MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017560	ATT	2	6	659508	659513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082384
18003	NC_017560	CTT	2	6	659519	659524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082384
18004	NC_017560	TAT	2	6	659570	659575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082384
18005	NC_017560	CCA	2	6	659584	659589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082384
18006	NC_017560	T	6	6	659598	659603	0 %	100 %	0 %	0 %	386082384
18007	NC_017560	TTG	2	6	659721	659726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082384
18008	NC_017560	TAA	2	6	659775	659780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082384
18009	NC_017560	AT	3	6	659796	659801	50 %	50 %	0 %	0 %	386082384
18010	NC_017560	TCA	2	6	659836	659841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082384
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18012	NC_017560	TAA	2	6	659906	659911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082384
18013	NC_017560	TTTA	2	8	659946	659953	25 %	75 %	0 %	0 %	386082384
18014	NC_017560	TTC	2	6	660021	660026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082384
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18017	NC_017560	T	8	8	660122	660129	0 %	100 %	0 %	0 %	386082384
18018	NC_017560	GCT	2	6	660130	660135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082384
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18020	NC_017560	TA	3	6	660186	660191	50 %	50 %	0 %	0 %	386082384
18021	NC_017560	ATT	2	6	660339	660344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082384
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18025	NC_017560	TTA	2	6	660394	660399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_017560	TCT	2	6	660418	660423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082385
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18037	NC_017560	T	8	8	660843	660850	0 %	100 %	0 %	0 %	386082385
18038	NC_017560	TTC	2	6	660855	660860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082385
18039	NC_017560	ATG	2	6	660903	660908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082385
18040	NC_017560	ATG	2	6	660915	660920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082385
18041	NC_017560	TATC	2	8	661062	661069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18042	NC_017560	ATA	3	9	661106	661114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_017560	ATA	2	6	661149	661154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082386
18044	NC_017560	TAAA	2	8	661174	661181	75 %	25 %	0 %	0 %	386082386
18045	NC_017560	TTA	2	6	661191	661196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082386
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18047	NC_017560	TTTCT	2	10	661220	661229	0 %	80 %	0 %	20 %	386082386
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18068	NC_017560	TTTG	2	8	662042	662049	0 %	75 %	25 %	0 %	386082386
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18078	NC_017560	A	7	7	662471	662477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18081	NC_017560	TGT	2	6	662707	662712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18088	NC_017560	ATA	2	6	662856	662861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_017560	AT	4	8	662869	662876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_017560	TAA	2	6	662901	662906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_017560	ACTAA	2	10	662914	662923	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18092	NC_017560	TAT	2	6	662938	662943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_017560	CTA	2	6	662958	662963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_017560	TAC	2	6	662977	662982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_017560	AT	3	6	663018	663023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18098	NC_017560	AT	3	6	663149	663154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_017560	ATA	2	6	663163	663168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_017560	TAAT	2	8	663201	663208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_017560	TAAT	2	8	663224	663231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_017560	CTT	2	6	663255	663260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_017560	TAAT	2	8	663273	663280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_017560	ATTC	2	8	663297	663304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18105	NC_017560	TGC	2	6	663464	663469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18107	NC_017560	ATT	2	6	663500	663505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_017560	TATT	2	8	663637	663644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_017560	TAT	2	6	663677	663682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_017560	AT	3	6	663700	663705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_017560	TAC	2	6	663709	663714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18112	NC_017560	ATTAT	2	10	663746	663755	40 %	60 %	0 %	0 %	386082387
18113	NC_017560	ATC	2	6	663788	663793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082387
18114	NC_017560	TAC	2	6	663862	663867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082387
18115	NC_017560	TCA	2	6	663878	663883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082387
18116	NC_017560	ATT	2	6	663915	663920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_017560	TAATT	2	10	664012	664021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_017560	TTA	2	6	664063	664068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_017560	ATGA	2	8	664081	664088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_017560	ATTA	2	8	664107	664114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_017560	AAT	2	6	664128	664133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_017560	ATA	2	6	664156	664161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_017560	GAT	2	6	664204	664209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_017560	TA	3	6	664221	664226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_017560	T	6	6	664243	664248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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