MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017569	AAT	2	6	450275	450280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320838
10003	NC_017569	TCT	2	6	450289	450294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320838
10004	NC_017569	CAG	2	6	450303	450308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320838
10005	NC_017569	ATA	2	6	450344	450349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320838
10006	NC_017569	ATC	2	6	450371	450376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320838
10007	NC_017569	TCA	2	6	450403	450408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320838
10008	NC_017569	GCT	2	6	450430	450435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320838
10009	NC_017569	CTT	2	6	450457	450462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320838
10010	NC_017569	TAGTTT	2	12	450467	450478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386320838
10011	NC_017569	GAA	2	6	450486	450491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320838
10012	NC_017569	ATT	2	6	450521	450526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320838
10013	NC_017569	TTTTA	2	10	450558	450567	20 %	80 %	0 %	0 %	386320839
10014	NC_017569	TGG	2	6	450623	450628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320839
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10016	NC_017569	TACA	2	8	450656	450663	50 %	25 %	0 %	25 %	386320839
10017	NC_017569	CAT	2	6	450721	450726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320839
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10019	NC_017569	TCT	2	6	450843	450848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320839
10020	NC_017569	ATA	2	6	450849	450854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320839
10021	NC_017569	TGTC	2	8	451018	451025	0 %	50 %	25 %	25 %	386320839
10022	NC_017569	TTC	2	6	451028	451033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320839
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10025	NC_017569	A	6	6	451188	451193	100 %	0 %	0 %	0 %	386320839
10026	NC_017569	TCA	2	6	451326	451331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320839
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10052	NC_017569	TAATT	2	10	452565	452574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017569	AAACA	2	10	452578	452587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10054	NC_017569	ATT	2	6	452623	452628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017569	A	7	7	452647	452653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_017569	TGA	2	6	452683	452688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017569	ATA	2	6	452709	452714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_017569	TAT	2	6	452756	452761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017569	T	6	6	452784	452789	0 %	100 %	0 %	0 %	386320842
10060	NC_017569	TGA	2	6	452794	452799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320842
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10075	NC_017569	GATA	2	8	453554	453561	50 %	25 %	25 %	0 %	386320842
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10090	NC_017569	CT	3	6	454281	454286	0 %	50 %	0 %	50 %	386320842
10091	NC_017569	CATA	2	8	454318	454325	50 %	25 %	0 %	25 %	386320842
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10103	NC_017569	TTCC	2	8	454660	454667	0 %	50 %	0 %	50 %	386320843
10104	NC_017569	ACAT	2	8	454713	454720	50 %	25 %	0 %	25 %	386320843
10105	NC_017569	AAG	2	6	454733	454738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320843
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10107	NC_017569	TTA	2	6	454819	454824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017569	ATAAA	2	10	454848	454857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_017569	TAT	2	6	454863	454868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017569	AGT	2	6	454878	454883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10113	NC_017569	T	7	7	454896	454902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017569	A	7	7	454911	454917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10118	NC_017569	CGC	2	6	455284	455289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320844
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10121	NC_017569	CCA	2	6	455385	455390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320844
10122	NC_017569	TCC	2	6	455411	455416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320844
10123	NC_017569	CATA	2	8	455442	455449	50 %	25 %	0 %	25 %	386320844
10124	NC_017569	TTC	2	6	455499	455504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320844
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10233	NC_017569	ATT	2	6	459956	459961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320847
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10241	NC_017569	AATT	2	8	460442	460449	50 %	50 %	0 %	0 %	386320847
10242	NC_017569	GCT	2	6	460491	460496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320847
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10497	NC_017569	AT	3	6	470521	470526	50 %	50 %	0 %	0 %	386320858
10498	NC_017569	T	8	8	470534	470541	0 %	100 %	0 %	0 %	386320858
10499	NC_017569	TTC	2	6	470547	470552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320858
10500	NC_017569	CCT	2	6	470602	470607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320858

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