569	GTG	2	6	561917	561922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12559	NC_017569	CTGCC	2	10	561925	561934	0 %	20 %	20 %	60 %	386320939
12560	NC_017569	CCG	2	6	562106	562111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320939
12561	NC_017569	TCC	2	6	562118	562123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12562	NC_017569	ACCA	2	8	562124	562131	50 %	0 %	0 %	50 %	386320939
12563	NC_017569	CGC	2	6	562252	562257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320939
12564	NC_017569	CGC	2	6	562309	562314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320939
12565	NC_017569	GGT	2	6	562453	562458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12566	NC_017569	GGT	2	6	562546	562551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12567	NC_017569	CTG	2	6	562569	562574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12568	NC_017569	TGC	2	6	562605	562610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12569	NC_017569	TCG	2	6	562646	562651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12570	NC_017569	GGT	2	6	562714	562719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12571	NC_017569	CT	3	6	562730	562735	0 %	50 %	0 %	50 %	386320939
12572	NC_017569	ACC	2	6	562736	562741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320939
12573	NC_017569	GCC	2	6	562820	562825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320939
12574	NC_017569	GGTATA	2	12	562861	562872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12575	NC_017569	TGA	2	6	562875	562880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12576	NC_017569	ATA	2	6	562942	562947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12577	NC_017569	CGCC	2	8	562971	562978	0 %	0 %	25 %	75 %	386320939
12578	NC_017569	CTT	2	6	562983	562988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320939
12579	NC_017569	TG	4	8	563001	563008	0 %	50 %	50 %	0 %	386320939
12580	NC_017569	CGGT	2	8	563054	563061	0 %	25 %	50 %	25 %	386320939
12581	NC_017569	TCG	2	6	563156	563161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12582	NC_017569	AGT	2	6	563277	563282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12583	NC_017569	GGT	2	6	563293	563298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12584	NC_017569	ATA	2	6	563407	563412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12585	NC_017569	GTG	2	6	563468	563473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12586	NC_017569	GGT	2	6	563545	563550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320939
12587	NC_017569	AGT	2	6	563724	563729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12588	NC_017569	TGC	2	6	563744	563749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12589	NC_017569	CTCTCG	2	12	563821	563832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386320939
12590	NC_017569	GTA	2	6	563839	563844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12591	NC_017569	CCAC	2	8	563961	563968	25 %	0 %	0 %	75 %	386320939
12592	NC_017569	TGC	2	6	563988	563993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12593	NC_017569	GTC	2	6	564058	564063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12594	NC_017569	CGC	2	6	564118	564123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320939
12595	NC_017569	CCT	2	6	564155	564160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12596	NC_017569	TGA	2	6	564177	564182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12597	NC_017569	TAT	3	9	564324	564332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320939
12598	NC_017569	GCCC	2	8	564420	564427	0 %	0 %	25 %	75 %	386320939
12599	NC_017569	GGTATA	2	12	564604	564615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12600	NC_017569	AAT	2	6	564621	564626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320939
12601	NC_017569	TGA	2	6	564631	564636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12602	NC_017569	CTG	2	6	564712	564717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12603	NC_017569	CCA	2	6	564788	564793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320939
12604	NC_017569	CCT	2	6	564854	564859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12605	NC_017569	CTCGG	2	10	564860	564869	0 %	20 %	40 %	40 %	386320939
12606	NC_017569	TCC	2	6	564883	564888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12607	NC_017569	GCT	2	6	564980	564985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12608	NC_017569	C	6	6	565042	565047	0 %	0 %	0 %	100 %	386320939
12609	NC_017569	A	6	6	565189	565194	100 %	0 %	0 %	0 %	386320939
12610	NC_017569	CTC	2	6	565222	565227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320939
12611	NC_017569	GTC	2	6	565276	565281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12612	NC_017569	ATC	2	6	565322	565327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320939
12613	NC_017569	TC	3	6	565326	565331	0 %	50 %	0 %	50 %	386320939
12614	NC_017569	AT	3	6	565389	565394	50 %	50 %	0 %	0 %	386320939
12615	NC_017569	TC	3	6	565402	565407	0 %	50 %	0 %	50 %	386320939
12616	NC_017569	GTC	2	6	565448	565453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12617	NC_017569	TGA	2	6	565455	565460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320939
12618	NC_017569	GTC	2	6	565489	565494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320939
12619	NC_017569	TTTGA	2	10	565516	565525	20 %	60 %	20 %	0 %	386320939
12620	NC_017569	TTA	2	6	565571	565576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320939
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